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Modificações pós-traducionais nos processos biológicos e no diagnóstico da Doença de Chagas: novas abordagens metodológicas e implicações biológicas

Processo: 18/15549-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores - Fase 2
Vigência: 01 de outubro de 2019 - 30 de setembro de 2024
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Giuseppe Palmisano
Beneficiário:Giuseppe Palmisano
Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Cláudio Romero Farias Marinho ; Maria Julia Manso Alves
Vinculado ao auxílio:14/06863-3 - Modificações pós-traducionais para o diagnóstico de câncer e doenças parasitárias: abordagens metodológicas e implicações biológicas, AP.JP
Auxílios(s) vinculado(s):20/04923-0 - Glicosilação do SARS-CoV-2 para identificação das características estruturais da COVID-19, AP.R
19/08796-5 - Nova nanoemulsão para melhor eficácia e segurança do benznidazol no tratamento da Doença de Chagas, AP.R SPRINT
Bolsa(s) vinculada(s):22/09915-0 - Modulação da maquinaria de N-glicosilação do hospedeiro durante a infecção pelo Trypanosoma cruzi, BP.DR
22/00796-9 - Desvendando o papel biológico da glicosilação de proteínas do T. cruzi, BP.PD
21/14179-9 - O papel do retículo endoplasmático na virulência de infecções virais e parasitárias, BP.DD
21/14751-4 - Novas metodologias analíticas baseadas em espectrometria de massas para o estudo de modificações pós-traducionais de proteínas, BP.PD
21/00140-3 - Desenvolvimento e otimização de métodos de enriquecimento de proteínas arginiladas em matrizes biológicas complexas, BP.DR
Assunto(s):Proteômica  Doença de Chagas  Diagnóstico  Espectrometria de massas  Trypanosoma cruzi  Pesquisa médica translacional  Processos biológicos  Modificação traducional de proteínas 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Chagas Disease | Cruzi | Post-translational modifications | protein glycosylation | Proteomics | T | Mass spectrometry applied to PTMs

Resumo

A Doença de Chagas, causada pelo parasita protozoário T. cruzi, é uma doença negligenciada, que pode levar à Cardiomiopatia, além de complicações neurológicas e "megaviscera". Essa doença foi descrita há mais de 100 anos e continua afetando cerca de 8 milhões de pessoas, sendo muitas delas não diagnosticadas. Embora endêmica na América do Sul, foi reconhecida como um problema de saúde pública mundial devido à migração da população global. Apesar dos grandes esforços para controlar a transmissão de T. cruzi e introduzir novas opções terapêuticas, ainda não existem marcadores diagnósticos sensíveis e específicos para resposta ao tratamento e progressão da doença. Além disso, uma melhor compreensão da interação T. cruzi-hospedeiro ajudará a priorizar novos alvos terapêuticos. Este projeto é dividido em três partes: 1) desenvolvimento de método analítico para o estudo de modificações pós-traducionais (MPTs); 2) elucidação do papel da glicosilação e arginilação de proteínas na interação T. cruzi-hospedeiro; e 3) descoberta e validação de biomarcadores para a Doença de Chagas. O desenvolvimento de novos métodos analíticos para análise de MPTs oferecerá a possibilidade de detectar modificações de proteínas em sistemas biológicos complexos com alta precisão e sensibilidade, expandindo nosso conhecimento