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ESTUDOS ESTRUTURAIS E CARACTERIZAÇÃO DE PROTEÍNAS POR CRISTALOGRAFIA DE RAIOS-X E RESSONÂNCIA MAGNETICA NUCLEAR. Investigações estruturais e biofísicas dos mecanismos moleculares de proteínas funcionais

Processo: 15/13765-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de novembro de 2015 - 31 de maio de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Raghuvir Krishnaswamy Arni
Beneficiário:Raghuvir Krishnaswamy Arni
Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia estrutural  Cristalografia de proteínas  Cristalografia 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biologia Estrutural | Cristalografia de Proteínas | estrutura e função | Cristalografia

Resumo

Este projeto de pesquisa colaborativa tem como tema central primário a expressão, caracterização e a determinação das estruturas cristalográficas de enzimas selecionadas.A cristalografia fornece imagens precisas das estruturas tridimensionais das macromoléculas biológicas em nível atômico, que é insuperável por qualquer outra técnica em seu grau de detalhe e precisão. Os modelos estruturais ajudam a elucidar mecanismos enzimáticos e a compreender os processos bioquímicos complexos inerentes à vida e à biotecnologia e sugerir modificações estruturais para inibir o funcionamento de moléculas que desencadeiam ou atenuam doenças e enfermidades ou para melhorar o desempenho das enzimas. As técnicas de Ressonância MagnéticaNuclear fornecem dados estruturais complementares e serão empregadas para determinar os modos de ligação e inibição destas enzimas. (AU)

