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Caracterização das interações macromoleculares das proteínas envolvidas na síntese de selenocisteínas em escherichia coli

Processo: 12/23730-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2013
Vigência (Término): 31 de agosto de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Otavio Henrique Thiemann
Beneficiário:Vitor Hugo Balasco Serrão
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/57910-0 - Instituto Nacional de Biotecnologia Estrutural e Química Medicinal em Doenças Infecciosas - INBEQMeDI, AP.TEM
Assunto(s):Tradução
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Crio-microscopia eletrônica | interações moleculares | Selenocisteínas | Tradução | Crio-microscopia eletrônica

Resumo

O estudo de processos de tradução do código genético em proteínas desperta o interesse pelo seu papel central no metabolismo celular, em particular, o estudo da via de síntese de novos aminoácidos, como a selenocisteína e a pirrolisina, que resultam na expansão do código genético dos 20 aminoácidos tradicionais para um total de 22 aminoácidos. A selenocisteína (Sec, U) representa a principal forma biológica do elemento selênio e sua incorporação é um processo co-traducional em selenoproteínas como resposta ao códon UGA em fase e requer uma complexa maquinaria molecular. O repertório completo de genes envolvidos na via de síntese desse aminoácido em procariotos é conhecido, porém as interações moleculares entre as diferentes proteínas não é bem caracterizada. Este projeto visa à caracterização molecular e estrutural das interações entre a Selenocisteína Sintase (SELA) e Fator de Elongação específico para selenocisteínas (SELB) com ribossomo em Escherichia coli. Para isso, medidas de Anisotropia de Fluorescência e Técnicas de Microcalorimetria serão utilizadas para determinação das constantes de interação desses complexos proteicos. A fim de obter modelos estruturais, serão empregadas técnicas de Microscopia Eletrônica utilizando coloração negativa (Negative Stain) Crio-Microscopia Eletrônica de alta resolução (Crio-ME) e Espectrometria de Massa com Troca Hidrogênio/Deutério (HDEX). Os estudos propostos irão auxiliar no entendimento do mecanismo de incorporação deste aminoácido em bactérias bem como nos demais domínios da vida. (AU)