atual. Em particular, a identificação da glicosilação proteica de diferentes cepas de T. cruzi pertencentes às sete DTUs será avaliada e associada à expressão de glicosiltransferases específicas. A análise em larga escala do glicoproteoma de superfície celular e do glicoma, combinada com ensaios funcionais serão utilizados como um determinante molecular ligando a expressão das enzimas de glicosilação e o fenótipo. A caracterização da arginilação de proteínas em T. cruzi e da enzima Tc-Ate1, envolvida neste processo, permitirá compreender o papel desta MPT pouco explorada na biologia da Doença de Chagas. A terceira parte do projeto será focada na implementação de uma plataforma de diagnóstico para a descoberta de biomarcadores protéicos na urina de indivíduos com Doença de Chagas. (AU)

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Publicações científicas (29)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SUMAM DE OLIVEIRA, DAFFINY; KRONENBERGER, THALES; PALMISANO, GIUSEPPE; WRENGER, CARSTEN; DE SOUZA, EDMARCIA ELISA. Targeting SUMOylation in Plasmodium as a Potential Target for Malaria Therapy. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 11, . (18/10150-3, 20/04923-0, 19/26771-0, 20/12277-0, 17/03966-4, 18/18257-1, 18/15549-1, 15/26722-8)
DOMBROWSKI, JAMILLE GREGORIO; BARATEIRO, ANDRE; MACHADO PEIXOTO, ERIKA PAULA; CLAUDIO DA SILVA BARROS, ANDRE BOLER; DE SOUZA, RODRIGO MEDEIROS; CLARK, TAANE GREGORY; CAMPINO, SUSANA; WRENGER, CARSTEN; WUNDERLICH, GERHARD; PALMISANO, GIUSEPPE; et al. Adverse pregnancy outcomes are associated with Plasmodium vivax malaria in a prospective cohort of women from the Brazilian Amazon. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 15, n. 4, . (17/03966-4, 17/03939-7, 18/18257-1, 19/12068-5, 15/26722-8, 17/24267-7, 20/06747-4, 18/20468-0, 20/04923-0, 18/15549-1, 17/05782-8)
CAVALCANTE, TAINA; MEDEIROS, MARIANA MEDINA; MULE, SIMON NGAO; PALMISANO, GIUSEPPE; STOLF, BEATRIZ SIMONSEN. The Role of Sialic Acids in the Establishment of Infections by Pathogens, With Special Focus on Leishmania. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 11, . (17/04032-5, 18/18257-1, 18/15549-1, 18/14972-8)
KAWAHARA, REBECA; RECUERO, SAULO; SROUGI, MIGUEL; LEITE, KATIA R. M.; THAYSEN-ANDERSEN, MORTEN; PALMISANO, GIUSEPPE. The Complexity and Dynamics of the Tissue Glycoproteome Associated With Prostate Cancer Progression. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, v. 20, . (14/06863-3, 15/02866-0, 17/03010-8, 18/15549-1, 18/18257-1)
MARTINS, LARISSA ALMEIDA; PALMISANO, GIUSEPPE; CORTEZ, MAURO; KAWAHARA, REBECA; DE FREITAS BALANCO, JOSE MARIO; FUJITA, ANDRE; ALONSO, BEATRIZ IGLESIAS; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES; BRAZ, GLORIA REGINA CARDOSO; TIRLONI, LUCAS; et al. The intracellular bacterium Rickettsia rickettsii exerts an inhibitory effect on the apoptosis of tick cells. PARASITES & VECTORS, v. 13, n. 1, . (12/24105-3, 18/15549-1, 18/18257-1, 14/11513-1, 07/57749-2, 14/06863-3, 14/05855-7, 13/26450-2)
CAPELLI-PEIXOTO, JANAINA; MULE, SIMON NGAO; TANO, FABIA TOMIE; PALMISANO, GIUSEPPE; STOLF, BEATRIZ SIMONSEN. Proteomics and Leishmaniasis: Potential Clinical Applications. PROTEOMICS CLINICAL APPLICATIONS, v. 13, n. 6, . (17/26197-6, 17/04287-3, 14/26777-4, 14/06863-3, 18/18257-1, 18/15549-1, 17/04032-5)
