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Região MHC do búfalo - organização molecular utilizando ferramentas genômicas de última geração

Processo: 11/11889-3
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de dezembro de 2011 - 30 de novembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Maria Elisabete Jorge Amaral
Beneficiário:Maria Elisabete Jorge Amaral
Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Nedenia Bonvino Stafuzza
Bolsa(s) vinculada(s):12/04230-8 - Região MHC do búfalo - organização molecular utilizando ferramentas genômicas de última geração., BP.TT
Assunto(s):Genômica  Búfalos 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Búfalo | ferramentas genômicas | Organizacao Molecular | região MHC | Genômica

Resumo

Bovinos e bubalinos são suscetíveis a um espectro similar de agentes infecciosos, e por este motivo muitas das vacinas desenvolvidas para bovinos são também utilizadas em búfalo. Uma vez que o búfalo apresenta uma resposta a agentes infecciosos diferente do bovino, é evidente que as necessidades sanitárias bubalinas não são sempre atendidas por meio de vacinas concebidas para bovino. Para solucionar problemas exclusivos aos búfalos, é necessário compreender as variáveis envolvidas na susceptibilidade diferencial a doenças, levando, por exemplo, ao desenvolvimento de vacinas específicas para búfalo. Várias décadas de intensas pesquisas vêm definindo a estrutura genômica do MHC em diversas espécies de animais de interesse econômico, esclarecendo o papel-chave das variações genéticas encontradas nesta região na suscetibilidade a doenças auto-imunes e infecciosas. Pesquisas na área da genômica têm aprofundado os conhecimentos sobre como o sistema imune é regulado e identificado genes, principalmente aqueles da região MHC, associados a esse processo. Diante desse panorama, esse projeto tem como objetivo a análise molecular da região MHC do búfalo, identificando os elementos estruturais que a compõem, além da determinação de alelos e haplótipos presentes em cada uma das principais raças criadas no Brasil (Murrah, Jafarabadi e Mediterâneo). Para isso, serão utilizadas ferramentas genômicas construídas pelo nosso grupo de pesquisa para o estudo do genoma do búfalo, incluindo o mapa genômico de alta resolução da região MHC bubalina, assim como a biblioteca genômica do tipo BAC que serão utilizados para o isolamento e seqüenciamento direcionado de clones contendo genes do MHC de búfalo. Além do mapa de alta resolução e da biblioteca BAC, outras tecnologias genômicas de última geração como RNAseq (seqüenciamento de RNA), CGH-Array (do inglês Comparative Genomic Hybridization) e MLPA (do inglês Multiplex ligation-dependent probe amplification) serão utilizadas em colaboração com grupos de pesquisa do exterior para a prospecção e anotação de genes do MHC de búfalo e para estudos de identificação e validação da variação no número de cópias de segmentos de DNA na região MHC (CNV, do inglês Copy Number Variation). Posteriormente, a região MHC do búfalo será comparada com aquelas correspondentes em outros mamíferos visando detectar eventos evolutivos ocorridos nessa região. Os resultados obtidos contribuirão para o entendimento dos mecanismos moleculares que possam estar associados com as diferenças apresentadas pelos búfalos na resistência a doenças quando comparado com bovino. (AU)

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Publicações científicas (8)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
STAFUZZA, N. B.; BORGES, M. M.; AMARAL-TRUSTY, M. E. J.. GENETIC ANALYSIS OF SUPEROXIDE DISMUTASE 1 GENE IN MURRAH RIVER BUFFALO. JOURNAL OF ANIMAL AND PLANT SCIENCES, v. 24, n. 6, p. 1869-1875, . (11/02478-0, 11/11889-3)
STAFUZZA, N. B.; OLIVATTO, L. M.; NARESSI, B. C. M.; TONHATI, H.; AMARAL-TRUSTY, M. E. J.. Analysis of DRB3 gene polymorphisms in Jafarabadi, Mediterranean, and Murrah buffaloes from Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 1, . (11/11889-3)
STAFUZZA, N. B.; BORGES, M. M.; AMARAL-TRUSTY, M. E. J.. Molecular characterization of interferon regulatory factor 1 in Bubalus bubalis. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 3, p. 10919-10928, . (11/02478-0, 11/11889-3)
STAFUZZA, N. B.; BORGES, M. M.; AMARAL, M. E. J.. Comparative analysis of the river buffalo somatostatin gene. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 10017-10024, . (11/02478-0, 11/11889-3)
STAFUZZA, N. B.; BORGES, M. M.; AMARAL-TRUSTY, M. E. J.. Sequence characterization and comparative analysis of the gastrotropin gene in buffalo (Bubalus bubalis). Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 10934-10942, . (11/02478-0, 11/11889-3)
STAFUZZA, N. B.; NARESSI, B. C. M.; YANG, E.; CAI, J. J.; AMARAL-TRUSTY, M. E. J.. A framework radiation hybrid map of buffalo chromosome 1 ordering scaffolds from buffalo genome sequence assembly. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 4, p. 13096-13104, . (11/11889-3, 11/02478-0)
STAFUZZA, N. B.; GRECO, A. J.; GRANT, J. R.; ABBEY, C. A.; GILL, C. A.; RAUDSEPP, T.; SKOW, L. C.; WOMACK, J. E.; RIGGS, P. K.; AMARAL, M. E. J.. A high-resolution radiation hybrid map of the river buffalo major histocompatibility complex and comparison with BoLA. ANIMAL GENETICS, v. 44, n. 4, p. 369-376, . (11/02478-0, 11/11889-3, 08/10725-4)
STAFUZZA, N. B.; NARESSI, B. C. M.; BORGES, M. M.; AMARAL-TRUSTY, M. E. J.. Sequence analysis of the S1PR1 gene in river buffalo. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 1, . (11/11889-3)

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