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Estudos de associação genômica das características reprodutivas de touros zebuínos (Bos indicus) utilizando SNP chip de alta densidade

Processo: 10/52030-2
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2011 - 30 de setembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
Pesquisador responsável:José Fernando Garcia
Beneficiário:José Fernando Garcia
Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária (FMVA). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araçatuba. Araçatuba , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):12/19570-9 - Estudo de associação genômica das carcterísticas reprodutivas de touros zebuínos (Bos indcus) utilizando SNP chip de alta densidade, BP.TT
Assunto(s):Genomas  Melhoramento genético animal  Bovinos 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bovino | Genomica | Reproducao | Selecao | Snp Chip | Zebu

Resumo

Diversos estudos realizados nas áreas de genética quantitativa e genômica funcional demonstraram que a Associação Genômica (do inglês: Genome Wide Association Study - GWAS) permite a identificação de marcadores moleculares passíveis de uso nos processos de seleção, potencializando o ganho genético dos programas de melhoramento genético. Essa técnica pode permitir a identificação de marcadores genéticos associados a fenótipos específicos, tais como qualidade do sêmen e criotolerância espermática, úteis na seleção precoce, eficiente e confiável de reprodutores, aumentando assim a produtividade e a rentabilidade da pecuária bovina. O emprego de ferramentas moleculares avançadas, como o chip de polimorfismo de sítio único (SNP chip), tem maximizado os benefícios da seleção assistida por marcadores, permitindo a varredura uniforme do genoma para milhares de marcadores simultaneamente e propiciando a obtenção de mapas genômicos densos extremamente informativos. Levando em consideração a necessidade atual da cadeia produtiva bovina em encurtar os ciclos de produção pela seleção de animais superiores com melhor desempenho reprodutivo em idades precoces, o presente projeto propõe a identificação de marcadores moleculares associados à qualidade do sêmen e criotolerância espermática em touros de raças zebuínas utilizando SNP chip de alta densidade. (AU)

