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EMU concedido no processo 14/06863-3: sistema de cromatografia líquida configurado para análise de carboidratos, aminoácidos, peptídeos e glicoproteínas

Processo: 18/18257-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
Vigência: 01 de novembro de 2018 - 31 de outubro de 2025
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Giuseppe Palmisano
Beneficiário:Giuseppe Palmisano
Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/06863-3 - Modificações pós-traducionais para o diagnóstico de câncer e doenças parasitárias: abordagens metodológicas e implicações biológicas, AP.JP
Assunto(s):Aminoácidos  Cromatografia líquida de alta pressão  Glicoproteínas  Peptídeos  Carboidratos 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:aminoácidos | Carboidratos | glicoproteínas | Hplc | peptídeos | Modificações pós-traducionais
As informações de acesso ao Equipamento Multiusuário são de responsabilidade do Pesquisador responsável
Página web do EMU:https://sites.usp.br/proteomics/equipamentos-multiusuario/
Tipo de equipamento:Caracterização de Materiais - Análises Químicas - Cromatrografia líquida
Fabricante: Thermo Scientific
Modelo: ICS + detectores UV + fluorescência + eletroquímico

Resumo

Pretendemos construir uma plataforma analítica para a identificação e quantificação de glicanos. A análise de mono, oligo e polissacarídeos possibilitará o estudo da modulação dos glicanos em células, tecidos e fluidos biológicos em diferentes sistemas biológicos. A expressão diferencial de glicanos tem sido associada a diversas doenças, tais como câncer, doenças infecciosas entre outras. Em particular, glicoproteínas, glicolipídios, proteoglicanos e outros glico-conjugados foram sugeridos como possíveis candidatos a biomarcadores e alvos terapêuticos. Portanto, sua análise e caracterização estrutural é importante para elucidar plenamente o glicoma em condições fisiopatológicas (AU)

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Publicações científicas (26)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
KAWAHARA, REBECA; RECUERO, SAULO; NOGUEIRA, FABIO C. S.; DOMONT, GILBERTO B.; LEITE, KATIA R. M.; SROUGI, MIGUEL; THAYSEN-ANDERSEN, MORTEN; PALMISANO, GIUSEPPE. Tissue Proteome Signatures Associated with Five Grades of Prostate Cancer and Benign Prostatic Hyperplasia. PROTEOMICS, v. 19, n. 21-22, SI, . (18/15549-1, 15/02866-0, 18/18257-1, 17/03010-8, 14/06863-3)
MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; SANTIAGO, VERONICA F.; ROSA-FERNANDES, LIVIA; MARINHO, CLAUDIO R. F.; PALMISANO, GIUSEPPE. Protein glycosylation in extracellular vesicles: Structural characterization and biological functions. Molecular Immunology, v. 135, p. 226-246, . (18/15549-1, 18/20468-0, 18/18257-1, 20/04923-0)
MULE, SIMON NGAO; COSTA-MARTINS, ANDRE GUILHERME; ROSA-FERNANDES, LIVIA; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; RODRIGUES, CARLA MONADELI F.; QUINA, DANIEL; ROSEIN, GRAZIELLA E.; GERALDES TEIXEIRA, MARTA MARIA; PALMISANO, GIUSEPPE. PhyloQuant approach provides insights into Trypanosoma cruzi evolution using a systems-wide mass spectrometry-based quantitative protein profile. COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 4, n. 1, . (18/13283-4, 17/04032-5, 14/06863-3, 18/15549-1, 18/18257-1, 14/25494-9)
