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Integrando citogenética e genômica no estudo das vias de diferenciação dos cromossomos sexuais. Parte I

Processo: 23/00955-2
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2024 - 31 de janeiro de 2026
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Marcelo de Bello Cioffi
Beneficiário:Marcelo de Bello Cioffi
Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Pesquisadores associados: Alexandr Sember ; Anderson José Baia Gomes ; Edivaldo Herculano Correa de Oliveira ; Fábio Porto-Foresti ; Orlando Moreira Filho ; Petr Ráb ; Rafael Kretschmer ; Ricardo Utsunomia ; Tariq Ezaz ; Thomas Liehr ; Vladimir Trifonov
Bolsa(s) vinculada(s):24/00722-0 - Plano de atividades da Bolsa TT4 junto ao Laboratório de Citogenética de Peixes, BP.TT
Assunto(s):Citogenética molecular  Cromossomos sexuais  Peixes  Sequenciamento NGS  Vertebrados 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:citogenética molecular | Cromossomos sexuais | DNAs satélites | Fish | Sequenciamento NGS | vertebrados | Citogenética Animal

Resumo

O presente projeto visa integrar abordagens citogenéticas e genômicas para elucidar os mecanismos de origem e diferenciação dos cromossomos sexuais e verificar se suas vias de diferenciação ocorreram seguindo o modelo canônico de evolução. Para isto, analisaremos sistemas ZZ/ZW-nascentes e diferenciados; XX/XY-nascentes, X1X1X2X2/X1X2Y e XX/XY1Y2 presentes em distintas espécies de vertebrados, sendo elas a traíra Hoplias malabaricus e cascudos do gênero Harttia (peixes); serpentes da família Colubridae (répteis), o emu Dromaius novaehollandiae e o inhambu-chintã Crypturellus tataupa (aves). A investigação de sistemas de cromossomos sexuais simples e múltiplos, em estado nascente e já diferenciados, presentes nestes grupo-modelo que possuem distintas caraterísticas no tocante à quantidade de sequencias repetitivas presente em seus genomas e na posição filogenética que ocupam, representam um excelente cenário para este teste de hipóteses. As abordagens metodológicas desta proposta envolvem i) a prospecção e caracterização de toda biblioteca de DNAs Satélites (Satelitoma) destas espécies; ii) A análise comparativa da distribuição cromossômica de sequências repetitivas e entre machos e fêmeas para identificar quais estiveram majoritariamente envolvidas com a diferenciação do cromossomo sexo-específico (Y, W, ou neo-Y); iii) Análise do compartilhamento e da evolução dos DNAs satélites presentes nos cromossomos sexuais das espécies-irmãs de cada grupo modelo selecionado e iv) utilização de experimentos de pintura cromossômica (WCP) e hibridização genômica comparativa (CGH) para a investigação da origem comum ou independente dos cromossomos sexuais em cada grupo modelo selecionado. Esta proposta conta uma rede já bem estabelecida envolvendo diversos grupos de pesquisa do Brasil e do exterior igualmente interessados na temática a ser investigada, viabilizando a sua execução e a obtenção de resultados promissores para a citogenética e genética evolutiva. (AU)

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