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Biologia integrativa aplicada à saúde humana

Processo: 18/14933-2
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores - Fase 2
Vigência: 01 de maio de 2019 - 30 de abril de 2024
Área do conhecimento:Interdisciplinar
Pesquisador responsável:Helder Takashi Imoto Nakaya
Beneficiário:Helder Takashi Imoto Nakaya
Instituição Sede: Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein (IIEPAE). Sociedade Beneficente Israelita Brasileira Albert Einstein (SBIBAE). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Esper Georges Kallás ; Fernando Augusto Bozza ; Frederico Moraes Ferreira ; Luciano da Fontoura Costa ; Luis Carlos de Souza Ferreira ; Mario Hiroyuki Hirata ; Paola Marcella Camargo Minoprio ; Patricia Cristina Baleeiro Beltrão Braga ; Ricardo Tostes Gazzinelli ; Sergio Schenkman ; Vanderson de Souza Sampaio
Vinculado ao auxílio:12/19278-6 - Biologia de sistemas de longos RNAs não-codificadores, AP.JP
Auxílios(s) vinculado(s):19/16444-1 - Aplicação da imunologia de sistemas para a resolução dos mecanismos de proteção contra a Peste Suína Clássica induzida por vacina, AP.R SPRINT
Bolsa(s) vinculada(s):20/05284-0 - Interação de microrganismos e hospedeiros humanos associados ao desfecho clínico de pacientes com doenças infecciosas, BP.DD
20/12017-9 - Aprendizado de máquina para interpretação de análise de imagens microscópicas, BP.PD
19/27139-5 - Aplicação de ferramentas genômicas para o estudo de bases de dados epidemiológicos, BP.DD
19/27146-1 - Integração de dados de transcriptoma com dados clínicos e imunológicos, BP.DD
19/16419-7 - Estudo da transmissão de doenças usando celular de pessoas infectadas, BP.DD
Assunto(s):Imunologia  Epidemiologia  Biologia computacional  Biologia de sistemas 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | biologia de sistemas | Epidemiologia | Imunologia | integração de dados | Biologia de Sistemas

Resumo

Dados relacionados com a saúde humana, desde informações clínicas e epidemiológicas até imagens médicas e experimentos ômicos, estão sendo gerados e acumulados em uma quantidade sem precedentes na história. A análise e integração destas informações são fundamentais para melhorar nosso entendimento sobre a fisiopatologia das doenças, sua transmissão, assim como seu diagnóstico e tratamento. Este projeto propõe abordagens inovadoras para: analisar imensas bases de dados epidemiológicos; mapear hotspots de transmissão de doenças; integrar dados de transcritoma com dados clínicos e imunológicos; e usar aprendizado de máquina para interpretação e análise de imagens microscópicas. Técnicas atuais e modernas de análises de biologia de sistemas e aprendizado de máquina serão utilizadas e até mesmo desenvolvidas para cada abordagem, levando em conta os fundamentos da biologia integrativa. Espera-se que os resultados do projeto possam esclarecer diversos problemas relacionados à saúde humana, da análise automática de lâminas microscópicas até os mecanismos moleculares de doenças infecciosas e inflamatórias. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio::
Aplicativo para localizar enfermidades 
Uma doença assustadora 
Os danos do coronavírus 
Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
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Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
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Publicações científicas (12)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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JIMENEZ, LEANDRO; CODO, ANA CAMPOS; SAMPAIO, VANDERSON DE SOUZA; OLIVEIRA, ANTONIO E. R.; KOBO FERREIRA, LUCAS KAORU; DAVANZO, GUSTAVO GASTAO; MONTEIRO, LAUAR DE BRITO; VIRGILIO-DA-SILVA, JOAO VICTOR; SILVA BORBA, MAYLA GABRIELA; DE SOUZA, GABRIELA FABIANO; et al. Acid pH Increases SARS-CoV-2 Infection and the Risk of Death by COVID-19. FRONTIERS IN MEDICINE, v. 8, . (18/14933-2, 20/04836-0)
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SANTOS E SILVA, JUAN CARLO; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA; YONEHARA NOMA, ISABELLA HARUMI; NORONHA, NATALIA YUMI; AQUINO, RODRIGO; GIDDALURU, JEEVAN; DURAO, LUIZ; COSTA-MARTINS, ANDRE GUILHERME; SCHUCH, VIVIANE; MORAES-VIEIRA, PEDRO M.; et al. Gene signatures of autopsy lungs from obese patients with COVID-19. CLINICAL NUTRITION ESPEN, v. 44, p. 475-478, . (19/27139-5, 18/14933-2, 20/04579-7, 19/27146-1)
AGUIAR, RENATO S.; POHL, FABIO; MORAIS, GUILHERME L.; NOGUEIRA, FABIO C. S.; DE CARVALHO, JOSEANE B.; GUIDA, LETICIA; ARGE, LUIS W. P.; MELO, ADRIANA; MOREIRA, MARIA E. L.; CUNHA, DANIELA P.; et al. Molecular alterations in the extracellular matrix in the brains of newborns with congenital Zika syndrome. Science Signaling, v. 13, n. 635, . (13/08216-2, 12/19278-6, 18/21934-5, 17/50137-3, 18/14933-2)
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