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X3DPROT - ferramenta para visualização distribuída de macromoléculas utilizando X3D

Resumo

Nos últimos anos a Proteômica tem ganhado força e sido responsável pela geração de uma enorme quantidade de dados que devem ser interpretados apropriadamente. Todos aqueles que trabalham na área dão boas vindas a qualquer esforço que possa contribuir para a aceleração de todo o processo de pesquisa e desenvolvimento. A estrutura tridimensional de uma proteína determina suas interações com outras moléculas. Do ponto de vista da visualização 3D de uma estrutura protéica, várias aplicações têm sido usadas com um certo grau de sucesso, embora apenas algumas delas tenham a característica de visualização e construção colaborativa via Internet. O sistema de visualização aqui apresentado permitirá a investigação e construção, através de diferentes aspectos estruturais, de um modelo protéico de forma colaborativa via rede. Estas visualizações deverão ocorrer em ambiente de realidade virtual com a criação de moléculas virtuais com o novo formato X3D apoiado pelo consórcio W3, utilizando-se Java3D e protocolos Java RMI para a transmissão e recepção de dados num modelo cliente/servidor com bancos de dados replicados nos mundos virtuais de cada usuário. Uma característica inovadora é a proposta de uma sistema de anotação que tornará possível compartilhar observações particulares dos vários pesquisadores geograficamente distribuídos sobre regiões específicas de um modelo protéico em construção. Estas observações poderão ser feitas nos formatos de áudio, vídeo e texto. (AU)

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