ROSA-FERNANDES, LIVIA; BANDEIRA, CARLA; POUR, SHAHAB ZAKI; BENEDETTI, VIVIANE DE FATIMA; FERREIRA, DANIEL; LORENZON, ALINE R.; MORELI, JUSCIELE B.; MARINHO, CLAUDIO ROMERO FARIAS; LARSEN, MARTIN R.; ZANOTTO, PAOLO; et al. The impact of Zika virus exposure on the placental proteomic profile. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE, v. 1868, n. 1, . (20/04923-0, 18/18257-1)
SOUZA JUNIOR, DOUGLAS RICARDO; MARTINS SILVA, AMANDA RIBEIRO; ROSA-FERNANDES, LIVIA; REIS, LORENNA ROCHA; ALEXANDRIA, GABRIELLY; BHOSALE, SANTOSH D.; GHILARDI, FABIO DE ROSE; DALCOQUIO, TALIA FALCAO; BERTOLIN, ADRIADNE JUSTI; NICOLAU, JOSE CARLOS; et al. HDL proteome remodeling associates with COVID-19 severity. JOURNAL OF CLINICAL LIPIDOLOGY, v. 15, n. 6, p. 796-804, . (18/18257-1, 18/15549-1, 19/25702-4, 20/04923-0, 17/07725-1, 15/26722-8, 13/07937-8, 16/00696-3)
LATROFA, MARIA STEFANIA; PALMISANO, GIUSEPPE; ANNOSCIA, GIADA; PIERRI, CIRO LEONARDO; CHANDRASHEKAR, RAMASWAMY; OTRANTO, DOMENICO. Major antigen and paramyosin proteins as candidate biomarkers for serodiagnosis of canine infection by zoonotic Onchocerca lupi. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 15, n. 2, . (18/18257-1, 17/04032-5, 18/15549-1, 14/06863-3)
GOMES, LAURA CORDEIRO; SANSON, MARINA CORDEIRO GOMES; BRAININ, PHILIP; DE MELO, MARIA DA CONCEICAO VIEIRA; DE SOUZA, RODRIGO MEDEIROS; MAZARO, JANAINA; LIMA, KARINE OLIVEIRA; RESENDE, JUNIA SILVA; VIEIRA, ISABELLE VICTORIA MARTINS; MESQUITA, EDINILSON DA SILVA; et al. Levels of hepatitis B antibody titers are affected by age and doses gap time in children from a high endemic area of the western Amazon. PLoS One, v. 16, n. 7, . (18/20468-0, 18/18257-1, 18/15549-1, 15/26722-8, 14/06863-3)
LAZARI, LUCAS C.; ZERBINATI, RODRIGO M.; ROSA-FERNANDES, LIVIA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; ROSA, KLAISE F.; ANGELI, CLAUDIA B.; SCHWAB, GABRIELA; PALMIERI, MICHELLE; SARMENTO, DMITY J. S.; MARINHO, CLAUDIO R. F.; et al. ALDI-TOF mass spectrometry of saliva samples as a prognostic tool for COVID-1. OURNAL OF ORAL MICROBIOLOG, v. 14, n. 1, . (18/15549-1, 20/06409-1, 20/04923-0, 18/18257-1, 15/26722-8, 17/03966-4, 21/07490-0, 18/20468-0)
LIMA, GUILHERME MEIRA; EFFER, BRIAN; BIASOTO, HENRIQUE PELLIN; FEIJOLI, VERONICA; PESSOA, ADALBERTO; PALMISANO, GIUSEPPE; MONTEIRO, GISELE. Glycosylation of L-asparaginase from E. coli through yeast expression and site-directed mutagenesis. Biochemical Engineering Journal, v. 156, . (15/07749-2, 13/08617-7, 14/06863-3, 18/18257-1, 18/15549-1, 16/15787-4)
GAVINHO, BRUNO; SABATKE, BRUNA; FEIJOLI, VERONICA; ROSSI, IZADORA VOLPATO; DA SILVA, JANAINA MACEDO; EVANS-OSSES, INGRID; PALMISANO, GIUSEPPE; LANGE, SIGRUN; RAMIREZ, MARCEL IVAN. Peptidylarginine Deiminase Inhibition Abolishes the Production of Large Extracellular Vesicles FromGiardia intestinalis, Affecting Host-Pathogen Interactions by Hindering Adhesion to Host Cells. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 10, . (18/18257-1, 18/15549-1, 14/06863-3)
ROSA-FERNANDES, LIVIA; BARBOSA, RAQUEL HORA; DOS SANTOS, MARIA LUIZA B.; ANGELI, CLAUDIA B.; SILVA, THIAGO P.; MELO, ROSSANA C. N.; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; LEMOS, BERNARDO; VAN EYK, JENNIFER E.; LARSEN, MARTIN R.; et al. Cellular Imprinting Proteomics Assay: A Novel Method for Detection of Neural and Ocular Disorders Applied to Congenital Zika Virus Syndrome. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 19, n. 11, p. 4496-4515, . (18/18257-1, 18/15549-1, 14/06863-3)
