Busca avançada
Ano de início
Entree

Bioinformática dos projetos genomas de M. perniciosa, M. roreri e C. cacaofunesta

Processo: 10/05708-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de junho de 2010
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2011
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética
Pesquisador responsável:Gonçalo Amarante Guimarães Pereira
Beneficiário:Roberto Hirochi Herai
Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:09/50119-9 - Estudo integrado e comparativo de três doenças fúngicas do cacau: vassoura-de-bruxa, monilíase e mal do facão, visando à compreensão de mecanismos de patogenicidade para o desenvolvimento de estratégias de controle, AP.TEM
Assunto(s):Biologia computacional   Vassoura-de-bruxa

Resumo

A doença Vassoura-de-bruxa do cacaueiro causada pelo fungo Moniliophthora perniciosa constitui um dos maiores problemas fitossanitários do Brasil. Devido à complexidade da doença e a falta de estratégias de controle eficientes, o laboratório de Genômica e Expressão da Unicamp começou no ano 2001 o projeto genoma de M. perniciosa. As análises do seqüenciamento permitiram direcionar pesquisas na tentativa de conhecer a biologia do fungo. Usando as novas tecnologias de seqüenciamento, 454 e Solexa, é possível gerar em semanas uma quantidade de seqüências suficiente para fechar os genomas dos fungos M. perniciosa, M. roreri e C. cacaofunesta. A parte mais trabalhosa está na etapa de montagem dos fragmentos de seqüências gerados. Este processo tem o objetivo de reconstruir a seqüência total do genoma e é realizado através de programas de bioinformática que necessitam ser executados em computadores de alto desempenho. Após a obtenção dos genomas completos das três espécies é iniciado o processo de anotação automática e manual das regiões codantes. Esta etapa é realizada através da utilização de programas de predição gênica ab-initio e comparativa. Com essa metodologia é possível encontrar todos os genes, inclusive os genes específicos de cada organismo, e através das comparações entres esses genes e banco de dados biológicos é possível inferir informações funcionais e metabólicas. A comparação dos metabolismos entre as 3 espécies e entre outras espécies de fungos seqüenciados permitirá um entendimento mais abrangente dos fungos estudados que acarretará no desenvolvimento de estratégias experimentais mais direcionadas.

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)