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EMU concedido no processo 2017/10630-2: servidor

Resumo

EMU concedido no processo 2017/10630-2: Servidor. Resumo do projeto temático. De maneira geral, os rebanhos brasileiros precisam melhorar seus índices de eficiência e de qualidade do produto final que é a carne. Além disto, atualmente, existe uma preocupação mundial quanto ao aspecto da sustentabilidade da produção animal, o qual poderá ser melhorado por meio da seleção de animais que emitam menor quantidade de metano entérico para a atmosfera. Com a evolução das técnicas de sequenciamento completo do genoma e a diminuição do custo por animal, o sequenciamento tem sido proposto como alternativa aos chips de SNP, apresentando uma série de vantagens em relação aos mesmos. Assim, o presente projeto visa criar um banco de dados de emissão de metano entérico e utilizar um conjunto de informações de características de eficiência alimentar, qualidade de carne e carcaça bem como de reprodução, para realizar estudos genômicos com base em sequência completa do DNA, visando desenvolver tecnologias que permitam o melhor conhecimento biológico e o melhoramento da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de bovinos da raça Nelore. A princípio, serão desenvolvidos os seguintes tópicos no projeto: a) Estudo genético-quantitativo de características relacionadas à emissão de metano entérico e suas associações genéticas com características de eficiência alimentar; b) Estudo da acurácia de imputação para a sequência completa a partir de animais genotipados com chips comerciais com diferentes números de SNPs e utilizando diferentes métodos; c) Estudo da caracterização do genoma do Nelore utilizando dados de sequenciamento; d) Estudo de associação genômica ampla para características de importância econômica utilizando a sequência completa do genoma juntamente com o mapeamento fino de genes candidatos, visando à identificação das mutações causais e busca de mutações deletérias; e) Estudo de seleção genômica realizada com base em dados de sequenciamento para características relacionadas com a qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne; f) Análise de expressão gênica de características relacionadas com eficiência alimentar (transcriptoma). (AU)

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ALVES, A. A. C.; ESPIGOLAN, R.; BRESOLIN, T.; COSTA, R. M.; FERNANDES JUNIOR, G. A.; VENTURA, R. V.; CARVALHEIRO, R.; ALBUQUERQUE, L. G.. Genome-enabled prediction of reproductive traits in Nellore cattle using parametric models and machine learning methods. ANIMAL GENETICS, v. 52, n. 1, . (17/10630-2, 09/16118-5, 18/20026-8, 16/24227-2)
MAGALHAES MUNIZ, MARIA MALANE; SIMIELLI FONSECA, LARISSA FERNANDA; DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO; DE OLIVEIRA, HINAYAH ROJAS; BALDI, FERNANDO; CHARDULO, ARTUR LOYOLA; FERRO, JESUS APARECIDO; CANOVAS, ANGELA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Identification of novel mRNA isoforms associated with meat tenderness using RNA sequencing data in beef cattle. MEAT SCIENCE, v. 173, . (18/20026-8, 11/21241-0, 18/11154-2, 09/16118-5, 17/10630-2)
MARIN-GARZON, N. A.; MAGALHAES, A. F. B.; SCHMIDT, P. I.; SERNA, M.; FONSECA, L. F. S.; SALATTA, B. M.; FREZARIM, G. B.; FERNANDES-JUNIOR, G. A.; BRESOLIN, T.; CARVALHEIRO, R.; et al. Genome-wide scan reveals genomic regions and candidate genes underlying direct and maternal effects of preweaning calf mortality in Nellore cattle. Genomics, v. 113, n. 3, p. 1386-1395, . (17/10630-2, 18/20026-8)
SILVA, DANIELLY B. S.; FONSECA, LARISSA F. S.; PINHEIRO, DANIEL G.; MAGALHAES, ANA F. B.; MUNIZ, MARIA M. M.; FERRO, JESUS A.; BALDI, FERNANDO; CHARDULO, LUIS A. L.; SCHNABEL, ROBERT D.; TAYLOR, JEREMY F.; et al. Spliced genes in muscle from Nelore Cattle and their association with carcass and meat quality. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (17/10630-2, 15/16850-9, 09/16118-5, 16/22894-1, 18/20026-8)
FERNANDES JUNIOR, GERARDO A.; CARVALHEIRO, ROBERTO; DE OLIVEIRA, HENRIQUE N.; SARGOLZAEI, MEHDI; COSTILLA, ROY; VENTURA, RICARDO V.; FONSECA, LARISSA F. S.; NEVES, HAROLDO H. R.; HAYES, BEN J.; DE ALBUQUERQUE, LUCIA G.. Imputation accuracy to whole-genome sequence in Nellore cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 53, n. 1, . (17/10630-2, 19/12434-1, 09/16118-5, 18/10109-3, 18/20026-8)
ALVES, JACKELINE SANTOS; DIAZ, IARA DEL PILAR SOLAR; DA CRUZ, VALDECY APARECIDA ROCHA; BASTOS, MARISA SILVA; DE OLIVEIRA, LOUISE SARMENTO MARTINS; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; DE CAMARGO, GREGORIO MIGUEL FERREIRA; COSTA, RAPHAEL BERMAL. The effect of mitochondrial DNA polymorphisms on cattle reproduction. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, v. 48, n. 1, . (18/20026-8, 17/10630-2, 09/16118-5)
FERNANDES JUNIOR, GERARDO ALVES; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; CARVALHEIRO, ROBERTO; CARDOSO, DIERCLES FRANCISCO; FONSECA, LARISSA FERNANDA SIMIELLI; VENTURA, RICARDO VIEIRA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Whole-genome sequencing provides new insights into genetic mechanisms of tropical adaptation in Nellore (Bos primigenius indicus). SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (17/10630-2, 19/12434-1, 18/20026-8, 09/16118-5, 18/10109-3)

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