Auxílio à pesquisa 16/22196-2 - Hibridização genômica comparativa, Evolução cariotípica - BV FAPESP
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Uma abordagem intercontinental para a investigação da evolução cromossômica na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha). Parte II

Processo: 16/22196-2
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de março de 2017
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Marcelo de Bello Cioffi
Beneficiário:Marcelo de Bello Cioffi
Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Pesquisadores associados: Eliana Feldberg ; Luiz Antonio Carlos Bertollo ; Manolo Fernandez Perez ; Orlando Moreira Filho
Assunto(s):Hibridização genômica comparativa  Evolução cariotípica  Citogenética  Peixes  Biogeografia 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biogeografia | Citogenética de Peixes | evolução cariotípica | Hibridização genômica comparativa | Peixes | Citogenética Animal

Resumo

A ordem Osteoglossiformes possui pelo menos um representante em cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo um modelo ímpar para a integração de estudos cromossômicos e biogeográficos. Entretanto, os dados cromossômicos em Osteoglossiformes são ainda escassos e restritos a poucas espécies. O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2014/23172-4), enfocando a biogeografia e a evolução cromossômica de espécies da ordem Osteoglossiformes, representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Especificamente em relação às famílias Arapaimidae e Notopteridae, nossos resultados anteriores destacaram uma grande variação cromossômica intrafamiliar, dando abertura para investigações genômicas e populacionais avançadas, aprofundando assim o conhecimento de suas inter-relações evolutivas. Assim sendo, em continuidade ao projeto inicial, objetivamos agora estudos inéditos na família Gymnarchidae e adicionais nas famílias Notopteridae e Arapaimidae. Para tanto, serão utilizadas abordagens de Citogenética Classica (coloração convencional e bandamento C) e da Citogenética Molecular, incluindo o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas de DNA, hibridização genômica comparativa (CGH) e pintura cromossômica total (WCP) com sondas obtidas a partir de procedimentos de microdissecção cromossômica. Adicionalmente, será dado um passo significativo para a prospecção da variabilidade genética presente nas famílias investigadas pelo emprego do sequenciamento de nova geração DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing), altamente informativo e ainda inédito entre os peixes. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de pesquisadores de 05 países distintos, onde todos os 05 continentes encontram-se representados, somando esforços para a investigação que está sendo proposta e garantindo assim a sua exequibilidade. Os dados a serem obtidos constituirão uma base sólida para a continuidade dos estudos com as demais famílias de Osteoglossiformes, a fim de viabilizar uma ampla abordagem cromossômica nesta ordem, sua organização e diversificação genômica e sua biodiversidade. O modelo investigativo propiciado por este grupo, associado à sua ampla distribuição geográfica e à sua posição basal na filogenia dos peixes, fazem dele um importante objeto para estudos sistemáticos e evolutivos, possibilitando dimensionar o impacto da fragmentação dos continentes na sua história evolutiva, evidenciada ao nível de sua constituição cromossômica. (AU)

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Publicações científicas (10)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
XU, DONGDONG; MOLINA, WAGNER FRANCO; YANO, CASSIA FERNANDA; ZHANG, YURONG; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; LOU, BAO; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. Comparative cytogenetics in three Sciaenid species (Teleostei, Perciformes): evidence of interspecific chromosomal diversification. MOLECULAR CYTOGENETICS, v. 10, . (16/22196-2)
HATANAKA, TERUMI; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL A.; RAB, PETR; YANO, CASSIA F.; BERTOLLO, LUIZ A. C.; EZAZ, TARIQ; ILESANMI JEGEDE, OLADELE OLADELE; LIEHR, THOMAS; OLALEYE, VICTOR F.; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. First chromosomal analysis in Gymnarchus niloticus (Gymnarchidae: Osteoglossiformes): insights into the karyotype evolution of this ancient fish order. Biological Journal of the Linnean Society, v. 125, n. 1, p. 83-92, . (16/22196-2)
BARBY, FELIPE FAIX; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; YANO, CASSIA FERNANDA; HATANAKA, TERUMI; RAB, PETR; SEMBER, ALEXANDR; EZAZ, TARIQ; ARTONI, ROBERTO FERREIRA; LIEHR, THOMAS; et al. Emerging patterns of genome organization in Notopteridae species (Teleostei, Osteoglossiformes) as revealed by Zoo-FISH and Comparative Genomic Hybridization (CGH). SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . (16/22196-2)
CIOFFI, MARCELO DE BELLO; YANO, CASSIA FERNANDA; SEMBER, ALEXANDR; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO. Chromosomal Evolution in Lower Vertebrates: Sex Chromosomes in Neotropical Fishes. GENES, v. 8, n. 10, . (16/22196-2)
DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; RAB, PETR; EZAZ, TARIQ; YANO, CASSIA FERNANDA; HATANAKA, TERUMI; JEGEDE, OLADELE ILESANMI; TANOMTONG, ALONGKLOD; LIEHR, THOMAS; SEMBER, ALEXANDR; et al. Cytogenetics, genomics and biodiversity of the South American and African Arapaimidae fish family (Teleostei, Osteoglossiformes). PLoS One, v. 14, n. 3, . (16/22196-2, 17/16328-6)
SAENJUNDAENG, PASAKORN; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; TANOMTONG, ALONGKLOD; SUPIWONG, WEERAYUTH; PHIMPHAN, SUMALEE; COLLARES-PEREIRA, MARIA JOAO; SEMBER, ALEXANDR; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; LIEHR, THOMAS; et al. Chromosomes of Asian cyprinid fishes: cytogenetic analysis of two representatives of small paleotetraploid tribe Probarbini. MOLECULAR CYTOGENETICS, v. 11, . (16/22196-2)
BARBY, FELIPE FAIX; RAB, PETR; LAVOUE, SEBASTIEN; EZAZ, TARIQ; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; KILIAN, ANDRZEJ; MARUYAMA, SANDRA REGINA; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; ARTONI, ROBERTO FERREIRA; SANTOS, MATEUS HENRIQUE; et al. From Chromosomes to Genome: Insights into the Evolutionary Relationships and Biogeography of Old World Knifefishes (Notopteridae; Osteoglossiformes). GENES, v. 9, n. 6, . (16/22196-2, 17/16328-6)
GETLEKHA, NUNTAPORN; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; MANEECHOT, NUNTIYA; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; SUPIWONG, WEERAYUTH; TANOMTONG, ALONGKLOD; MOLINA, WAGNER FRANCO. Contrasting Evolutionary Paths Among Indo-Pacific Pomacentrus Species Promoted by Extensive Pericentric Inversions and Genome Organization of Repetitive Sequences. ZEBRAFISH, v. 15, n. 1, p. 45-54, . (16/22196-2)
FERREIRA, MILENA; GARCIA, CAROLINE; MATOSO, DANIELE A.; DE JESUS, ISAC S.; CIOFFI, MARCELO DE B.; BERTOLLO, LUIZ A. C.; ZUANON, JANSEN; FELDBERG, ELIANA. The Bunocephalus coracoideus Species Complex (Siluriformes, Aspredinidae). Signs of a Speciation Process through Chromosomal, Genetic and Ecological Diversity. FRONTIERS IN GENETICS, v. 8, . (16/22196-2)
CIOFFI, MARCELO DE BELLO; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; RAB, PETR; SEMBER, ALEXANDR; MOLINA, WAGNER FRANCO; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO. Conventional Cytogenetic Approaches-Useful and Indispensable Tools in Discovering Fish Biodiversity. CURRENT GENETIC MEDICINE REPORTS, v. 6, n. 4, p. 11-pg., . (16/22196-2, 16/21411-7)

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