Auxílio à pesquisa 11/23110-0 - Proteínas, Mapeamento de interação de proteínas - BV FAPESP
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Uso da calorimetria de titulação isotérmica para a determinação de propriedades termodinâmicas de interação de proteína-ligante e proteína-proteína

Resumo

A interação proteína-ligante ou proteína-proteína é um dos principais eventos para a regulação e para a atividade proteica, sendo responsável pela inibição ou ativação enzimática; por mudanças conformacionais nas proteínas para a sinalização celular; transporte e armazenamento de substâncias; etc. Poucas técnicas experimentais permitem estudar estes tipos de interações em solução fornecendo um amplo espectro de informações termodinâmicas como a calorimetria de titulação isotérmica (ITC). Esta técnica usa o calor, uma sonda universal, para derivar informações como estequiometria da interação, entalpia da interação, constante de afinidade (e variação da energia livre) e entropia da interação. Além destas informações, experimentos de ITC em diferentes temperaturas permitem obter a variação da capacidade calorífica da interação. Estas informações em conjunto fornecem uma "assinatura termodinâmica" da interação que pode auxiliar na compreensão do mecanismo de interação envolvido em nível molecular, principalmente com o auxílio de informações estruturais obtidas por outras técnicas. O entendimento molecular de uma interação proteína-ligante ou proteína-proteína pode auxiliar na compreensão do mecanismo de regulação proteica e também pode contribuir para o desenho racional de novos fármacos. A ITC também permite monitorar o fluxo de uma reação enzimática produzindo informações como constante de Michaelis-Menten, constante de catálise e constante de inibição quando realizada na presença de inibidores. Desta forma, o objetivo deste projeto é aplicar a ITC para obter informações termodinâmicas da interação proteína-ligante ou proteína-proteína para correlacionar estas informações com dados estruturais em baixa e alta resolução de várias proteínas em estudo no grupo de BMB/IQSC/USP. As pesquisas no grupo BMB abrangem 4 linhas principais envolvendo chaperonas moleculares das famílias Hsp90 e Hsp70 (e suas co-chaperonas) de humano e de protozoários e também de uma enzima metabolizadora de tripanomicidas. A técnica de ITC poderá auxiliar consideravelmente a caracterização das proteínas em estudo no grupo BMB. (AU)

