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Investigação de RNAs não codificadores envolvidos em controle de expressão gênica em Leishmania

Processo: 12/17025-3
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2012
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Angela Kaysel Cruz
Beneficiário:Felipe Freitas de Castro
Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Regulação da expressão gênica   Leishmania   Proteínas ribossômicas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Proteínas Ribossômicas | Regulação da expressão gênica | RNA não codificador | RNAs regulatórios | Parasitologia Molecular

Resumo

O parasito Leishmania, agente etiológico da leishmaniose, como outros tripanosomatídeos, possui controle da expressão gênica a nível pós-transcricional. Uma classe diversa de RNAs não codificadores foram identificados como fatores regulatórios no controle pós-transcricional da expressão gênica em diversos organismos, incluindo em tripanosomatídeos. Uma investigação de genes candidatos a ncRNA em L.major levou à descoberta do transcrito ODD3. Transfectantes com expressão ectópica de ODD3 têm alterações fenotípicas claras. ODD3 se localiza na região 3'UTR do gene da proteína ribossômica S16 e sua existência como transcrito independente também foi confirmada. Interessante ressaltar que dois genes, LmjF26.0880 e LmjF26.0890, transcrevem a proteína S16 mas somente no gene LmjF26.0890 encontramos o ODD3. Investigaremos o significado da presença do ncRNA ODD3 como parte do transcrito de uma das cópias do gene LmjF26.0890. Investigaremos o fenótipo de superexpressores de LmjF26.0890 e LmjF26.0880 e produziremos mutantes que tenham a sequência ODD3 nocauteada do genoma. Os mutantes gerados serão utilizados para avaliar o perfil de expressão e a localização subcelular da proteína S16, com auxílio de etiquetas distintas fusionadas com cada uma das CDSs. Complementaremos o estudo com a investigação da presença de transcritos curtos emergentes dos transcritos dos genes de proteínas ribossômicas que apresentam organização genômica similar à de S16. Em adição, investigaremos outros potenciais genes alvo do controle por ODD3. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CASTRO, FELIPE FREITAS; RUY, PATRICIA C.; ZEVIANI, KARMA NOGUEIRA; SANTOS, RAMON FREITAS; TOLEDO, JULIANO SIMOES; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Evidence of putative non-coding RNAs from Leishmania untranslated regions. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 214, p. 69-74, . (06/01252-0, 13/50219-9, 12/16749-8, 09/14184-0, 12/17025-3)

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