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Publicações científicas (13)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; TASIC, LJUBICA; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Biochemical and biophysical characterization of a mycoredoxin protein glutaredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 107, n. B, p. 1999-2007, . (16/08104-8, 15/13765-0, 15/18868-2, 09/53989-4, 16/12904-0)
BHAT, SHREESHA K.; JOSHI, MANJUNATH B.; ULLAH, ANWAR; MASOOD, REHANA; BILIGIRI, SETLUR G.; ARNI, RAGHUVIR K.; SATYAMOORTHY, KAPAETTU. Serine proteinases from Bothrops snake venom activates PI3K/Akt mediated angiogenesis. Toxicon, v. 124, p. 63-72, . (15/13765-0)
EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DO AMARAL, MARCOS S.; TASIC, LJUBICA; AMI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Inhibition of thioredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis by polyanions and flavonoids. International Journal of Biological Macromolecules, v. 117, p. 1066-1073, . (09/53989-4, 15/18868-2, 16/08104-8, 15/13765-0, 16/12904-0)
GREMSKI, LUIZA HELENA; DA JUSTA, HANNA CAMARA; DA SILVA, THAIS PEREIRA; POLLI, NAYANNE LOUISE COSTACURTA; ANTUNES, BRUNO CESAR; MINOZZO, JOAO CARLOS; WILLE, ANA CAROLINA MARTINS; SENFF-RIBEIRO, ANDREA; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY; VEIGA, SILVIO SANCHES. Forty Years of the Description of Brown Spider Venom Phospholipases-D. TOXINS, v. 12, n. 3, . (15/13765-0, 15/18868-2)
PEINADO, RAFAELA DOS S.; OLIVIER, DANILO S.; EBERLE, RAPHAEL J.; DE MORAES, FABIO R.; AMARAL, MARCOS S.; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Binding studies of a putative C. pseudotuberculosis target protein from Vitamin B-12 Metabolism. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . (09/53989-4, 15/18868-2, 16/08104-8, 15/13765-0, 16/12904-0)
DA SILVA, THAIS PEREIRA; DE CASTRO, FERNANDO JACOMINI; VUITIKA, LARISSA; POLLI, NAYANNE LOUISE COSTACURTA; ANTUNES, BRUNO CESAR; BOIA-FERREIRA, MARIANNA; MINOZZO, JOAO CARLOS; MARIUTTI, RICARDO BARROS; MATSUBARA, FERNANDO HITOMI; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY; et al. Brown Spiders' Phospholipases-D with Potential Therapeutic Applications: Functional Assessment of Mutant Isoforms. BIOMEDICINES, v. 9, n. 3, . (15/18868-2, 15/13765-0)
EBERLE, RAPHAEL J.; KAWAI, LIEGE A.; DE MORAES, FABIO R.; TASIC, LJUBICA; ARNI, RAGHUVIR K.; CORONADO, MONIKA A.. Biochemical and biophysical characterization of a mycoredoxin protein glutaredoxin A1 from Corynebacterium pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 107, p. 9-pg., . (09/53989-4, 15/13765-0, 16/08104-8, 15/18868-2, 16/12904-0)
CORONADO, MONIKA APARECIDA; OLIVIER, DANILO DA SILVA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; DO AMARAL, MARCOS SERROU; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Modeling and molecular dynamics indicate that snake venom phospholipase B-like enzymes are Ntn-hydrolases. Toxicon, v. 153, p. 106-113, . (16/08104-8, 16/12904-0, 15/18868-2, 09/53989-4, 15/13765-0)
MARIUTTI, RICARDO B.; HERNANDEZ-GONZALEZ, JORGE E.; NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; DE MORAIS, MARIANA A. B.; MURAKAMI, MARIO T.; CARARETO, CLAUDIA M. A.; ARNI, RAGHUVIR K.. A single P115Q mutation modulates specificity in the Corynebacterium pseudotuberculosis arginine repressor. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1864, n. 7, . (18/07977-3, 15/13765-0, 16/19995-0, 15/18868-2, 18/10736-8, 16/24587-9)
BHAT, SHREESHA K.; JOSHI, MANJUNATH B.; VASISHTA, SAMPARA; JAGADALE, RAJESH N.; BILIGIRI, SETLUR G.; CORONADO, MONIKA A.; ARNI, RAGHUVIR K.; SATYAMOORTHY, KAPAETTU. P-I metalloproteinases and L-amino acid oxidases from Bothrops species inhibit angiogenesis. Journal of Venomous Animals and Toxins including Tropical Diseases, v. 27, . (15/13765-0)
LOPES, TAIRINE ZARA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; TEDESCO, ANTONIO CLAUDIO; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY; RAHAL, PAULA; CALMON, MARILIA FREITAS. Berberine associated photodynamic therapy promotes autophagy and apoptosis via ROS generation in renal carcinoma cells (vol 123, 109794, 2020). BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY, v. 125, p. 1-pg., . (14/22198-0, 15/13765-0, 15/16660-5)
CORONADO, MONIKA APARECIDA; EBERLE, RAPHAEL JOSEF; BLEFFERT, NICOLE; FEUERSTEIN, SOPHIE; OLIVIER, DANILO SILVA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; WILLBOLD, DIETER; ARNI, RAGHUVIR KRISHNASWAMY. Zika virus NS2B/NS3 proteinase: A new target for an old drug - Suramin a lead compound for NS2B/NS3 proteinase inhibition. Antiviral Research, v. 160, p. 118-125, . (16/08104-8, 15/13765-0, 15/18868-2, 09/53989-4, 16/12904-0)
EBERLE, RAPHAEL J.; CORONADO, MONIKA A.; PEINADO, RAFAELA S.; DE MORAES, FABIO R.; OLIVIER, DANILO; DREYER, THIAGO; LOPES, DEBORA DE OLIVEIRA; ROSA DA LUZ, BRENDA SILVA; AZEVEDO, VASCO; ARNI, RAGHUVIR K.. The polyanions heparin and suramin impede binding of free adenine to a DNA glycosylase from C. pseudotuberculosis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 125, p. 459-468, . (09/53989-4, 15/18868-2, 16/08104-8, 15/13765-0, 16/12904-0)

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