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Correlação estrutura-função de proteínas e peptídeos

Resumo

O entendimento das funções biológicas, ao nível molecular, requer o conhecimento da estrutura tridimensional e das propriedades dinâmicas das proteínas envolvidas. Atualmente, as técnicas capazes de fornecer detalhes da estrutura de proteínas, ao nível atômico são: a cristalografia de raios x e a ressonância magnética nuclear (RMN). A vantagem da RMN, neste caso, reside na possibilidade de obter informações de caráter dinâmico em condições similares as fisiológicas. Neste projeto pretende-se empregar as técnicas espectroscópicas de RMN de alta resolução e dicroísmo circular e modelagem molecular para descrever os detalhes estruturais e processos dinâmicos, como enovelamento e flexibilidade dos peptídeos e proteínas, e correlacionar essas informações com suas atividades biológicas. Os sistemas de estudos serão: 1) os peptídeos antimicrobianos (FLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGAK, correspondente ao fragmento 33-61 da alfa-bemoglobina bovina e mutante da gomesina ZCRRLCYKQRCVTYCRGR); 2) fragmento do canal de sódio de cérebro (KGIRTLLFALMMSLPALFNIG resíduos 1644-1664, correspondente a alça citoplasmática entre S4 e S5 do domínio IV) e 3) a proteína metalotioneína da cianobactéria Synechococcus PCC 7942. O projeto científico será desenvolvido no Centro de Biologia Molecular Estrutural, do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron em Campinas, e contará com a colaboração de pesquisadores de diversos centros de pesquisa do estado de São Paulo. (AU)

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE OLIVEIRA, ALINE LIMA; CILLI, EDUARDO MAFFUD; ROS, URIS; CRUSCA, JR., EDSON; LANIO, MARIA ELIANA; ALVAREZ, CARLOS; SCHREIER, SHIRLEY; PERTINHEZ, THELMA AGUIAR; SPISNI, ALBERTO. Insights on the structure-activity relationship of peptides derived from Sticholysin II. PEPTIDE SCIENCE, v. 110, n. 5, SI, . (00/02026-7, 02/02067-0, 99/11030-9)
FRACETO, LEONARDO F.; OYAMA JÚNIOR, SÉRGIO; NAKAIE, CLÓVIS R.; SPISNI, ALBERTO; PAULA, ENEIDA DE; PERTINHEZ, THELMA A.. Interaction of local anesthetics with a peptide encompassing the IV/S4-S5 linker of the Na+ channel. Biophysical Chemistry, v. 123, n. 1, p. 29-39, . (99/11030-9, 99/07574-3, 01/03746-6, 00/02026-7, 00/00362-0)
DE OLIVEIRA, ALINE L.; GALLO, MARIANA; PAZZAGLI, LUIGIA; BENEDETTI, CELSO E.; CAPPUGI, GIANNI; SCALA, ANIELLO; PANTERA, BARBARA; SPISNI, ALBERTO; PERTINHEZ, THELMA A.; CICERO, DANIEL O.. The Structure of the Elicitor Cerato-platanin (CP), the First Member of the CP Fungal Protein Family, Reveals a Double psi beta-Barrel Fold and Carbohydrate Binding. Journal of Biological Chemistry, v. 286, n. 20, p. 17560-17568, . (00/02026-7, 00/10266-8, 99/11030-9)
DE OLIVEIRA, ALINE LIMA; CILLI, EDUARDO MAFFUD; ROS, URIS; CRUSCA, EDSON, JR.; LANIO, MARIA ELIANA; ALVAREZ, CARLOS; SCHREIER, SHIRLEY; PERTINHEZ, THELMA AGUIAR; SPISNI, ALBERTO. Insights on the structure-activity relationship of peptides derived from Sticholysin II. PEPTIDE SCIENCE, v. 110, n. 5, p. 9-pg., . (00/02026-7, 02/02067-0, 99/11030-9)
STEHLING, ELIANA G.; SFORCA, MAURICIO L.; ZANCHIN, NILSON I. T.; OYAMA, JR., SERGIO; PIGNATELLI, ANGELA; BELLUZZI, OTTORINO; POLVERINI, EUGENIA; CORSINI, ROMINA; SPISNI, ALBERTO; PERTINHEZ, THELMA A.. Looking over Toxin-K+ Channel Interactions. Clues from the Structural and Functional Characterization of alpha-KTx Toxin Tc32, a Kv1.3 Channel Blocker. BIOCHEMISTRY, v. 51, n. 9, p. 1885-1894, . (00/10266-8, 01/08095-3, 00/02026-7, 03/01921-0, 99/07574-3, 99/11030-9)
MARROQUIN-QUELOPANA, MIRYAM; OYAMA JÚNIOR, SERGIO; PERTINHEZ, THELMA AGUIAR; SPISNI, ALBERTO; JULIANO, MARIA APARECIDA; JULIANO, LUIZ; COLLI, WALTER; ALVES, MARIA JÚLIA M.. Modeling the Trypanosoma cruzi Tc85-11 protein and mapping the laminin-binding site. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 325, n. 2, p. 612-618, . (00/02026-7, 01/08001-9, 99/12459-9)
PERTINHEZ, THELMA A.; SFORÇA, MAURICIO L.; ALVES, ADRIANA C.; RAMOS, CELSO R. R.; HO, PAULO L.; TENDLER, MIRIAM; ZANCHIN, NILSON I. T.; SPISNI, ALBERTO. H-1, N-15 and C-13 resonance assignments of the apo Sm14-M20(C62V) protein, a mutant of Schistosoma mansoni Sm14. Journal of Biomolecular NMR, v. 29, n. 4, p. 553-554, . (99/11030-9, 98/14961-0, 98/14138-2, 00/02026-7)

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