EMU: aquisição do sequenciador de DNA 3500 Genetic Analyzer (Applied Biosystems) para estudo de polimorfismos genéticos em microorganismos, repertório de células T e B e outros genes de interesses em doenças cardíacas

Resumo

A utilização de sequenciadores automáticos de DNA de última geração, que empregam tecnologia capilar, apresenta uma série de vantagens em relação aos sequenciadores em placa. Há automação quase total no processo de sequenciamento, sem necessidade da montagem das placas e preparo do gel, bem como ajuste das amostras sequenciadas após a corrida eletroforética. Além disso, o tempo de corrida em sistema capilar é reduzido e permite que um maior número de amostras sejam sequenciadas por dia. Esta técnica possui várias aplicações no estudo do DNA: sequenciamento, estudo de polimorfismos, análise de fragmentos, entre outras, de acordo com os softwares aplicativos. O aparelho multiusuário solicitado contribuirá diretamente para o estudo de tipificação genética de microorganismos, polimorfismos do repertório de células T e B e outros genes de interesse em doenças cardíacas. Espera-se obter ao final do projeto um melhor conhecimento sobre a distribuição das cepas mais prevalentes de S. pyogenes no Estado de São Paulo, estudo que contribuirá diretamente para avaliar a eficiência da vacina em desenvolvimento, que visa prevenir a Febre Reumática e outras patologias decorrentes da infecção por S. pyogenes. O sequenciador também facilitará a identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em Doença de Chagas e a identificação de alterações no repertório de linfócitos Te B de sangue periférico em pacientes transplantados (órgãos sólidos e terapia celular). Além disso, o equipamento será utilizado para análise estrutural e funcional da região "LEE" e de adesinas fimbriais e não fimbriais de E. coli enterogênica atípica. Será também uma ferramenta útil na avaliação de diversos genes clonados em vetores, objetivando verificar a integridade do DNA, posição do inserto e também verificar as mutações induzidas em genes de interesse, para diversos estudos funcionais e produção de proteínas recombinantes. (AU)