Biomarcadores baseados em genômica e epigenômica que auxiliem na detecção precoce e monitoramento dos pacientes com câncer colorretal

Resumo

O câncer colorretal (CCR) é uma doença causada por alterações genéticas. No entanto, existe atualmente um interesse crescente em explorar como as variações não genéticas, como os fatores epigenéticos, poderiam influenciar na etiologia de doenças complexas, como o câncer, principalmente mudanças envolvendo a metilação do DNA. Hoje em dia alterações na expressão genica dependentes de metilação do DNA demonstram contribuir com eventos típicos do câncer, silenciando, por exemplo, genes supressores tumorais. Embora a base genética completa para qualquer doença complexa humana ainda não seja conhecida, o re-sequenciamento de genomas e epigenomas inteiros é uma promessa para identificar as causas restantes de variações genéticas envolvidas em doenças como o câncer. Objetivo: Analisar alterações epigenéticas (metilação do DNA) de todo o genoma humano nos CCRs. Analisar o perfil de mutação genética dos genes KRAS, BRAF e PIK3CA buscando formações de painéis genéticos juntamente com epigenéticos que auxiliem na classificação do tumor. Casuística: Será realizado um estudo caso-controle onde os pacientes serão convidados a participar do estudo logo após a internação no Hospital São Paulo, com indicação cirúrgica para ressecção do tumor. Farão parte do estudo 50 pacientes com CCR submetidos a procedimento cirúrgico. Será estudado o tumor colorretal e a mucosa normal adjacente ao tumor. Método: O DNA será extraído do tecido utilizando kits comerciais específicos. O DNA será tratado com bissulfito de sódio utilizando o kit específico para metilação do DNA (Cells-to-CpGTM Bisulfite Conversion Kit Reagents® - Applied Biosystems). A análise de metilação será realizada utilizando a tecnologia Infinium Human Methylation 450 BeadChip (Illumina Inc.), A pesquisa de mutações nos genes KRAS, BRAF e PIK3CA será realizada com o Kit desenvolvido pela RANDOX®. (AU)