Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA

Processo:	02/13283-6
Modalidade de apoio:	Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência:	01 de julho de 2004 - 31 de agosto de 2008
Área do conhecimento:	Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular

Pesquisador responsável:	Sergio Verjovski Almeida
Beneficiário:	Sergio Verjovski Almeida

Instituição Sede:	Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil

Pesquisadores principais:	Aline Maria da Silva ; Eduardo Moraes Rego Reis

Bolsa(s) vinculada(s):	07/56390-0 - Caracterização funcional de longos RNAs totalmente intrônicos não-codificadores (TiN RNAs) em processos celulares relacionados à tumorigênese, BP.DD 06/56919-9 - Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificantes em linhagens celulares e tecidos tumorais humanos utilizando hibridização "in situ", BP.DD 07/50323-0 - Caracterização do efeito de andrógeno sobre transcritos intrônicos em câncer de próstata, BP.DD + mais bolsas vinculadas 06/57605-8 - Biogênese dos RNAs intrônicos e seu envolvimento na regulação do splicing de éxons de genes codificadores de proteína, BP.PD 06/58761-3 - Identificação e perfis de expressão de RNAs codificadores e não codificadores de proteína como preditores de recorrência de câncer de próstata, BP.DD 06/55889-9 - Caracterização funcional de longos RNAs antisenso intrônicos em processos celulares relacionados à tumorigênese, BP.PD 06/56497-7 - Caracterização funcional de transcritos intrônicos envolvidos em câncer humano, BP.PD 06/52809-4 - Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA, BP.TT 05/50464-7 - Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA, BP.TT 04/12367-7 - Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA, BP.TT 04/03043-3 - Análise da expressão gênica e de transcritos antissenso intrônicos em tumores de próstata, mama e rim, BP.PD 02/02689-1 - Identificação e caracterização de candidatos a marcadores tumorais de próstata, BP.DD 00/04906-4 - Análise da expressão gênica diferencial em tumores de pulmão e próstata utilizando micro-arrays de DNA, BP.PD - menos bolsas vinculadas

Assunto(s):	Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Genomas Neoplasias Marcador molecular Diagnóstico clínico Prognóstico
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:	Cancer \| Dna Microarray \| Genoma Funcional
Publicação FAPESP:	https://www.fapesp.br/tematicos/saude_almeida.pdf

Resumo

A presente proposta é um desdobramento do projeto CAGE - Cooperation for Analysis of Gene Expression. e pretende avançar na caracterização de marcadores de prognóstico em câncer através da associação com grupos clínicos que possuem acesso a um grande número de amostras de pacientes bem acompanhados, para os quais se conhece a evolução clínica. Um importante avanço está relacionado ao fato de que os grupos clínicos agora envolvidos, do Hospital Sírio Libanês de SP, e do Hemocentro da Unicamp de Campinas. têm experiência demonstrada no estudo de diferentes sub-tipos de câncer de próstata, de rim. leucemias e linfomas. Estes grupos já possuem um banco de tumores com centenas de amostras de tecido fresco preservadas por congelamento, um número de pacientes bem maior do que o encontrado até hoje nos trabalhos da literatura que utilizaram a tecnologia de microarrays de DNA no estudo do câncer. Além disso, estes grupos dispõem das informações clínicas e patológicas com acompanhamento Que remete há até 5 anos atrás, e Que são de reconhecido valor prognóstico. (AU)

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Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LOURO‚ R.; NAKAYA‚ H.; AMARAL‚ P.; FESTA‚ F.; SOGAYAR‚ M.; DA SILVA‚ A.; VERJOVSKI-ALMEIDA‚ S.; REIS‚ E.. Androgen responsive intronic non-coding RNAs. BMC Biology, v. 5, n. 1, p. 4, 2007. (01/10707-7, 02/13283-6)

BRITO, GLAUBER COSTA; FACHEL, ANGELA A.; VETTORE, ANDRE LUIZ; VIGNAL, GISELLE M.; GIMBA, ETEL R. P.; CAMPOS, FRANZ S.; BARCINSKI, MARCELLO A.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO; REIS, EDUARDO M.. Identification of protein-coding and intronic noncoding RNAs down-regulated in clear cell renal carcinoma. Molecular Carcinogenesis, v. 47, n. 10, p. 757-767, Oct. 2008. (02/13283-6)

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Patente(s) depositada(s) como resultado deste projeto de pesquisa

MÉTODO DE IDENTIFICAÇÃO DE GENES QUE SE ENCONTRAM NOS ÍNTRONS PRESENTES EM DNA DE CROMOSSOMOS HUMANOS PI0401911-3 - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) ; Universidade de São Paulo (USP) . Sergio Verjovski-Almeida ; Eduardo Moraes Rego Reis ; Aline Maria da Silva - 04 de junho de 2004

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