CHATTERJEE, SAYANTANI; LEE, LING Y.; KAWAHARA, REBECA; ABRAHAMS, JODIE L.; ADAMCZYK, BARBARA; ANUGRAHAM, MERRINA; ASHWOOD, CHRISTOPHER; SUMER-BAYRAKTAR, ZEYNEP; BRIGGS, MATTHEW T.; CHIK, JENNY H. L.; et al. Protein Paucimannosylation Is an Enriched N-Glycosylation Signature of Human Cancers. PROTEOMICS, v. 19, n. 21-22, SI, . (17/03010-8, 18/15549-1, 15/02866-0, 14/06863-3)
CARNEIRO, ANDREIA; VIANA-GOMES, DIEGO; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; OLIVEIRA LIMA, GISCARD HUMBERTO; MITRI, SIMONE; ALVES, SERGIO RABELLO; KOLLIARI-TURNER, ALEXANDER; ZANOTELI, EDMAR; DE AQUINO NETO, FRANCISCO RADLER; PALMISANO, GIUSEPPE; et al. Risk factors and future directions for preventing and diagnosing exertional rhabdomyolysis. Neuromuscular Disorders, v. 31, n. 7, p. 583-595, . (20/04923-0, 18/15549-1, 18/18257-1)
KISCHKEL, BRENDA; BONICHE-ALFARO, CAMILA; MENEZES, ISABELA DE GODOY; ROSSI, SUELEN ANDREIA; ANGELI, CLAUDIA BLANES; DE ALMEIDA, SANDRO ROGERIO; PALMISANO, GIUSEPPE; LOPES-BEZERRA, LEILA; NOSANCHUK, JOSHUA D.; TABORDA, CARLOS PELLESCHI. Immunoproteomic and Immunopeptidomic Analyses of Histoplasma capsulatum Reveal Promiscuous and Conserved Epitopes Among Fungi With Vaccine Potential. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 12, . (18/18257-1, 16/08730-6, 14/06863-3, 17/25780-0, 18/26402-1, 18/15549-1)
MULE, SIMON NGAO; SAAD, JOYCE SILVA; FERNANDES, LIVIA ROSA; STOLF, BEATRIZ S.; CORTEZ, MAURO; PALMISANO, GIUSEPPE. Protein glycosylation inLeishmaniaspp.. MOLECULAR OMICS, v. 16, n. 5, p. 407-424, . (20/04923-0, 18/15549-1, 16/23689-2, 17/04032-5)
MULE, SIMON NGAO; GOMES, VINICIUS DE MORAIS; WAILEMANN, ROSANGELA A. M.; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; ROSA-FERNANDES, LIVIA; LARSEN, MARTIN R.; LABRIOLA, LETICIA; PALMISANO, GIUSEPPE. HSPB1 influences mitochondrial respiration in ER-stressed beta cells. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1869, n. 9, . (17/04032-5, 14/02745-6, 17/03618-6, 18/18257-1, 16/04676-7, 20/04923-0, 16/14845-0, 13/07937-8, 18/15549-1, 21/00507-4)
LAZARI, LUCAS CARDOSO; GHILARDI, FABIO DE ROSE; ROSA-FERNANDES, LIVIA; ASSIS, DIEGO M.; NICOLAU, JOSE CARLOS; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; DALCOQUIO, TALIA FALCAO; ANGELI, CLAUDIA B.; BERTOLIN, ADRIADNE JUSTI; MARINHO, CLAUDIO R. F.; et al. Prognostic accuracy of MALDI-TOF mass spectrometric analysis of plasma in COVID-19. LIFE SCIENCE ALLIANCE, v. 4, n. 8, . (20/04705-2, 18/15549-1, 17/03966-4, 15/26722-8, 18/20468-0, 20/04923-0, 18/18257-1)
COUTINHO, JOAO V. P.; ROSA-FERNANDES, LIVIA; MULE, SIMON NGAO; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; MANCHOLA, NUBIA CAROLINA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; COLLI, WALTER; WRENGER, CARSTEN; MANSO ALVES, MARIA JULIA; PALMISANO, GIUSEPPE. The thermal proteome stability profile of Trypanosoma cruzi in epimastigote and trypomastigote life stages. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 248, . (18/13283-4, 18/15549-1, 14/06863-3, 17/03966-4, 15/26722-8, 17/19854-0, 17/04032-5, 18/18257-1)
