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Identificação das espécies de Fusarium de amostras clínicas do Hospital de Clínicas da UNICAMP através das técnicas de Microarranjo de DNA e amplificação isotérmica em ciclos (LAMP).

Processo: 11/16205-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de março de 2012
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:Plinio Trabasso
Beneficiário:Marcela de Souza
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Fusarium   Fungos filamentosos   Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos   Fungos
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:DNA microarray | Fungos filamentosos | Fusarium | Infecção em imunodeprimidos | Infecção fúngica invasiva | Fungos

Resumo

Este trabalho tem por objetivo a realização do método de "DNA microarray" para a identificação de fungos filamentosos, agentes de infecção da corrente sanguínea, isolados de pacientes com doenças onco-hematológicas atendidos no Hospital de Clínicas (HC) da UNICAMP. Os casos serão selecionados a partir de pacientes da enfermaria de hematologia do HC-UNICAMP, que atende prioritariamente pacientes com leucemias agudas e linfomas de Hodgkin e não Hodgkin, com suspeita de fungemia. As cepas de fungos filamentosos serão previamente isoladas a partir dos exames de rotina desses pacientes, realizados no Setor de Micologia do Laboratório de Microbiologia do HC-UNICAMP. Os isolados serão identificados, utilizando a combinação de características macroscópicas e micromorfológicas, e serão subcultivados e submetidos à Análise em Plataforma de Sequências de Oligonucleotídeos (DNA-microarray). A plataforma será desenvolvida na Universidade Estadual de Campinas, baseada em sequêncais de oligonucleotídeos previamente definidas e plotadas em lâmina de plásticos para os fungos filamentosos mais frequentes nesta população, a saber: Fusarium complexo solani, Fusarium oxysporum, Fusarium moniliforme, Fusarium sacchari, Fusarium glicynes, Fusarium delphinoides, Fusarium napiforme, Fusarium falciforme, Aspergillus sp, Rhizopus, Rhizomucor, Mucor, Scedosporium, Exophiala, Absidia, Cladosporium.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE SOUZA, MARCELA; MATSUZAWA, TETSUHIRO; SAKAI, KANAE; MURAOSA, YASUNORI; LYRA, LUZIA; BUSSO-LOPES, ARIANE FIDELIS; SHAFFERMAN LEVIN, ANNA SARA; SCHREIBER, ANGELICA ZANINELLI; MIKAMI, YUZURU; GONOI, TOHORU; et al. Comparison of DNA Microarray, Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) and Real-Time PCR with DNA Sequencing for Identification of Fusarium spp. Obtained from Patients with Hematologic Malignancies. Mycopathologia, v. 182, n. 7-8, p. 625-632, . (11/16205-5)
DE SOUZA, MARCELA; MATSUZAWA, TETSUHIRO; LYRA, LUZIA; BUSSO-LOPES, ARIANE FIDELIS; GONOI, TOHRU; SCHREIBER, ANGELICA ZANINELE; KAMEI, KATSUHIKO; MORETTI, MARIA LUIZA; TRABASSO, PLINIO. Fusarium napiforme systemic infection: case report with molecular characterization and antifungal susceptibility tests. SPRINGERPLUS, v. 3, . (11/16205-5)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SOUZA, Marcela de. Comparação de técnicas moleculares para identificação das espécies de fusarium de amostras clínicas. 2014. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências Médicas Campinas, SP.

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