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Publicações científicas (14)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AGUIAR, TAMIRIS SAYURI; PINTOR TORRECILHA, RAFAELA BEATRIZ; MILANESI, MARCO; HARTH UTSUNOMIYA, ADAM TAITI; TRIGO, BEATRIZ BATISTA; TIJJANI, ABDULFATAI; MUSA, HASSAN HUSSEIN; LOPES, FLAVIA LOMBARDI; AJMONE-MARSAN, PAOLO; CARVALHEIRO, ROBERTO; et al. Association of Copy Number Variation at Intron 3 of HMGA2 With Navel Length in Bos indicus. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, . (16/07531-0, 10/52030-2, 17/08373-1, 16/05787-7, 14/01095-8)
UTSUNOMIYA, YURI TANI; MILANESI, MARCO; HARTH UTSUNOMIYA, ADAM TAITI; PINTOR TORRECILHA, RAFAELA BEATRIZ; KIM, EUI-SOO; COSTA, MARCIO SILVA; AGUIAR, TAMIRIS SAYURI; SCHROEDER, STEVEN; DO CARMO, ADRIANA SANTANA; CARVALHEIRO, ROBERTO; et al. A PLAG1 mutation contributed to stature recovery in modern cattle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (16/07531-0, 10/52030-2, 14/01095-8)
UTSUNOMIYA, YURI T.; DO CARMO, ADRIANA S.; CARVALHEIRO, ROBERTO; NEVES, HAROLDO H. R.; MATOS, MARCIA C.; ZAVAREZ, LUDMILLA B.; O'BRIEN, ANA M. PEREZ; SOELKNER, JOHANN; MCEWAN, JOHN C.; COLE, JOHN B.; et al. Genome-wide association study for birth weight in Nellore cattle points to previously described orthologous genes affecting human and bovine height. BMC GENETICS, v. 14, . (10/52030-2, 11/16643-2)
NEVES, HAROLDO H. R.; CARVALHEIRO, ROBERTO; PEREZ O'BRIEN, ANA M.; UTSUNOMIYA, YURI T.; DO CARMO, ADRIANA S.; SCHENKEL, FLAVIO S.; SOELKNER, JOHANN; MCEWAN, JOHN C.; VAN TASSELL, CURTIS P.; COLE, JOHN B.; et al. Accuracy of genomic predictions in Bos indicus (Nellore) cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 46, . (10/52030-2, 11/16643-2, 10/06185-4)
PORTO-NETO, LAERCIO R.; SONSTEGARD, TAD S.; LIU, GEORGE E.; BICKHART, DEREK M.; DA SILVA, MARCOS V. B.; MACHADO, MARCO A.; UTSUNOMIYA, YURI T.; GARCIA, JOSE F.; GONDRO, CEDRIC; VAN TASSELL, CURTIS P.. Genomic divergence of zebu and taurine cattle identified through high-density SNP genotyping. BMC Genomics, v. 14, . (10/52030-2)
UTSUNOMIYA, Y. T.; FORTUNATO, A. A. A. D.; MILANESI, M.; TRIGO, B. B.; ALVES, N. F.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F.. Bos taurus haplotypes segregating in Nellore (Bos indicus) cattle. ANIMAL GENETICS, v. 53, n. 1, . (10/52030-2)
TRIGO, BEATRIZ B.; UTSUNOMIYA, ADAM T. H.; FORTUNATO, ALVARO A. A. D.; MILANESI, MARCO; TORRECILHA, RAFAELA B. P.; LAMB, HARRISON; NGUYEN, LOAN; ROSS, ELIZABETH M.; HAYES, BEN; PADULA, ROMULO C. M.; et al. Variants at the ASIP locus contribute to coat color darkening in Nellore cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 53, n. 1, . (10/52030-2, 16/05787-7)
UTSUNOMIYA, ADAM T. H.; SANTOS, DANIEL J. A.; BOISON, SOLOMON A.; UTSUNOMIYA, YURI T.; MILANESI, MARCO; BICKHART, DEREK M.; AJMONE-MARSAN, PAOLO; SOELKNER, JOHANN; GARCIA, JOSE F.; DA FONSECA, RICARDO; et al. Revealing misassembled segments in the bovine reference genome by high resolution linkage disequilibrium scan. BMC Genomics, v. 17, . (10/52030-2, 14/01095-8)
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; MESZAROS, GABOR; UTSUNOMIYA, YURI T.; SONSTEGARD, TAD S.; GARCIA, J. FERNANDO; VAN TASSELL, CURTIS P.; CARVALHEIRO, ROBERTO; DA SILVA, MARCOS V. B.; SOLKNER, JOHANN. Linkage disequilibrium levels in Bos indicus and Bos taurus cattle using medium and high density SNP chip data and different minor allele frequency distributions. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, n. SI, p. 121-132, . (10/52030-2, 11/16643-2)
BOISON, S. A.; NEVES, H. H. R.; PEREZ O'BRIEN, A. M.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; DA SILVA, M. V. G. B.; SOELKNER, J.; GARCIA, J. F.. Imputation of non-genotyped individuals using genotyped progeny in Nellore, a Bos indicus cattle breed. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, n. SI, p. 176-189, . (10/52030-2, 11/16643-2)
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; HOELER, DANIELA; BOISON, SOLOMON A.; MILANESI, MARCO; BOMBA, LORENZO; UTSUNOMIYA, YURI T.; CARVALHEIRO, ROBERTO; NEVES, HAROLDO H. R.; DA SILVA, MARCOS V. B.; VANTASSELL, CURTIS P.; et al. Low levels of taurine introgression in the current Brazilian Nelore and Gir indicine cattle populations. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 47, . (10/52030-2, 14/01095-8)
UTSUNOMIYA, YURI T.; CARMO, ADRIANA S.; NEVES, HAROLDO H. R.; CARVALHEIRO, ROBERTO; MATOS, MARCIA C.; ZAVAREZ, LUDMILLA B.; ITO, PIER K. R. K.; O'BRIEN, ANA M. PEREZ; SOELKNER, JOHANN; PORTO-NETO, LAERCIO R.; et al. Genome-Wide Mapping of Loci Explaining Variance in Scrotal Circumference in Nellore Cattle. PLoS One, v. 9, n. 2, . (10/52030-2, 11/16643-2)
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; UTSUNOMIYA, YURI T.; MESZAROS, GABOR; BICKHART, DEREK M.; LIU, GEORGE E.; VAN TASSELL, CURTIS P.; SONSTEGARD, TAD S.; DA SILVA, MARCOS V. B.; GARCIA, JOSE FERNANDO; SOELKNER, JOHANN. Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 46, . (10/52030-2, 11/16643-2)
UTSUNOMIYA, YURI TANI; O'BRIEN, ANA MARIA PEREZ; SONSTEGARD, TAD STEWART; VAN TASSELL, CURTIS PAUL; DO CARMO, ADRIANA SANTANA; MESZAROS, GABOR; SOELKNER, JOHANN; GARCIA, JOSE FERNANDO. Detecting Loci under Recent Positive Selection in Dairy and Beef Cattle by Combining Different Genome-Wide Scan Methods. PLoS One, v. 8, n. 5, . (10/52030-2, 11/16643-2)

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