MULE, SIMON NGAO; ROSA-FERNANDES, LIVIA; COUTINHO, JOAO V. P.; GOMES, VINICIUS DE MORAIS; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; QUINA, DANIEL; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; THAYSEN-ANDERSEN, MORTEN; LARSEN, MARTIN R.; et al. Systems-wide analysis of glycoprotein conformational changes by limited deglycosylation assay. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 248, . (18/15549-1, 13/07937-8, 20/04923-0, 17/04032-5, 18/18257-1)
GOMES, LAURA CORDEIRO; SANSON, MARINA CORDEIRO GOMES; BRAININ, PHILIP; DE MELO, MARIA DA CONCEICAO VIEIRA; DE SOUZA, RODRIGO MEDEIROS; MAZARO, JANAINA; LIMA, KARINE OLIVEIRA; RESENDE, JUNIA SILVA; VIEIRA, ISABELLE VICTORIA MARTINS; MESQUITA, EDINILSON DA SILVA; et al. Levels of hepatitis B antibody titers are affected by age and doses gap time in children from a high endemic area of the western Amazon. PLoS One, v. 16, n. 7, . (18/20468-0, 18/18257-1, 18/15549-1, 15/26722-8, 14/06863-3)
MULE, S. N.; MANCHOLA, N. C.; DE OLIVEIRA, G. S.; PEREIRA, M.; MAGALHAES, R. D. M.; TEIXEIRA, A. A.; COLLI, W.; ALVES, M. J. M.; PALMISANO, G.. Proteome-wide modulation of S-nitrosylation in Trypanosoma cruzi trypomastigotes upon interaction with the host extracellular matrix. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 231, . (14/25494-9, 14/10046-0, 18/03727-2, 17/04032-5, 18/18257-1, 18/13283-4, 18/15549-1, 12/03887-3)
MISERANI MAGALHAES, RUBENS DANIEL; MATTOS, ELICIANE CEVOLANI; ROZANSKI, ANDREI; FAVORETTO GALANTE, PEDRO ALEXANDRE; PALMISANO, GIUSEPPE; CRUZ, ANGELA KAYSEL; COLLI, WALTER; CAMARGO, ANAMARIA ARANHA; MANSO ALVES, MARIA JULIA. Global changes in nitration levels and DNA binding profile of Trypanosoma cruzi histones induced by incubation with host extracellular matrix. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 5, . (14/10046-0, 13/16002-2, 18/15549-1, 18/18257-1, 14/25494-9, 14/06863-3)
KAWAHARA, REBECA; CHERNYKH, ANASTASIA; ALAGESAN, KATHIRVEL; BERN, MARSHALL; CAO, WEIQIAN; CHALKLEY, ROBERT J.; CHENG, KAI; CHOO, MATTHEW S.; EDWARDS, NATHAN; GOLDMAN, RADOSLAV; et al. Community evaluation of glycoproteomics informatics solutions reveals high-performance search strategies for serum glycopeptide analysis. NATURE METHODS, v. 18, n. 11, p. 1304+, . (18/15549-1)
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SOUZA JUNIOR, DOUGLAS RICARDO; MARTINS SILVA, AMANDA RIBEIRO; ROSA-FERNANDES, LIVIA; REIS, LORENNA ROCHA; ALEXANDRIA, GABRIELLY; BHOSALE, SANTOSH D.; GHILARDI, FABIO DE ROSE; DALCOQUIO, TALIA FALCAO; BERTOLIN, ADRIADNE JUSTI; NICOLAU, JOSE CARLOS; et al. HDL proteome remodeling associates with COVID-19 severity. JOURNAL OF CLINICAL LIPIDOLOGY, v. 15, n. 6, p. 796-804, . (15/26722-8, 16/00696-3, 20/04923-0, 19/25702-4, 17/07725-1, 18/15549-1, 18/18257-1, 13/07937-8)
LATROFA, MARIA STEFANIA; PALMISANO, GIUSEPPE; ANNOSCIA, GIADA; PIERRI, CIRO LEONARDO; CHANDRASHEKAR, RAMASWAMY; OTRANTO, DOMENICO. Major antigen and paramyosin proteins as candidate biomarkers for serodiagnosis of canine infection by zoonotic Onchocerca lupi. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 15, n. 2, . (17/04032-5, 18/18257-1, 14/06863-3, 18/15549-1)
LAZARI, LUCAS C.; ZERBINATI, RODRIGO M.; ROSA-FERNANDES, LIVIA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; ROSA, KLAISE F.; ANGELI, CLAUDIA B.; SCHWAB, GABRIELA; PALMIERI, MICHELLE; SARMENTO, DMITY J. S.; MARINHO, CLAUDIO R. F.; et al. ALDI-TOF mass spectrometry of saliva samples as a prognostic tool for COVID-1. OURNAL OF ORAL MICROBIOLOG, v. 14, n. 1, . (18/15549-1, 20/06409-1, 20/04923-0, 18/18257-1, 15/26722-8, 17/03966-4, 21/07490-0, 18/20468-0)
