| Processo: | 99/02860-8 |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA |
| Vigência: | 01 de junho de 1999 - 31 de maio de 2002 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular |
| Pesquisador responsável: | Helaine Carrer |
| Beneficiário: | Helaine Carrer |
| Instituição Sede: | Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Análise de sequência de DNA Expressão gênica Biblioteca gênica Cana-de-açúcar Genoma Cana-de-Açúcar - SucEST |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Biblioteca Cdna | Cana-De-Acucar | Est | Expressao Genica | Sequenciamento De Dna | Sinais De Transcricao |
Resumo
Este projeto tem o objetivo de sequenciar EST (Expressed Sequence Tags) de cana-de-açúcar e identificar genes expressos em uma grande coleção de cDNAs, a partir de bibliotecas preparadas de vários tecidos como: calos, raiz, colmo, folha, folha estioladas, flores, sementes e outros. O projeto geral espera sequenciar 50.000 genes ou 300.000 leituras de sequências contendo no mínimo 300 nucleotídeos. Nosso grupo no CEBTEC, Depto de Ciências Biológicas da ESALQ/USP espera depositar em torno de 7.000 leituras (reads) com boa qualidade (Phred-Phrap-Consed) por ano com a utilização do sequenciador automático ABI-377 para 36 amostras. Também estamos interessados em participar do processo de identificação dos genes relacionados com os sinais de transcrição. Cana-de-açúcar é uma cultura de grande importância para o estado de São Paulo e para o Brasil. Acreditamos que o desenvolvimento da pesquisa em biologia molecular de plantas engrandece tanto os pesquisadores como os agricultores de forma única. (AU)
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