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Publicações científicas (16)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SCORTECCI, JESSICA FERNANDES; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; CHELESKI, JULIANA; TORINI, JULIANA ROBERTA; ROMANELLO, LARISSA; DEMARCO, RICARDO; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Spectroscopic and calorimetric assays reveal dependence on dCTP and two metals (Zn2+ + Mg2+) for enzymatic activity of Schistosoma mansoni deoxycytidylate (dCMP) deaminase. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1865, n. 11, A, p. 1326-1335, . (12/05532-8, 12/23730-1, 12/14223-9, 12/15777-8)
GAVA, DANIELLE; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; FERNANDES, LANA TEIXEIRA; CANTAO, MAURICIO EGIDIO; CIACCI-ZANELLA, JANICE REIS; MORES, NELSON; SCHAEFER, REJANE. Structure analysis of capsid protein of Porcine circovirus type 2 from pigs with systemic disease. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 351-357, . (12/23730-1)
BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; TORINI DE SOUZA, JULIANA ROBERTA; ROMANELLO, LARISSA; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Schistosoma mansoni Purine and Pyrimidine Biosynthesis: Structures and Kinetic Experiments in the Search for the Best Therapeutic Target. CURRENT PHARMACEUTICAL DESIGN, v. 23, n. 45, p. 6967-6983, . (12/05532-8, 12/14223-9, 12/10213-9, 12/23730-1)
DORES-SILVA, PAULO ROBERTO; RODRIGUES KIRALY, VANESSA THOMAZ; DE OLIVEIRA MORITZ, MILENE NOBREGA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; SIQUEIRA DOS PASSOS, PATRICIA MARIA; SPAGNOL, VALENTINE; TEIXEIRA, FELIPE ROBERTI; GAVA, LISANDRA MARQUES; CAUVI, DAVID MARIO; INACIO RAMOS, CARLOS HENRIQUE; et al. New insights on human Hsp70-escort protein 1: Chaperone activity, interaction with liposomes, cellular localizations and HSPA's self-assemblies remodeling. International Journal of Biological Macromolecules, v. 182, p. 772-784, . (07/05001-4, 14/16646-0, 14/07206-6, 17/26131-5, 16/25798-3, 09/54216-9, 12/50161-8, 17/07879-9, 11/23110-0, 17/07335-9, 04/08868-0, 12/23730-1)
BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; SILVA, IVAN ROSA; ALVES DA SILVA, MARCO TULIO; SCORTECCI, JSSICA FERNANDES; FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE. The unique tRNA(Sec) and its role in selenocysteine biosynthesis. Amino Acids, v. 50, n. 9, p. 1145-1167, . (11/24017-4, 16/20977-7, 13/17791-0, 12/23730-1, 10/04429-3)
TORINI, JULIANA ROBERTA; ROMANELLO, LARISSA; HELENO BATISTA, FERNANDA APARECIDA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; FAHEEM, MUHAMMAD; ZERAIK, ANA ELIZA; BIRD, LOUISE; NETTLESHIP, JOANNE; REDDIVARI, YAMINI; OWENS, RAY; et al. The molecular structure of Schistosoma mansoni PNP isoform 2 provides insights into the nucleoside selectivity of PNPs. PLoS One, v. 13, n. 9, . (12/14223-9, 12/10213-9, 12/23730-1)
TORINI, JULIANA ROBERTA; FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; ROMANELLO, LARISSA; BIRD, LOUISE E.; NETTLESHIP, JOANNE E.; OWENS, RAYMOND J.; BRANDAO-NETO, JOSE; ZERAIK, ANA ELIZA; DEMARCO, RICARDO; et al. Characterization of a Schistosoma mansoni NDPK expressed in sexual and digestive organs. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 231, . (12/14223-9, 13/20715-4, 12/10213-9, 12/23730-1)
ZERAIK, ANA ELIZA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; ROMANELLO, LARISSA; TORINI, JULIANA ROBERTA; CASSAGO, ALEXANDRE; DEMARCO, RICARDO; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Schistosoma mansoni displays an adenine phosphoribosyltransferase preferentially expressed in mature female gonads and vitelaria. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 214, p. 82-86, . (12/10213-9, 12/05532-8, 12/14223-9, 13/20715-4, 12/23730-1)
BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; ROMANELLO, LARISSA; CASSAGO, ALEXANDRE; TORINI DE SOUZA, JULIANA ROBERTA; CHELESKI, JULIANA; DEMARCO, RICARDO; BRANDAO-NETO, JOSE; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Structure and kinetics assays of recombinant Schistosoma mansoni dihydrofolate reductase. Acta Tropica, v. 170, p. 190-196, . (12/14223-9, 12/23730-1)
SCORTECCI, JESSICA F.; SERRAO, VITOR HUGO B.; FERNANDES, ADRIANO F.; BASSO, LUIS G. M.; GUTIERREZ, RAISSA F.; ARAUJO, ANA PAULA U.; NETO, MARIO O.; THIEMANN, OTAVIO H.. Initial steps in selenocysteine biosynthesis: The interaction between selenocysteine lyase and selenophosphate synthetase. International Journal of Biological Macromolecules, v. 156, p. 18-26, . (12/23730-1, 16/20977-7, 14/00206-0, 13/17791-0, 14/16005-4)
ROMANELLO, LARISSA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; TORINI, JULIANA ROBERTA; BIRD, LOUISE E.; NETTLESHIP, JOANNE E.; RADA, HEATHER; REDDIVARI, YAMINI; OWENS, RAY J.; DEMARCO, RICARDO; BRANDAO-NETO, JOSE; et al. Structural and kinetic analysis of Schistosoma mansoni Adenylosuccinate Lyase (SmADSL). Molecular and Biochemical Parasitology, v. 214, p. 27-35, . (12/05532-8, 12/14223-9, 12/23730-1)
FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; SERRAO, VITOR HUGO BALASCO; SCORTECCI, JESSICA FERNANDES; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE. Seryl-tRNA synthetase specificity for tRNA(sec) in Bacterial Sec biosynthesis. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1868, n. 8, . (16/20977-7, 12/23730-1, 14/16005-4)
ROMANELLO, LARISSA; ZERAIK, ANA ELIZA; FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; TORINI, JULIANA ROBERTA; BIRD, LOUISE E.; NETTLESHIP, JOANNE E.; RADA, HEATHER; REDDIVARI, YAMINI; OWENS, RAY J.; SERRAO, VITOR HUGO BALASCO; et al. In vitro and in vivo characterization of the multiple isoforms of Schistosoma mansoni hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferases. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 229, p. 24-34, . (12/05532-8, 12/14223-9, 13/20715-4, 12/23730-1)
GAVA, DANIELLE; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; FERNANDES, LANA TEIXEIRA; CANTAO, MAURICIO EGIDIO; CIACCI-ZANELLA, JANICE REIS; MORES, NELSON; SCHAEFER, REJANE. Structure analysis of capsid protein of Porcine circovirus type 2 from pigs with systemic disease. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 7-pg., . (12/23730-1)
SCORTECCI, JESSICA FERNANDES; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; CHELESKI, JULIANA; TORINI, JULIANA ROBERTA; ROMANELLO, LARISSA; DEMARCO, RICARDO; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Spectroscopic and calorimetric assays reveal dependence on dCTP and two metals (Zn2+ + Mg2+) for enzymatic activity of Schistosoma mansoni deoxycytidylate (dCMP) deaminase. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1865, n. 11, p. 10-pg., . (12/05532-8, 12/14223-9, 12/15777-8, 12/23730-1)
BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; DE FREITAS FERNANDES, ADRIANO; MANSOR BASSO, LUIS GUILHERME; SCORTECCI, JESSICA FERNANDES; CRUSCA JUNIOR, EDSON; LOPES CORNELIO, MARINONIO; MONSON DE SOUZA, BIBIANA; PALMA, MARIO SERGIO; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE. The Specific Elongation Factor to Selenocysteine Incorporation in Escherichia coli: Unique tRNA(Sec) Recognition and its Interactions. Journal of Molecular Biology, v. 433, n. 23, . (13/17791-0, 14/00206-0, 12/15777-8, 12/23730-1, 14/16005-4, 98/14138-2)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SERRÃO, Vitor Hugo Balasco. Caracterização das interações macromoleculares das proteínas envolvidas na síntese de selenocisteínas em Escherichia coli. 2017. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC/BT) São Carlos.

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