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Estudos estruturais acerca do trocador de Na+/Ca2+ e de proteínas do vírus Zika por espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear em solução

Processo: 16/07490-1
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2016 - 31 de agosto de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Roberto Kopke Salinas
Beneficiário:Roberto Kopke Salinas
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados: Simona Tomaselli
Assunto(s):Vírus Zika  Ressonância magnética nuclear 

Resumo

O objetivo deste projeto de pesquisa é dar continuidade a estudos estruturais e mecanísticos acerca do trocador de Na+/Ca2+ (NCX) utilizando para isso Ressonância Magnética Nuclear (RMN) em solução. O NCX é um dos principais mecanismos de extrusão de Ca2+ intracelular em células cardíacas. Além de transportar Na+ e Ca2+, o NCX também é regulado por estes íons. O NCX é uma proteína grande, com cerca de 950 amino ácidos que formam um grande domínio transmembranar, domínios citosólicos e regiões desordenadas. Este caráter multifacetado faz com que a caracterização estrutural do NCX seja uma tarefa difícil. Com base em estudos de RMN dos domínios solúveis do NCX de Drosophila melanogaster, CALX, propusemos um modelo para o mecanismo de regulação alosterica do NCX e do CALX (Abiko et al. (2016) Proteins. doi:10.1002/prot.25003). Esta proposta pretende dar continuidade a estes estudos, e iniciar a caracterização estrutural das porções transmembranares necessária para testar diferentes aspectos do modelo. Além disso, pretende-se estudar proteínas do vírus da Zika que desempenham papel essencial nos mecanismos de entrada e replicação do vírus nas células. As proteínas de interesse são a glicoproteína do envelope (E), a proteína NS1 que interage com o sistema imune, e NS2B-NS3pro, a protease do vírus. Se houver tempo, pretende-se utilizar técnicas de transferência de saturação (STD) para testar diferentes ligantes que possam funcionar como inibidores de entrada do vírus ou replicação. Espera-se que estes estudos contribuam para uma maior compreensão da biologia e patogenicidade deste vírus, e para o desenvolvimento de drogas antivirais de amplo espectro no futuro. (AU)

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Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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SARAIVA, G. K. V.; DE SOUZA, V. V.; COUTINHO DE OLIVEIRA, L.; NORONHA, M. L. C.; MASINI, J. C.; CHAIMOVICH, H.; SALINAS, R. K.; FLORENZANO, F. H.; CUCCOVIA, I. M.. Characterization of PMMA-b-PDMAEMA aggregates in aqueous solutions. COLLOID AND POLYMER SCIENCE, v. 297, n. 4, p. 557-569, . (13/08166-5, 16/07490-1)
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