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Dimensions US-BIOTA-Sao Paulo: características preditoras da diversificação adaptativa na Diagonal Seca Brasileira

Processo: 18/03428-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
Vigência: 01 de setembro de 2018 - 31 de agosto de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética
Convênio/Acordo: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
Pesquisador responsável:Vera Nisaka Solferini
Beneficiário:Vera Nisaka Solferini
Pesq. responsável no exterior: Scott Vernon Edwards
Instituição no exterior: Harvard University, Estados Unidos
Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Pesquisadores principais:
Célio Fernando Baptista Haddad ; Evandro Marsola de Moraes ; Fábio Sarubbi Raposo do Amaral ; Fernando de Faria Franco ; Luciano Antonio Digiampietri
Pesq. associados:Célio Fernando Baptista Haddad ; Danilo Trabuco Do Amaral ; Danon Clemes Cardoso ; Evandro Marsola de Moraes ; Fernando de Faria Franco ; Guarino Rinaldi Colli ; Isabel Aparecida da Silva Bonatelli ; Jair Francisco Mendes Júnior ; José Paulo Leite Guadanucci ; Luciano Antonio Digiampietri ; Luciano Nicolas Naka ; Maykon Passos Cristiano ; Thiago Gonçalves Souza
Bolsa(s) vinculada(s):22/02373-8 - Identificação de fenótipos associados a adaptações de Ischnothele (Araneae, Ischnothelidae) na diagonal seca brasileira, BP.IC
22/02669-4 - Filogeografia da espécie de aranhas endêmica de Cerrado Dolichothele mottai Revollo, Silva & Bertani, 2017 (Araneae, Mygalomorphae, Theraphosidae)., BP.MS
20/07556-8 - Bases genéticas da adaptação em tangarás e soldadinhos (Passeriformes: Pipridae) aos habitats Neotropicais, BP.PD
+ mais bolsas vinculadas 20/08998-4 - Assinaturas genômicas de adaptação em Cereus (Cactaceae) na Diagonal Seca Brasileira, BP.DD
20/03148-2 - Integrando dados genéticos, características fenotípicas e fatores abióticos para investigar adaptação de aranhas na Diagonal Seca Brasileira, BP.DD
19/11233-2 - Filogenia, biogeografia e evolução de caracteres dos gêneros Melocactus link & Otto e Discocactus Pfeiff (Cactaceae), BP.DD
19/17077-2 - Sinais genômicos de adaptação na Diagonal Seca Brasileira, BP.PD
19/04350-2 - Dimensions US-BIOTA-São Paulo: características preditoras da diversificação adaptativa na Diagonal Seca Brasileira, BP.IC - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Biogeografia  Filogenia  Filogeografia  Biodiversidade  Bioma  Evolução  Adaptação  Caatinga  Cerrado 

Resumo

A Diagonal Seca (DD) contém os biomas Caatinga e Cerrado, que abrangem cerca de 1/3 da área do Brasil, além do Chaco, ao norte da Argentina. Por supostamente possuir uma menor biodiversidade em relação a biomas mais bem estudados, como a Amazônia e a Floresta Atlântica, os processos evolutivos na DD têm recebido relativamente menos atenção, ainda que seus biomas, especialmente o Cerrado, provavelmente estejam entre os ambientes mais ameaçados do Brasil. O Projeto Dimensions Diagonal Seca usará uma abordagem baseada em caracteres em múltiplos níveis para entender as origens e processos adaptativos de plantas, animais e fungos na Diagonal Seca Brasileira. Usaremos metodologias de aprendizagem de máquina para identificar as características que facilitaram ou dificultaram a especiação das linhagens que colonizaram a DD. Também determinaremos de que modo os biomas da DD atuaram no estabelecimento das comunidades a partir dos conjuntos de espécies de habitats adjacentes (Amazônia, Floresta Atlântica, etc.) usando uma abordagem de filogenética de comunidades baseada em caracteres, que leva em conta associações ao acaso, competição e filtragem de habitat. Além disso, por meio de sequenciamento de nova geração conduziremos estudos filogeográficos comparativos de múltiplas linhagens, sequenciamento e re-sequenciamento de genomas totais e transcriptoma para identificar os agentes da adaptação e divergência fenotípica a nível de genoma, nos habitats mais importantes e menos conhecidos do Brasil. (AU)