RODRIGUES, MARIANE A. D.; PIMENTA, MARCELA V.; COSTA, IRIS M.; ZENATTI, PRISCILA P.; MIGITA, NATACHA A.; YUNES, JOSE A.; RANGEL-YAGUI, CARLOTA O.; DE SA, MATHEUS M.; PESSOA, ADALBERTO; COSTA-SILVA, TALES A.; et al. Influence of lysosomal protease sensitivity in the immunogenicity of the antitumor biopharmaceutical asparaginase. Biochemical Pharmacology, v. 182, . (14/06863-3, 18/18257-1, 13/08617-7, 16/25896-5, 15/07749-2, 18/15104-0, 13/08139-8, 18/15549-1)
MULE, S. N.; MANCHOLA, N. C.; DE OLIVEIRA, G. S.; PEREIRA, M.; MAGALHAES, R. D. M.; TEIXEIRA, A. A.; COLLI, W.; ALVES, M. J. M.; PALMISANO, G.. Proteome-wide modulation of S-nitrosylation in Trypanosoma cruzi trypomastigotes upon interaction with the host extracellular matrix. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 231, . (14/25494-9, 14/10046-0, 18/03727-2, 17/04032-5, 18/18257-1, 18/13283-4, 18/15549-1, 12/03887-3)
MISERANI MAGALHAES, RUBENS DANIEL; MATTOS, ELICIANE CEVOLANI; ROZANSKI, ANDREI; FAVORETTO GALANTE, PEDRO ALEXANDRE; PALMISANO, GIUSEPPE; CRUZ, ANGELA KAYSEL; COLLI, WALTER; CAMARGO, ANAMARIA ARANHA; MANSO ALVES, MARIA JULIA. Global changes in nitration levels and DNA binding profile of Trypanosoma cruzi histones induced by incubation with host extracellular matrix. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 5, . (14/10046-0, 13/16002-2, 18/15549-1, 18/18257-1, 14/25494-9, 14/06863-3)
MARTINS, LARISSA ALMEIDA; PALMISANO, GIUSEPPE; CORTEZ, MAURO; KAWAHARA, REBECA; DE FREITAS BALANCO, JOSE MARIO; FUJITA, ANDRE; ALONSO, BEATRIZ IGLESIAS; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES; BRAZ, GLORIA REGINA CARDOSO; TIRLONI, LUCAS; et al. The intracellular bacterium Rickettsia rickettsii exerts an inhibitory effect on the apoptosis of tick cells. PARASITES & VECTORS, v. 13, n. 1, . (12/24105-3, 18/15549-1, 18/18257-1, 14/11513-1, 07/57749-2, 14/06863-3, 14/05855-7, 13/26450-2)
CAVALCANTE, TAINA; MEDEIROS, MARIANA MEDINA; MULE, SIMON NGAO; PALMISANO, GIUSEPPE; STOLF, BEATRIZ SIMONSEN. The Role of Sialic Acids in the Establishment of Infections by Pathogens, With Special Focus on Leishmania. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 11, . (18/18257-1, 17/04032-5, 18/15549-1, 18/14972-8)
KAWAHARA, REBECA; RECUERO, SAULO; SROUGI, MIGUEL; LEITE, KATIA R. M.; THAYSEN-ANDERSEN, MORTEN; PALMISANO, GIUSEPPE. The Complexity and Dynamics of the Tissue Glycoproteome Associated With Prostate Cancer Progression. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, v. 20, . (18/18257-1, 15/02866-0, 18/15549-1, 17/03010-8, 14/06863-3)
CAPELLI-PEIXOTO, JANAINA; MULE, SIMON NGAO; TANO, FABIA TOMIE; PALMISANO, GIUSEPPE; STOLF, BEATRIZ SIMONSEN. Proteomics and Leishmaniasis: Potential Clinical Applications. PROTEOMICS CLINICAL APPLICATIONS, v. 13, n. 6, . (17/26197-6, 17/04287-3, 14/26777-4, 14/06863-3, 18/18257-1, 18/15549-1, 17/04032-5)
CARNEIRO, ANDREIA; VIANA-GOMES, DIEGO; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; OLIVEIRA LIMA, GISCARD HUMBERTO; MITRI, SIMONE; ALVES, SERGIO RABELLO; KOLLIARI-TURNER, ALEXANDER; ZANOTELI, EDMAR; DE AQUINO NETO, FRANCISCO RADLER; PALMISANO, GIUSEPPE; et al. Risk factors and future directions for preventing and diagnosing exertional rhabdomyolysis. Neuromuscular Disorders, v. 31, n. 7, p. 583-595, . (20/04923-0, 18/15549-1, 18/18257-1)
