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Cromossomos sexuais, cromossomos B e seus enigmas: sistemas modelo para estudos de evolução cromossômica e genômica

Processo: 15/16661-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de maio de 2017 - 30 de abril de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:César Martins
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Adauto Lima Cardoso ; Adriane Pinto Wasko ; Camila do Nascimento Moreira ; Danillo Pinhal ; David Ray ; Diogo Cavalcanti Cabral de Mello ; Flávia Karina Delella ; Guilherme Targino Valente ; Ivan Rodrigo Wolf ; Lígia Souza Lima Silveira da Mota ; Lucilene Delazari dos Santos ; Marcelo Ricardo Vicari ; Maria Dulcetti Vibranovski ; Michelle Orane Schemberger ; Ney Lemke ; Patricia Pasquali Parise Maltempi ; Rachel Oneill ; Renato Eugenio da Silva Diniz ; Silvia Mitiko Nishida ; Thomas David Kocher ; Vanessa Bellini Bardella ; Wagner Seixas da Silva
Bolsa(s) vinculada(s):22/02544-7 - Cromossomos B e modificações epigenéticas: como a metilação do DNA se relaciona com o estresse ambiental em Astatotilapia latifasciata, BP.IC
20/06188-5 - Conteúdo molecular, padrões de modificações epigenéticas e interferência dos cromossomos supranumerários em Drosophila melanogaster, BP.DR
19/18190-7 - Em direção a uma visão funcional de cromossomos B e sua interface com cromossomos sexuais, BP.PD
+ mais bolsas vinculadas 18/25350-8 - Desenvolvimento de marcadores genéticos para identificação do sexo de Astatotilapia latifasciata, BP.IC
18/21772-5 - Citogenômica cigarrinha praga Aetalion reticulatum (Aetalionidae: Hemiptera): análise dos DNAs repetitivos e cromossomos B, BP.PD
18/09553-6 - Análise genômica do roedor Holochilus sciureus (Cricetidae: Sigmodontinae: Oryzomyini) com ênfase na interface entre cromossomos B e sexuais, BP.PD
18/09127-7 - Efeitos de genes ativos em cromossomos B de Astatotilapia latifasciata e contribuições no entendimento da interação entre cromossomos B e sexuais, BP.IC
18/09010-2 - Análise do DNA repetitivo de Gryllus assimilis com ênfase nos cromossomos sexuais, BP.IC
18/08041-1 - O que você realmente sabe sobre genética? Uma percepção das demandas educacionais de estudantes do ensino médio, BP.IC
17/25193-7 - Atuação de piwiRNAs no silenciamento de elementos transponíveis na presença do cromossomo B de Astatotilapia latifasciata (Cichlidae), BP.DR
17/07484-4 - Cultivo celular de Astatotilapia latifasciata e montagem genômica de seu cromossomo B: contribuições ao entendimento dos efeitos de cromossomos supernumerários, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Cromossomos  Cromossomos sexuais  Citogenética  Evolução molecular  Genomas 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Chromosomes | Cytogenetics | evolution | Genome | Citogenética e Genômica

Resumo

Os cromossomos representam componentes importantes das células no empacotamento do material genético em um padrão de organização estrutural e funcional perfeito. Entretanto, o comportamento dos cromossomos durante o ciclo celular está sujeito a rearranjos genômicos produzindo uma ampla variedade de consequências funcionais com impacto em desordens celulares e também gerando novidades evolutivas. Embora diversos fatores que mediam rearranjos cromossômicos sejam conhecidos, existem ainda muitas questões sem resposta. Sob a luz da era de geração massiva de dados biológicos, os estudos cromossômicos também avançaram para um nível mais elevado, explorando análises em larga escala de DNA, RNA e proteínas, e suas redes de interação. Diante deste contexto, a presente proposta visa explorar polimorfismos cromossômicos naturalmente estabelecidos (associados a cromossomos B e cromossomos sexuais) como modelos para investigar as modificações cromossômicas e genômicas ocorridas durante o processo evolutivo. Dessa forma, os objetivos deste projeto focam na análise de sistemas de cromossomos sexuais e cromossomos B sob a luz da análise massiva de dados moleculares obtidos de diferentes modelos animais, de forma a avançar na identificação da origem e do papel das mudanças cromossômicas para compreender suas consequências evolutivas e patológicas. Adicionalmente, o projeto tem também como objetivo a divulgação científica de conhecimentos acerca dos cromossomos, sob a ótica evolutiva e funcional, como forma de diálogo entre ciência e sociedade. (AU)

