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Caracterização molecular de cianobactérias isoladas de manguezais do Estado de São Paulo e distribuição de cianopeptídeos

Processo: 06/01671-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2007
Vigência (Término): 30 de junho de 2010
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Marli de Fátima Fiore
Beneficiário:Caroline Souza Pamplona da Silva
Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Cianobactérias   Manguezais   Análise de sequência de DNA
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Sequenciamento | Sintase De Policetideos | Ecologia Molecular de Cianobactérias

Resumo

Este projeto de pesquisa tem como objetivo caracterizar molecularmente linhagens de cianobactérias isoladas de regiões de manguezais do Estado de São Paulo por meio do sequenciamento do gene de rRNA 16S, o qual tem sido utilizado para diferenciar geneticamente os microrganismos pertencentes ao domínio Bacteria. As seqüências obtidas serão comparadas pela análise BLAST (NCBI) e a distância evolutiva entre os nucleotídeos das linhagens sequenciadas serão analisadas por meio da construção de árvore filogenética. No mínimo cinquenta linhagens de cianobactérias deverão ser caracterizadas. Por meio da amplificação por PCR de seqüências gênicas das enzimas sintetase de peptídeo não-ribossômico (NRPS) e sintase de policetídeo (PKS) espera-se identificar entre as linhagens caracterizadas molecularmente àquelas potencialmente produtoras de compostos naturais bioquimicamente ativos (cianopeptídeos). Essas enzimas são conhecidas por estarem envolvidas na biossíntese de toxinas e antibióticos. A detecção desses genes de peptídeos não ribossômicos será realizada utilizando oligonucleotídeos iniciadores degenerados tendo como alvo seqüências conservadas das enzimas NRPS e PKS. Os produtos de PCR obtidos para essas enzimas deverão ser sequenciados. Essas seqüências também serão comparadas pela análise BLAST e suas relações evolutivas verificadas pela construção de árvore filogenética. Os cianopeptídeos produzidos pelas linhagens que apresentarem genes de NRPS e PKS serão extraídos utilizando vários solventes. Os constituintes químicos dos extratos celulares obtidos serão analisados por Q-TOF-MS (Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry) e HPLC (High Performance Liquid Chromatography). A atividade inibitória desses compostos químicos será testada contra bactérias e fungos.

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FIORE, MARLI FATIMA; GENUARIO, DIEGO BONALDO; PAMPLONA DA SILVA, CAROLINE SOUZA; SHISHIDO, TANIA KEIKO; BERALDO MORAES, LUIZ ALBERTO; CANTUSIO NETO, ROMEU; SILVA-STENICO, MARIA ESTELA. Microcystin production by a freshwater spring cyanobacterium of the genus Fischerella. Toxicon, v. 53, n. 7-8, p. 754-761, . (06/01671-2, 07/06360-8, 05/56303-5, 04/16042-5)
SILVA-STENICO, MARIA ESTELA; LORENZI, ADRIANA STURION; TESCHKE, OMAR; PAMPLONA SILVA, CAROLINE SOUZA; ETCHEGARAY, AUGUSTO; FIORE, MARLI FATIMA. Antimicrobial Cyanopeptide Action on Bacterial Cells Observed with Atomic Force Microscopy. CURRENT NANOSCIENCE, v. 9, n. 1, p. 141-148, . (06/01671-2, 09/05474-5, 10/09867-9, 03/12529-4, 08/53627-2)
PAMPLONA SILVA, CAROLINE SOUZA; GENUARIO, DIEGO BONALDO; MARCAL VIEIRA VAZ, MARCELO GOMES; FIORE, MARLI FATIMA. Phylogeny of culturable cyanobacteria from Brazilian mangroves. Systematic and Applied Microbiology, v. 37, n. 2, p. 100-112, . (06/01671-2, 10/18732-0, 10/00321-3, 04/13910-6)
SILVA-STENICO, MARIA ESTELA; PAMPLONA SILVA, CAROLINE SOUZA; LORENZI, ADRIANA STURION; SHISHIDO, TANIA KEIKO; ETCHEGARAY, AUGUSTO; LIRA, SIMONE POSSEDENTE; BERALDO MORAES, LUIZ ALBERTO; FIORE, MARLI FATIMA. Non-ribosomal peptides produced by Brazilian cyanobacterial isolates with antimicrobial activity. MICROBIOLOGICAL RESEARCH, v. 166, n. 3, p. 161-175, . (06/01671-2, 09/13455-0, 08/53627-2)
SILVA-STENICO, MARIA ESTELA; VIEIRA, FELIPE D. P.; GENUARIO, DIEGO B.; SILVA, CAROLINE S. P.; MORAES, LUIZ ALBERTO B.; FIORE, MARLI FATIMA. Decolorization of textile dyes by cyanobacteria. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 23, n. 10, p. 1863-1870, . (06/01671-2, 10/09867-9, 10/00321-3, 09/05474-5)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SILVA, Caroline Souza Pamplona da. Caracterização molecular de cianobactérias isoladas de ecossistema manguezal do Estado de São Paulo e identificação de produtos naturais. 2010. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.

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