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Análise integrada do transcriptoma e proteoma para identificação de biomarcadores para eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato em bovinos Caracu

Processo: 18/19216-7
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de junho de 2019 - 31 de maio de 2024
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Nedenia Bonvino Stafuzza
Beneficiário:Nedenia Bonvino Stafuzza
Instituição-sede: Instituto de Zootecnia. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Nova Odessa , SP, Brasil
Pesq. associados:Adhemar Zerlotini Neto ; Breno de Oliveira Fragomeni ; Claudia Cristina Paro de Paz ; Daniela Andressa Lino Lourenco ; Fernando Sebastián Baldi Rey
Vinculado ao auxílio:17/50339-5 - Plano de desenvolvimento institucional de pesquisa do Instituto de Zootecnia (PDIp), AP.PDIP
Bolsa(s) vinculada(s):20/03699-9 - Fenotipagem para termotolerância, eficiência alimentar e resistência a carrapatos em bovinos Caracu, BP.TT
19/17251-2 - Banco de dados fenotípicos para características de adaptabilidade e produção em bovinos Caracu, BP.TT
19/10438-0 - Análise integrada do transcriptoma e proteoma para identificação de biomarcadores para eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato em bovinos Caracu, BP.JP
Assunto(s):Genômica  Análise de sequência de RNA  Proteômica  Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR)  Bos taurus taurus  Gado Caracu  Transcriptoma  Proteoma  Biomarcadores  Eficiência alimentar  Doenças transmitidas por carrapatos 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bos taurus taurus | proteômica | qPCR | sequenciamento de RNA | Genômica Animal

Resumo

Caracu é uma raça taurina adaptada ao clima tropical e subtropical brasileiro que mantém as características de qualidade de carne de um taurino, combinada com a habilidade de se desenvolver eficientemente em qualquer região do Brasil. Desse modo, a raça Caracu apresenta um excelente material genético para auxiliar na elucidação dos mecanismos que controlam características complexas. O projeto proposto tem como objetivo identificar biomarcadores para estresse térmico, eficiência alimentar e resistência ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus por meio da análise do transcriptoma integrado de sangue periférico e proteínas plasmáticas de animais da raça Caracu. As amostras de RNA serão obtidas a partir de sangue periférico e bibliotecas de RNA total e de miRNA serão construídas e sequenciadas via HiSeq2500. As análises proteômica serão realizadas por eletroforese em gel (SDS-PAGE) e espectrometria de massa (LC-MS/MS). Os genes mais significantes serão validados por PCR em tempo real. A elucidação dos mecanismos que controlam as características de termotolerância e eficiência alimentar, bem como a compreensão dos mecanismos biológicos responsáveis pelas interações vetor-hospedeiro contribuirão para o desenvolvimento de estratégias inovadoras relacionadas a essas características. Este projeto é pioneiro na descrição do transcriptoma integrado e proteoma da raça Caracu, a partir do qual serão identificados genes, novos alelos, RNAs funcionais, transcritos alternativos, polimorfismos, proteínas e novas isoformas que contribuem para as diferenças fenotípicas observadas para cada uma das características estudadas. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LIMA, SERGIO B. G. P. N. P.; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; PIRES, BIANCA V.; BONILHA, SARAH F. M.; CYRILLO, JOSLAINE N. S. G.; NEGRAO, JOAO A.; PAZ, CLAUDIA C. P.. Effect of high temperature on physiological parameters of Nelore (Bos taurus indicus) and Caracu (Bos taurus taurus) cattle breeds. TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION, v. 52, n. 5, . (18/19216-7, 19/10438-0, 16/19222-1)
PIRES, B. V.; STAFUZZA, N. B.; LIMA, S. B. G. P. N. P.; NEGRAO, J. A.; PAZ, C. C. P.. Differential expression of heat shock protein genes associated with heat stress in Nelore and Caracu beef cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 230, . (18/19216-7, 19/10438-0, 16/19222-1)

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