LIMA, GUILHERME MEIRA; EFFER, BRIAN; BIASOTO, HENRIQUE PELLIN; FEIJOLI, VERONICA; PESSOA, ADALBERTO; PALMISANO, GIUSEPPE; MONTEIRO, GISELE. Glycosylation of L-asparaginase from E. coli through yeast expression and site-directed mutagenesis. Biochemical Engineering Journal, v. 156, . (15/07749-2, 13/08617-7, 14/06863-3, 18/18257-1, 18/15549-1, 16/15787-4)
MULE, SIMON NGAO; COSTA-MARTINS, ANDRE GUILHERME; ROSA-FERNANDES, LIVIA; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; RODRIGUES, CARLA MONADELI F.; QUINA, DANIEL; ROSEIN, GRAZIELLA E.; GERALDES TEIXEIRA, MARTA MARIA; PALMISANO, GIUSEPPE. PhyloQuant approach provides insights into Trypanosoma cruzi evolution using a systems-wide mass spectrometry-based quantitative protein profile. COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 4, n. 1, . (18/13283-4, 17/04032-5, 14/06863-3, 18/15549-1, 18/18257-1, 14/25494-9)
GAVINHO, BRUNO; SABATKE, BRUNA; FEIJOLI, VERONICA; ROSSI, IZADORA VOLPATO; DA SILVA, JANAINA MACEDO; EVANS-OSSES, INGRID; PALMISANO, GIUSEPPE; LANGE, SIGRUN; RAMIREZ, MARCEL IVAN. Peptidylarginine Deiminase Inhibition Abolishes the Production of Large Extracellular Vesicles FromGiardia intestinalis, Affecting Host-Pathogen Interactions by Hindering Adhesion to Host Cells. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 10, . (18/15549-1, 18/18257-1, 14/06863-3)
ROSA-FERNANDES, LIVIA; BARBOSA, RAQUEL HORA; DOS SANTOS, MARIA LUIZA B.; ANGELI, CLAUDIA B.; SILVA, THIAGO P.; MELO, ROSSANA C. N.; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; LEMOS, BERNARDO; VAN EYK, JENNIFER E.; LARSEN, MARTIN R.; et al. Cellular Imprinting Proteomics Assay: A Novel Method for Detection of Neural and Ocular Disorders Applied to Congenital Zika Virus Syndrome. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 19, n. 11, p. 4496-4515, . (18/15549-1, 18/18257-1, 14/06863-3)
RODRIGUES, MARIANE A. D.; PIMENTA, MARCELA V.; COSTA, IRIS M.; ZENATTI, PRISCILA P.; MIGITA, NATACHA A.; YUNES, JOSE A.; RANGEL-YAGUI, CARLOTA O.; DE SA, MATHEUS M.; PESSOA, ADALBERTO; COSTA-SILVA, TALES A.; et al. Influence of lysosomal protease sensitivity in the immunogenicity of the antitumor biopharmaceutical asparaginase. Biochemical Pharmacology, v. 182, . (14/06863-3, 18/18257-1, 13/08617-7, 16/25896-5, 15/07749-2, 18/15104-0, 13/08139-8, 18/15549-1)
MOREIRA, RAFAEL J.; CASTRO, ERIQUE; OLIVEIRA, TIAGO E.; BELCHIOR, THIAGO; PEIXOTO, ALBERT S.; CHAVES-FILHO, ADRIANO B.; MORENO, MAYARA F.; LIMA, JANAYNA D.; YOSHINAGA, MARCOS; MIYAMOTO, SAYURI; et al. Lipoatrophy-Associated Insulin Resistance and Hepatic Steatosis are Attenuated by Intake of Diet Rich in Omega 3 Fatty Acids. MOLECULAR NUTRITION & FOOD RESEARCH, v. 64, n. 7, . (13/07467-1, 16/04000-3, 17/17943-6, 15/19530-5, 14/06863-3, 18/15549-1, 13/07937-8)
KAWAHARA, REBECA; RECUERO, SAULO; NOGUEIRA, FABIO C. S.; DOMONT, GILBERTO B.; LEITE, KATIA R. M.; SROUGI, MIGUEL; THAYSEN-ANDERSEN, MORTEN; PALMISANO, GIUSEPPE. Tissue Proteome Signatures Associated with Five Grades of Prostate Cancer and Benign Prostatic Hyperplasia. PROTEOMICS, v. 19, n. 21-22, SI, . (18/15549-1, 15/02866-0, 18/18257-1, 17/03010-8, 14/06863-3)

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