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Publicações científicas (11)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ROBERTO, IGOR JOVENTINO; LOEBMANN, DANIEL; LYRA, MARIANA L.; HADDAD, CELIOF B.; AVILA, ROBSON WALDEMAR. new species of Pristimantis Jimenez de la Espada, 1870 (Anura: Strabomantidae) from the ``Brejos de Altitude{''} in Northeast Brazi. Zootaxa, v. 5100, n. 4, p. 521-540, FEB 22 2022. Citações Web of Science: 0.
THOM, GREGORY; GEHARA, MARCELO; SMITH, BRIAN TILSTON; MIYAKI, CRISTINA Y.; DO AMARAL, FABIO RAPOSO. Microevolutionary dynamics show tropical valleys are deeper for montane birds of the Atlantic Forest. NATURE COMMUNICATIONS, v. 12, n. 1 NOV 1 2021. Citações Web of Science: 0.
AMARAL, DANILO TRABUCO; BOMBONATO, JULIANA RODRIGUES; DA SILVA ANDRADE, SONIA CRISTINA; MORAES, EVANDRO MARSOLA; FRANCO, FERNANDO FARIA. The genome of a thorny species: comparative genomic analysis among South and North American Cactaceae. PLANTA, v. 254, n. 3 SEP 2021. Citações Web of Science: 0.
THOME, MARIA TEREZA C.; CARSTENS, BRYAN C.; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; GALETTI JR, PEDRO MANOEL JR; ALEXANDRINO, JOAO; HADDAD, CELIO F. B. A role of asynchrony of seasons in explaining genetic differentiation in a Neotropical toad. HEREDITY, v. 127, n. 4 JUL 2021. Citações Web of Science: 1.
GHIROTTO, VICTOR MORAIS; INDICATTI, RAFAEL PREZZI; LEITE GUADANUCCI, JOSE PAULO. The genus Stenoterommata Holmberg, 1881 (Araneae, Pycnothelidae) in the Cerrado and Atlantic Forest from Southeastern and Central Brazil: description of four new species. ZOOSYSTEMA, v. 43, n. 17, p. 311-339, JUN 15 2021. Citações Web of Science: 0.
PAZ, ANDREA; BROWN, JASON L.; CORDEIRO, CARLOS L. O.; AGUIRRE-SANTORO, JULIAN; ASSIS, CLAYDSON; AMARO, RENATA CECILIA; RAPOSO DO AMARAL, FABIO; BOCHORNY, THUANE; BACCI, LUCAS F.; CADDAH, MAYARA K.; D'HORTA, FERNANDO; KAEHLER, MIRIAM; LYRA, MARIANA; GROHMANN, CARLOS HENRIQUE; REGINATO, MARCELO; SILVA-BRANDAO, KARINA LUCAS; FREITAS, ANDRE VICTOR LUCCI; GOLDENBERG, RENATO; LOHMANN, LUCIA G.; MICHELANGELI, FABIAN A.; MIYAKI, CRISTINA; RODRIGUES, MIGUEL T.; SILVA, THIAGO S.; CARNAVAL, ANA C. Environmental correlates of taxonomic and phylogenetic diversity in the Atlantic Forest. Journal of Biogeography, v. 48, n. 6 MAR 2021. Citações Web of Science: 1.
THOME, MARIA TEREZA C.; CARSTENS, BRYAN C.; RODRIGUES, MIGUEL T.; ALEXANDRINO, JOAO; HADDAD, CELIO F. B. Genomic data from the Brazilian sibilator frog reveal contrasting pleistocene dynamics and regionalism in two South American dry biomes. Journal of Biogeography, v. 48, n. 5 FEB 2021. Citações Web of Science: 0.
CAMURUGI, FELIPE; GEHARA, MARCELO; FONSECA, EMANUEL M.; ZAMUDIO, KELLY R.; HADDAD, CELIO F. B.; COLLI, GUARINO R.; THOME, MARIA TEREZA C.; PRADO, CYNTHIA P. A.; NAPOLI, MARCELO F.; GARDA, ADRIAN A. Isolation by environment and recurrent gene flow shaped the evolutionary history of a continentally distributed Neotropical treefrog. Journal of Biogeography, v. 48, n. 4 DEC 2020. Citações Web of Science: 1.
BOMBONATO, JULIANA RODRIGUES; DO AMARAL, DANILO TRABUCO; RODRIGUES SILVA, GISLAINE ANGELICA; KHAN, GULZAR; MORAES, EVANDRO M.; DA SILVA ANDRADE, SONIA CRISTINA; EATON, DEREN A. R.; ALONSO, DIEGO PERES; MARTINS RIBOLLA, PAULO EDUARDO; TAYLOR, NIGEL; ZAPPI, DANIELA; FRANCO, FERNANDO FARIA. The potential of genome-wide RAD sequences for resolving rapid radiations: a case study in Cactaceae. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 151, OCT 2020. Citações Web of Science: 0.
THOM, GREGORY; SMITH, BRIAN TILSTON; GEHARA, MARCELO; MONTESANTI, JULIA; LIMA-RIBEIRO, MATHEUS S.; PIACENTINI, VITOR Q.; MIYAKI, CRISTINA Y.; DO AMARAL, FABIO RAPOSO. Climatic dynamics and topography control genetic variation in Atlantic Forest montane birds. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 148, JUL 2020. Citações Web of Science: 0.
DO NASCIMENTO SANTIAGO, CAIO RAFAEL; BARBOSA ASSIS, RENATA DE ALMEIDA; MOREIRA, LEANDRO MARCIO; DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO. Gene Tags Assessment by Comparative Genomics (GTACG ): A User-Friendly Framework for Bacterial Comparative Genomics. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, AUG 26 2019. Citações Web of Science: 0.

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