MULE, SIMON NGAO; GOMES, VINICIUS DE MORAIS; WAILEMANN, ROSANGELA A. M.; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; ROSA-FERNANDES, LIVIA; LARSEN, MARTIN R.; LABRIOLA, LETICIA; PALMISANO, GIUSEPPE. HSPB1 influences mitochondrial respiration in ER-stressed beta cells. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1869, n. 9, . (17/04032-5, 14/02745-6, 17/03618-6, 18/18257-1, 16/04676-7, 20/04923-0, 16/14845-0, 13/07937-8, 18/15549-1, 21/00507-4)
COUTINHO, JOAO V. P.; ROSA-FERNANDES, LIVIA; MULE, SIMON NGAO; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; MANCHOLA, NUBIA CAROLINA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; COLLI, WALTER; WRENGER, CARSTEN; MANSO ALVES, MARIA JULIA; PALMISANO, GIUSEPPE. The thermal proteome stability profile of Trypanosoma cruzi in epimastigote and trypomastigote life stages. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 248, . (18/13283-4, 18/15549-1, 14/06863-3, 17/03966-4, 15/26722-8, 17/19854-0, 17/04032-5, 18/18257-1)
MULE, SIMON NGAO; ROSA-FERNANDES, LIVIA; COUTINHO, JOAO V. P.; GOMES, VINICIUS DE MORAIS; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; QUINA, DANIEL; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; THAYSEN-ANDERSEN, MORTEN; LARSEN, MARTIN R.; et al. Systems-wide analysis of glycoprotein conformational changes by limited deglycosylation assay. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 248, . (18/15549-1, 13/07937-8, 20/04923-0, 17/04032-5, 18/18257-1)
KISCHKEL, BRENDA; BONICHE-ALFARO, CAMILA; MENEZES, ISABELA DE GODOY; ROSSI, SUELEN ANDREIA; ANGELI, CLAUDIA BLANES; DE ALMEIDA, SANDRO ROGERIO; PALMISANO, GIUSEPPE; LOPES-BEZERRA, LEILA; NOSANCHUK, JOSHUA D.; TABORDA, CARLOS PELLESCHI. Immunoproteomic and Immunopeptidomic Analyses of Histoplasma capsulatum Reveal Promiscuous and Conserved Epitopes Among Fungi With Vaccine Potential. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 12, . (18/18257-1, 16/08730-6, 14/06863-3, 17/25780-0, 18/26402-1, 18/15549-1)
SUMAM DE OLIVEIRA, DAFFINY; KRONENBERGER, THALES; PALMISANO, GIUSEPPE; WRENGER, CARSTEN; DE SOUZA, EDMARCIA ELISA. Targeting SUMOylation in Plasmodium as a Potential Target for Malaria Therapy. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 11, . (18/10150-3, 20/04923-0, 19/26771-0, 20/12277-0, 17/03966-4, 18/18257-1, 18/15549-1, 15/26722-8)
DOMBROWSKI, JAMILLE GREGORIO; BARATEIRO, ANDRE; MACHADO PEIXOTO, ERIKA PAULA; CLAUDIO DA SILVA BARROS, ANDRE BOLER; DE SOUZA, RODRIGO MEDEIROS; CLARK, TAANE GREGORY; CAMPINO, SUSANA; WRENGER, CARSTEN; WUNDERLICH, GERHARD; PALMISANO, GIUSEPPE; et al. Adverse pregnancy outcomes are associated with Plasmodium vivax malaria in a prospective cohort of women from the Brazilian Amazon. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 15, n. 4, . (17/03966-4, 17/03939-7, 18/18257-1, 19/12068-5, 15/26722-8, 17/24267-7, 20/06747-4, 18/20468-0, 20/04923-0, 18/15549-1, 17/05782-8)
LAZARI, LUCAS CARDOSO; GHILARDI, FABIO DE ROSE; ROSA-FERNANDES, LIVIA; ASSIS, DIEGO M.; NICOLAU, JOSE CARLOS; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; DALCOQUIO, TALIA FALCAO; ANGELI, CLAUDIA B.; BERTOLIN, ADRIADNE JUSTI; MARINHO, CLAUDIO R. F.; et al. Prognostic accuracy of MALDI-TOF mass spectrometric analysis of plasma in COVID-19. LIFE SCIENCE ALLIANCE, v. 4, n. 8, . (20/04705-2, 18/15549-1, 17/03966-4, 15/26722-8, 18/20468-0, 20/04923-0, 18/18257-1)

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