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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DORES-SILVA, PAULO ROBERTO; RODRIGUES KIRALY, VANESSA THOMAZ; DE OLIVEIRA MORITZ, MILENE NOBREGA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; SIQUEIRA DOS PASSOS, PATRICIA MARIA; SPAGNOL, VALENTINE; TEIXEIRA, FELIPE ROBERTI; GAVA, LISANDRA MARQUES; CAUVI, DAVID MARIO; INACIO RAMOS, CARLOS HENRIQUE; et al. New insights on human Hsp70-escort protein 1: Chaperone activity, interaction with liposomes, cellular localizations and HSPA's self-assemblies remodeling. International Journal of Biological Macromolecules, v. 182, p. 772-784, . (07/05001-4, 14/16646-0, 14/07206-6, 17/26131-5, 16/25798-3, 09/54216-9, 12/50161-8, 17/07879-9, 11/23110-0, 17/07335-9, 04/08868-0, 12/23730-1)
SILVA, NOELI S. M.; SERAPHIM, THIAGO V.; MINARI, KARINE; BARBOSA, LEANDRO R. S.; BORGES, JULIO C.. Comparative studies of the low-resolution structure of two p23 co-chaperones for Hsp90 identified in Plasmodium falciparum genome. International Journal of Biological Macromolecules, v. 108, p. 193-204, . (14/07206-6, 13/25646-0, 11/23110-0, 12/50161-8, 12/01953-9, 17/07335-9, 15/15822-1)
SERAPHIM, THIAGO V.; SILVA, KELLY P.; DORES-SILVA, PAULO R.; BARBOSA, LEANDRO R. S.; BORGES, JULIO C.. Insights on the structural dynamics of Leishmania braziliensis Hsp90 molecular chaperone by small angle X-ray scattering. International Journal of Biological Macromolecules, v. 97, p. 503-512, . (11/23110-0, 12/50161-8, 14/07206-6)
BATISTA, FERNANDA A. H.; DORES-SILVA, PAULO R.; BORGES, JULIO C.. Molecular Chaperones Involved in Protein Recovery from Aggregates are Present in Protozoa Causative of Malaria and Leishmaniasis. CURRENT PROTEOMICS, v. 16, n. 1, p. 12-21, . (14/07206-6, 14/16646-0, 07/05001-4, 12/50161-8, 11/23110-0)
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BATISTA, FERNANDA A. H.; ALMEIDA, GLESSLER S.; SERAPHIM, THIAGO V.; SILVA, KELLY P.; MURTA, SILVANE M. F.; BARBOSA, LEANDRO R. S.; BORGES, J. ULIO C.. Identification of two p23 co-chaperone isoforms in Leishmania braziliensis exhibiting similar structures and Hsp90 interaction properties despite divergent stabilities. FEBS Journal, v. 282, n. 2, p. 388-406, . (11/23110-0, 07/05001-4, 12/50161-8)
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ALVES BARBOSA, EVERTON DE ALMEIDA; SERAPHIM, THIAGO VARGAS; GANDIN, CESAR AUGUSTO; TEIXEIRA, LEILANE FERREIRA; GONCALVES DA SILVA, RONNI ANDERSON; RIGHETTO, GERMANNA L.; GONCALVES, KALIANDRA DE ALMEIDA; VASCONCELLOS, RAPHAEL DE SOUZA; ALMEIDA, MARCIA ROGERIA; SILVA JUNIOR, ABELARDO; et al. Insights into the full-length SRPK2 structure and its hydrodynamic behavior. International Journal of Biological Macromolecules, v. 137, p. 205-214, . (14/07206-6, 13/50724-5, 11/23110-0, 12/00195-3, 17/03489-1, 12/50161-8, 17/07335-9)
MINARI, KARINE; DE AZEVEDO, ERIKA CHANG; RODRIGUES KIRALY, VANESSA THOMAZ; HELENO BATISTA, FERNANDA APARECIDA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; DE MELO, FERNANDO ALVES; NASCIMENTO, ALESSANDRO SILVA; GAVA, LISANDRA MARQUES; INACIO RAMOS, CARLOS HENRIQUE; BORGES, JULIO CESAR. Thermodynamic analysis of interactions of the Hsp90 with adenosine nucleotides: A comparative perspective. International Journal of Biological Macromolecules, v. 130, p. 125-138, . (15/26722-8, 13/25646-0, 17/18173-0, 11/23110-0, 14/07206-6, 12/50161-8, 09/53989-4, 17/07335-9)
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BATISTA, FERNANDA A. H.; RAMOS, JR., SERGIO L.; TASSONE, GIUSY; LEITAO, ANDREI; MONTANARI, CARLOS A.; BOTTA, MAURIZIO; MORI, MATTIA; BORGES, JULIO C.. Discovery of small molecule inhibitors of Leishmania braziliensis Hsp90 chaperone. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, v. 35, n. 1, p. 639-649, . (13/10712-8, 17/26131-5, 14/07206-6, 11/23110-0, 13/18009-4, 12/50161-8, 17/07335-9)
MELO SILVA, NOELI SOARES; DE CAMARGO RODRIGUES, LUIZ FERNANDO; DORES-SILVA, PAULO ROBERTO; MONTANARI, CARLOS ALBERTO; INACIO RAMOS, CARLOS HENRIQUE; SOUZA BARBOSA, LEANDRO RAMOS; BORGES, JULIO CESAR. Structural, thermodynamic and functional studies of human 71 kDa heat shock cognate protein (HSPA8/hHsc70). BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1869, n. 12, . (17/07335-9, 11/23110-0, 17/26131-5, 12/50161-8, 15/15822-1, 14/07206-6, 14/16646-0)
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WALBERT VELOSO-SILVA, LAUDIMIR LEONARDO; DORES-SILVA, PAULO ROBERTO; BERTOLINO-REIS, DAYANE ELIARA; MORENO-OLIVEIRA, LOUIS FELLIPE; LIBARDI, SILVIA HELENA; BORGES, JULIO CESAR. Structural studies of Old Yellow Enzyme of Leishmania braziliensis in solution. Archives of Biochemistry and Biophysics, v. 661, p. 87-96, . (11/23110-0, 14/07206-6, 17/07335-9)
MURAKAMI, MARIO T.; RODRIGUES, NATHALIA C.; GAVA, LISANDRA M.; HONORATO, RODRIGO V.; CANDURI, FERNANDA; BARBOSA, LEANDRO R. S.; OLIVA, GLAUCIUS; BORGES, JULIO C.. Structural studies of the Trypanosoma cruzi Old Yellow Enzyme: Insights into enzyme dynamics and specificity. Biophysical Chemistry, v. 184, p. 44-53, . (11/23110-0, 07/05001-4)
BATISTA, FERNANDA A. H.; ALMEIDA, GLESSLER S.; SERAPHIM, THIAGO V.; SILVA, KELLY P.; MURTA, SILVANE M. F.; BARBOSA, LEANDRO R. S.; BORGES, J. ULIO C.. Identification of two p23 co-chaperone isoforms in Leishmania braziliensis exhibiting similar structures and Hsp90 interaction properties despite divergent stabilities. FEBS Journal, v. 282, n. 2, p. 19-pg., . (07/05001-4, 11/23110-0, 12/50161-8)

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