Carbapenemases novas ou emergentes e seu contexto genético em Acinetobacter spp. e Pseudomonas aeruginosa

Resumo

Acinetobacter spp. e Pseudomonas aeruginosa são importantes agentes de infecções relacionadas à assistência à saúde em todo o mundo. O tratamento empírico de infecções graves causadas por esses agentes usualmente inclui os carbapenêmicos. Essa terapia, se inadequada, está relacionada a um aumento significativo da mortalidade. A utilização de métodos rápidos para detecção precoce da resistência aos carbapenêmicos pode potencialmente contribuir para a redução dessa mortalidade. A resistência aos carbapenêmicos pode ocorrer por alteração do alvo, permeabilidade reduzida ou produção de carbapenemases, sendo este último o mecanismo mais eficiente. Em estudo recente de prevalência de carbapenemases, nosso grupo evidenciou que dentre 119 isolados de P. aeruginosa, 42 (35,3%) foram capazes de degradar o imipenem em ensaio de hidrólise em espectrofotômetro, mas apenas 17 (14,3%) foram positivos para genes de carbapenemases conhecidos, em sua maioria blaSPM-1. Esses achados sugerem a presença de novas carbapenemases em 25 desses isolados. Além disso, quando avaliados por ERIC-PCR, esses isolados apresentaram perfis distintos. O mesmo estudo de nosso grupo evidenciou que dentre 113 isolados de Acinetobacter, 91 (80,5%) foram capazes de degradar o imipenem em ensaio de hidrólise em espectrofotômetro. Em 66 isolados foi detectado o gene blaOXA-51, mas a variação da absorbância durante análise da atividade de hidrólise do imipenem, utilizando as mesmas condições experimentais para todos os isolados, evidenciou uma grande variabilidade: de 0,123 a 0,825. Em um isolado de Acinetobacter baumanii que alberga os genes blaOXA-51 e blaOXA-143, a variação de absorbância foi de 0,275. Considerando este limiar, aventamos a possibilidade de que isolados com valores iguais ou maiores que este e nos quais foi detectado apenas o gene blaOXA-51 possam albergar outros genes de carbapenemases. Desse conjunto, 16 isolados apresentam perfis distintos, quando avaliados por ERIC-PCR.Um grupo emergente de carbapenemases em Acinetobacter são as NDMs. Durante o período de janeiro de 2014 a março de 2016, foram detectados cinco casos autóctones de colonização por Acinetobacter produtores de NDM-1 nos mesmos 11 hospitais de São Paulo, nos quais foi realizado o estudo de frequência de carbapenemases em P. aeruginosa e Acinetobacter, por nosso grupo: A. radioresistens, A. ursingii, A. johnsonii, A. junii e A. pittii. Os isolados foram detectados em culturas de swab retal de pacientes internados. Ainda não há relato no Brasil sobre a detecção de NDM-1 nessas quatro primeiras espécies e curiosamente, os dois primeiros isolados foram detectados antes que houvesse a detecção de enterobactérias produtoras dessa carbapenemase em pacientes da cidade de São Paulo.A caracterização de novos genes de carbapenemases é fundamental para que sua detecção possa ser realizada utilizando-se testes moleculares rápidos, a exemplo da PCR em tempo real, permitindo ajuste terapêutico mais precoce. Tratando-se de mecanismo de resistência emergente, a caracterização do contexto genético de NDM-1 é de grande importância para o entendimento de seu potencial de disseminação em São Paulo. Este projeto visa à caracterização do contexto genético de carbapenemases novas ou emergentes em P. aeruginosa e Acinetobacter utilizando sequenciamento de última geração, clonagem, hibridização e avaliação do perfil de hidrólise. (AU)