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Controle pós-transcricional de expressão gênica: processamento de pré-rRNA, degradação de mRNA, splicing e montagem de snoRNPs em Saccharomyces cerevisiae

Processo: 20/00901-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de julho de 2021 - 30 de junho de 2026
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Carla Columbano de Oliveira
Beneficiário:Carla Columbano de Oliveira
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Alexander Henning Ulrich ; Marcos Vicente de Albuquerque Salles Navarro ; Olivier Gadal
Auxílios(s) vinculado(s):23/00368-0 - Uso de Microscopia de Alta Resolução para Investigar o Papel Funcional do Exosome em Complexos Sub-nucleolares, AP.R SPRINT
22/08812-3 - EMU concedido no projeto 20/00901-1: sistema de cromatografia líquida FPLC, AP.EMU
Bolsa(s) vinculada(s):24/03395-0 - Interações entre Fatores de Splicing e o pequeno RNA nuclear (snRNA) U2 Durante a Montagem do Spliceossomo em Saccharomyces cerevisiae., BP.MS
24/02036-7 - Estudo do papel da subunidade do exossomo DIS3 no controle de ciclo celular, BP.PD
23/06344-5 - Análise do efeito da presença do pré-rRNA 7S nas subunidades 60S na tradução em Saccharomyces cerevisiae, BP.DR
+ mais bolsas vinculadas 22/16359-7 - Caracterização da interação de novas proteínas com o exossomo, BP.IC
22/06549-3 - Efeito da Ausência do Fator de Splicing Cwc24 no Interactoma da Prp11 em Saccharomyces cerevisiae, BP.IC
22/00071-4 - Identificação de carioferinas envolvidas na importação nuclear das subunidades do exossomo em Saccharomyces cerevisiae, BP.PD
21/14620-7 - Influência da fosforilação de proteínas do complexo préribossomal 90s no recrutamento do exossomo e seu papel na sinalização durante o processamento e controle de qualidade dos pré-rRNAS, BP.PD
21/14137-4 - Caracterização do papel do fator geral de splicing CWC24 em pré-mRNA em Saccharomyces cerevisiae, BP.DD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Expressão gênica  Processamento pós-transcricional do RNA  Interação proteína-proteína  Fatores de processamento de RNA  Ribossomos  Motivo de reconhecimento de RNA  Estabilidade de RNA  Ribonucleoproteínas nucleolares pequenas  Saccharomyces cerevisiae 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Complexos ribonucleoproteicos | Interação proteína-proteína | interação proteína-RNA | Maturação de ribossomos | processamento de RNA | splicing | Controle de Expressão Gênica

Resumo

Em eucariotos, os RNAs passam por várias etapas de processamento para sua maturação, que envolvem interações específicas proteína-proteína e RNA-proteínas que são essenciais para o controle de expressão gênica. Nosso grupo tem caracterizado funcionalmente várias proteínas envolvidas em controle de expressão gênica. A RNase denominada exossomo tem sido nosso foco central da pesquisa, com estudos funcionais do complexo em levedura e estruturais do exossomo tanto de levedura como de archaea. Este projeto visa à continuação dos estudos do exossomo de levedura, e principalmente da localização subcelular de suas subunidades e do recrutamento deste complexo para as partículas pré-ribossomais. Um novo desafio também proposto aqui é o de estudo da participação do exossomo no controle de expressão de mRNAs em humanos. É proposta ainda a continuação do estudo de proteínas de Saccharomyces cerevisiae identificadas e caracterizadas anteriormente no laboratório, proteínas essas envolvidas em diferentes etapas de controle de expressão gênica, em vias conectadas entre si através interações proteicas. No centro dessas interações está Nop17, que faz parte do complexo co-chaperone R2TP e participa da montagem de complexos multiproteicos. Nop17 interage com o exossomo, com fatores de splicing, com subunidades de snoRNPs, com proteínas do pré-60S e com uma proteína que contém clusters Fe/S. Este projeto é, portanto, bastante abrangente e envolve o estudo de diferentes complexos enzimáticos. Dada a conservação evolutiva destes processos em eucariotos, os resultados poderão ser depois extrapolados para humanos, nos quais doenças já foram identificadas como sendo causadas por mutações nos genes das ortólogas estudadas por nós. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CARVALHO, FELIPE A.; MUEHLENHOFF, ULRICH; BRAYMER, JOSEPH J.; ROOT, VASILIJ; STUEMPFIG, MARTIN; OLIVEIRA, CARLA C.; LILL, ROLAND. Hsp90 and metal-binding J-protein family chaperones are not critically involved in cellular iron-sulfur protein assembly and iron regulation in yeast. FEBS Letters, v. 597, n. 13, p. 15-pg., . (19/00527-5, 20/00901-1, 21/06497-0)

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