Região MHC do búfalo - organização molecular utilizando ferramentas genômicas de última geração

Resumo

Bovinos e bubalinos são suscetíveis a um espectro similar de agentes infecciosos, e por este motivo muitas das vacinas desenvolvidas para bovinos são também utilizadas em búfalo. Uma vez que o búfalo apresenta uma resposta a agentes infecciosos diferente do bovino, é evidente que as necessidades sanitárias bubalinas não são sempre atendidas por meio de vacinas concebidas para bovino. Para solucionar problemas exclusivos aos búfalos, é necessário compreender as variáveis envolvidas na susceptibilidade diferencial a doenças, levando, por exemplo, ao desenvolvimento de vacinas específicas para búfalo. Várias décadas de intensas pesquisas vêm definindo a estrutura genômica do MHC em diversas espécies de animais de interesse econômico, esclarecendo o papel-chave das variações genéticas encontradas nesta região na suscetibilidade a doenças auto-imunes e infecciosas. Pesquisas na área da genômica têm aprofundado os conhecimentos sobre como o sistema imune é regulado e identificado genes, principalmente aqueles da região MHC, associados a esse processo. Diante desse panorama, esse projeto tem como objetivo a análise molecular da região MHC do búfalo, identificando os elementos estruturais que a compõem, além da determinação de alelos e haplótipos presentes em cada uma das principais raças criadas no Brasil (Murrah, Jafarabadi e Mediterâneo). Para isso, serão utilizadas ferramentas genômicas construídas pelo nosso grupo de pesquisa para o estudo do genoma do búfalo, incluindo o mapa genômico de alta resolução da região MHC bubalina, assim como a biblioteca genômica do tipo BAC que serão utilizados para o isolamento e seqüenciamento direcionado de clones contendo genes do MHC de búfalo. Além do mapa de alta resolução e da biblioteca BAC, outras tecnologias genômicas de última geração como RNAseq (seqüenciamento de RNA), CGH-Array (do inglês Comparative Genomic Hybridization) e MLPA (do inglês Multiplex ligation-dependent probe amplification) serão utilizadas em colaboração com grupos de pesquisa do exterior para a prospecção e anotação de genes do MHC de búfalo e para estudos de identificação e validação da variação no número de cópias de segmentos de DNA na região MHC (CNV, do inglês Copy Number Variation). Posteriormente, a região MHC do búfalo será comparada com aquelas correspondentes em outros mamíferos visando detectar eventos evolutivos ocorridos nessa região. Os resultados obtidos contribuirão para o entendimento dos mecanismos moleculares que possam estar associados com as diferenças apresentadas pelos búfalos na resistência a doenças quando comparado com bovino. (AU)