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Publicações científicas (26)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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MILANI, DIOGO; RAMOS, ERICA; LORETO, VILMA; ANDREA MARTI, DARDO; CARDOSO, ADAUTO LIMA; MARTINEZ DE MORAES, KAREN CRISTIANE; MARTINS, CESAR; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO CAVALCANTI. The satellite DNA AflaSAT-1 in the A and B chromosomes of the grasshopper Abracris flavolineata. BMC GENETICS, v. 18, . (15/05246-3, 11/19481-3, 15/16661-1)
PALACIOS-GIMENEZ, OCTAVIO MANUEL; BARDELLA, VANESSA BELLINI; LEMOS, BERNARDO; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO CAVALCANTI. Satellite DNAs are conserved and differentially transcribed among Gryllus cricket species. DNA Research, v. 25, n. 2, p. 137-147, . (15/16661-1, 16/01506-3, 14/11763-8)
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MILANI, DIOGO; RUIZ-RUANO, FRANCISCO J.; CAMACHO, JUAN PEDRO M.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.. Out of patterns, the euchromatic B chromosome of the grasshopper Abracris flavolineata is not enriched in high-copy repeats. HEREDITY, v. 127, n. 5, . (14/11763-8, 15/16661-1)
AZAMBUJA, MATHEUS; NOGAROTO, VIVIANE; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; MARTINS, CESAR; SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE; VICARI, MARCELO RICARDO. Major and minor U small nuclear RNAs genes characterization in a neotropical fish genome: Chromosomal remodeling and repeat units dispersion in Parodontidae. Gene, v. 826, p. 12-pg., . (15/16661-1)
MAHADEVARAJU, SHARVANI; FEAR, JUSTIN M.; AKEJU, MIRIAM; GALLETTA, BRIAN J.; PINHEIRO, MARA M. L. S.; AVELINO, CAMILA C.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; CONLON, KATIE; DELL'ORSO, STAFANIA; DEMERE, ZELALEM; et al. Dynamic sex chromosome expression in Drosophila male germ cells. NATURE COMMUNICATIONS, v. 12, n. 1, . (15/20844-4, 17/14923-4, 17/26609-2, 15/16661-1, 13/08028-1, 19/15212-0)
CARDOSO, ADAUTO LIMA; VENTURELLI, NATALIA BORTHOLAZZI; DA CRUZ, IRENE; DE SA PATRONI, FABIO MALTA; DE MORAES, DIOGO; DE OLIVEIRA, ROGERIO ANTONIO; BENAVENTE, RICARDO; MARTINS, CESAR. Meiotic behavior, transmission and active genes of B chromosomes in the cichlid Astatotilapia latifasciata: new clues about nature, evolution and maintenance of accessory elements. Molecular Genetics and Genomics, v. 297, n. 4, p. 17-pg., . (16/03912-9, 15/16661-1, 13/25234-4, 16/07743-7, 17/07484-4, 14/15756-6)
CARMELLO, BIANCA O.; COAN, RAFAEL L. B.; CARDOSO, ADAUTO L.; RAMOS, ERICA; FANTINATTI, BRUNO E. A.; MARQUES, DIEGO F.; OLIVEIRA, ROGERIO A.; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. The hnRNP Q-like gene is retroinserted into the B chromosomes of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata. Chromosome Research, v. 25, n. 3-4, p. 277-290, . (11/03807-7, 15/16661-1, 13/04533-3)
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DULZ, THAIS APARECIDA; AZAMBUJA, MATHEUS; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO; LORSCHEIDER, CARLA ANDREA; NOLETO, RAFAEL BUENO; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; NOGAROTO, VIVIANE; DINIZ, DEBORA; AFFONSO, PAULO ROBERTO ANTUNES DE MELLO; VICARI, MARCELO RICARDO. Karyotypic Diversification in TwoMegaleporinusSpecies (Characiformes, Anostomidae) Inferred fromIn SituLocalization of Repetitive DNA Sequences. ZEBRAFISH, v. 17, n. 5, p. 333-341, . (15/16661-1)
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PINHAL, DANILLO; BOVOLENTA, LUIZ A.; MOXON, SIMON; OLIVEIRA, ARTHUR C.; NACHTIGALL, PEDRO G.; ACENCIO, MARCIO L.; PATTON, JAMES G.; HILSDORF, ALEXANDRE W. S.; LEMKE, NEY; MARTINS, CESAR. Genome-wide microRNA screening in Nile tilapia reveals pervasive isomiRs' transcription, sex-biased arm switching and increasing complexity of expression throughout development. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . (12/13450-1, 12/15589-7, 15/16661-1, 15/19176-7, 11/06465-0, 13/06864-7)
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