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Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular

Processo: 14/11572-8
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de maio de 2015 - 30 de junho de 2020
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
Beneficiário:Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores principais:
Chong Ae Kim
Pesquisadores associados:Ana Beatriz Alvarez Perez ; Carolina de Oliveira Gigek ; Diego Robles Mazzotti ; Gianna Maria Griz Carvalheira ; Janete Maria Cerutti ; Leslie Domenici Kulikowski ; Sang Won Han ; Síntia Iole Nogueira Belangero ; Taiza Stumpp Teixeira ; Vera de Freitas Ayres Meloni ; Vera Lúcia Gil da Silva Lopes
Auxílios(s) vinculado(s):19/21379-4 - História natural de um homem 46,XX DSD ovotesticular devido a uma nova deleção de 3-Mb em 15q26.2 contendo o gene NR2F2., PUB.ART
18/26129-3 - Estudo Multicêntrico Brasileiro de Investigação de CNV em Pacientes com Anomalias Congênitas e Deficiência Intelectual., PUB.ART
Bolsa(s) vinculada(s):19/26175-8 - Investigação de mecanismos de formação de rearranjos intracromossômicos e sua relação com o fenótipo, BP.MS
18/20618-2 - Busca por modificadores genéticos para alterações cardíacas na Síndrome da Deleção 22q11.2, BP.DR
18/20633-1 - Investigação da propagação da inativação do cromossomo X para sequências autossômicas em indivíduos com translocações X-autossomo não equilibradas, BP.MS
+ mais bolsas vinculadas 19/07803-8 - Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular, BP.IC
19/00169-1 - Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular, BP.PD
18/11994-0 - Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular, BP.PD
18/08169-8 - Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular, BP.IC
16/22860-0 - Investigação da reorganização da cromatina em translocações X-autossomo equilibradas e sua influência no fenótipo, BP.DR
17/07369-0 - Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular, BP.IC
16/25556-0 - Investigação dos mecanismos patogênicos em mulheres com translocações X-autossomo equilibradas, BP.TT
16/18781-7 - Variantes patogênicas e alteração da expressão em genes candidatos ao espectro óculo-aurículo-vertebral (OAVS), BP.MS
14/26768-5 - Investigação de pacientes com a síndrome da deleção 22q11.2: Perfil de expressão gênica e avaliação de elementos de regulação., BP.DR
16/16075-8 - Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular, BP.IC
16/09802-0 - Consequências dos desequilíbrios genômicos e investigação dos mecanismos de formação em pacientes com anomalias congênitas e deficiência intelectual, BP.PD
15/08686-4 - Rearranjos cromossômicos e sua importância na etiologia das doenças genéticas: investigação citogenômica e molecular, BP.IC - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Cromossomos  Expressão gênica  Fenótipo  Genes  Genética médica  Citogenética 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Citogenômica | cromossomos | expressão gênica | fenótipo | genes | Genética Humana

Resumo

Um dos maiores desafios aos geneticistas é a compreensão da base genética das variações fenotípicas e de suas implicações para as doenças humanas. O estudo de rearranjos cromossômicos constitui uma abordagem eficiente para a investigação das consequências de deleções, duplicações e rupturas de genes, bem como para a identificação da função desses. O presente trabalho abrange três subprojetos. Subprojeto 1: Em mulheres com translocações equilibradas X-autossomo, cujos pontos de quebra foram previamente determinados por array painting, serão estabelecidas linhagens celulares linfoblastoides para estudos da reorganização da cromatina no núcleo interfásico e para estudos funcionais. Dois genes rompidos nessas pacientes serão analisados em detalhe: (a) O gene AMMECR1, de função desconhecida, cuja expressão gênica será avaliada em embriões de camundongos, em linhagens de células tronco, bem como em linhagens linfoblastoides da paciente e de indivíduo controle, com e sem silenciamento gênico, e (b) O gene quimérico IL1RAPL1-ZNF61, cuja estrutura e consequências serão investigadas. Subprojeto 2: Em pacientes com a síndrome da deleção 22q11.2, com perdas genômicas de diferentes tamanhos, será analisado o perfil da expressão de genes e microRNAs, além da investigação de variantes alélicas dos genes em hemizigose. Subprojeto 3: Em pacientes com anomalias congênitas e deficiência intelectual, serão investigados os desequilíbrios citogenômicos, os pontos de quebra dos rearranjos estruturais, bem como a correlação dos desequilíbrios com o fenótipo dos pacientes. Os resultados obtidos nos três subprojetos permitirão um melhor entendimento da etiologia dos quadros clínicos, do papel dos genes envolvidos na variabilidade fenotípica e dos mecanismos moleculares envolvidos na formação das alterações citogenômicas. (AU)

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Publicações científicas (24)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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ZAMARIOLLI, MALU; BURSSED, BRUNA; MOYSES-OLIVEIRA, MARIANA; COLOVATI, MILENY; BELLUCCO, FERNANDA TEIXEIRA DA SILVA; DOS SANTOS, LEONARDO CAIRES; ALVAREZ PEREZ, ANA BEATRIZ; BRAGAGNOLO, SILVIA; MELARAGNO, MARIA ISABEL. Novel MYT1 variants expose the complexity of oculo-auriculo-vertebral spectrum genetic mechanisms. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 185, n. 7, . (14/11572-8, 11/23794-7)
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FAVILLA, BIANCA PEREIRA; MELONI, VERA AYRES; PEREZ, ANA BEATRIZ; MORETTI-FERREIRA, DANILO; DE SOUZA, DEISE HELENA; BELLUCCO, FERNANDA TEIXEIRA; MELARAGNO, MARIA ISABEL. Spread of X-chromosome inactivation into autosomal regions in patients with unbalanced X-autosome translocations and its phenotypic effects. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 185, n. 8, p. 2295-2305, . (14/11572-8, 19/21644-0)
CERONI, J. R. M.; DUTRA, R. L.; HONJO, R. S.; LLERENA, JR., J. C.; ACOSTA, A. X.; MEDEIROS, P. F. V.; GALERA, M. F.; ZANARDO, E. A.; PIAZZON, F. B.; DIAS, A. T.; et al. A Multicentric Brazilian Investigative Study of Copy Number Variations in Patients with Congenital Anomalies and Intellectual Disability. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . (09/53105-9, 09/53864-7, 14/11572-8, 08/58238-4, 12/25247-6)
VICTÓRIA CABRAL SILVEIRA MONTEIRO DE GODOY; FERNANDA TEIXEIRA BELLUCCO; MILENY COLOVATI; HÉLIO RODRIGUES DE OLIVEIRA-JUNIOR; MARIANA MOYSÉS-OLIVEIRA; MARIA ISABEL MELARAGNO. Copy number variation (CNV) identification, interpretation, and database from Brazilian patients. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 4, . (14/11572-8)
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