Identificação de genes potencialmente associados adaptação, evolução e virulência de Xylella fastidiosa

Resumo

Xylella fastidiosa é uma bactéria que coloniza o xilema de uma diversidade de plantas cultivadas e silvestres em várias partes do mundo, sendo o agente causador de uma série de doenças em plantas economicamente importantes como citros, videiras e café. Diferentes cepas ou patovares de X. fastidiosa foram identificados, sendo que destes, quatro já tiveram seus genomas completa ou parcialmente elucidados: (i) X. fastidiosa cepa 9a5c, isolada de citros e agente etiológico da Clorose Variegada dos Citros; (ii) X. fastidiosa cepa Temecula-1, isolada de videiras e agente etiológico da doença de Pierce; (iii) X. fastidiosa pv. almond cepa Dixon, agente causal da escaldadura da amendoeira e (iv) X. fastidiosa pv. oleander cepa Ann-1 agente causal escaldadura da espirradeira. Desde o seqüenciamento completo destes genomas, muito se avançou na compreensão de processos envolvidos na colonização dos hospedeiros de X. fastidiosa, seja ele planta ou inseto vetor, e alguns dos mecanismos de virulência foram elucidados. Entretanto, presume-se a existência de mecanismos e fatores adicionais importantes para colonização de plantas e insetos por este fitopatógeno. É importante ressaltar que hoje se verifica a ausência da estirpe 9a5c nos pomares citrícolas com CVC em São Paulo em detrimento de outras estirpes virulentas, mesmo que em condições experimentais a cepa 9a5c ainda se mantenha virulenta. Aparentemente esta cepa está geneticamente mais relacionada a estirpes de café e a um isolado de citros da Argentina do que a outros isolados hoje encontrados nos pomares de citros de São Paulo. Portanto, a origem da X. fastidiosa da CVC ainda é controversa. Assim, neste projeto temos como objetivo a identificação de novos genes potencialmente associados aos aspectos evolutivos e de adaptação e virulência de X. fastidiosa. Para tal será realizado o seqüenciamento completo do genoma de quatro cepas de X. fastidiosa (3 de citros e 1 de cafeeiro), suas anotações e comparação com genomas já conhecidos. O seqüenciamento das cepas J1a12 (baixa virulência) e U24d (alta virulência) isoladas de plantas de laranja doce com CVC, aqui proposto, e a comparação destas com a 9a5c, visa o entendimento dos aspectos de adaptação e virulência. Informações sobre a evolução da X. fastidiosa na América do Sul e de adaptação aos hospedeiros (plantas e vetores) serão melhor obtidas com o seqüenciamento, também aqui proposto, da estirpe Fb#7 isolada de citros com CVC na Argentina e de uma estirpe isolada de planta de café com sintomas de escaldadura folhar (isolado 3124), as quais serão comparadas com a 9a5c. O seqüenciamento será realizado utilizando o equipamento 454 Roche, instalado no Centro Avançado de Tecnologias em Genômica (CATG) do Departamento de Bioquímica do IQUSP. A montagem e anotação dos genomas e a análise comparativa entre genomas serão realizadas em colaboração com o Laboratório de Bioinformática do Laboratório Nacional de Computação Científica. (AU)