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Detecção e consequências de desequilíbrios no genoma humano

Processo: 18/08890-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de outubro de 2018 - 30 de setembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Társis Antônio Paiva Vieira
Beneficiário:Társis Antônio Paiva Vieira
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Vera Lúcia Gil da Silva Lopes
Assunto(s):Genoma humano  Variação estrutural do genoma  Sequenciamento completo do exoma  Mutação  Fenótipo  Predisposição genética para doença 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Desequilíbrios Genômicos | sequenciamento do exoma | Variantes de significado incerto | Citogenética Humana

Resumo

Os desequilíbrios genômicos (DGs) são uma forma importante de variação no genoma humano. Muitos deles estão relacionados a doenças e são a causa do fenótipo em parte significativa (10 - 20%) dos indivíduos com anomalias congênitas múltiplas (ACM) e (ou) deficiência intelectual (DI)/ atraso no desenvolvimento neuropsicomotor (ADNPM). Atualmente, a técnica de análise cromossômica por microarray (CMA) é utilizada como primeiro teste diagnóstico nesses indivíduos. Entretanto, trabalhos recentes têm sugerido que o sequenciamento do exoma (WES) poderia substituir o CMA como primeiro teste diagnóstico, com a vantagem de que este último poderia identificar tanto mutações gênicas como DGs, com os dados de um único experimento. Porém, até o momento, há poucos estudos com grupos de pacientes e ainda não há um consenso se a análise de DGs em dados de WES realmente pode substituir a CMA. Por outro lado, um desafio constante na interpretação dos DGs identificados por CMA em indivíduos com ACM e (ou) DI/ ADNPM é a identificação de variantes de significado incerto (VUS). Recentemente, sugeriu-se que o WES seria essencial para a conclusão diagnóstica nestes casos. Deste modo, os objetivos deste projeto são: realizar o sequenciamento do exoma e investigar mutações gênicas relacionadas ao fenótipo em indivíduos com ACM e (ou) ADNPM/ DI, com VUS detectadas previamente por CMA; e identificar as alterações encontradas pela técnica de CMA, através da análise de DGs em dados de exoma, neste mesmo grupo de indivíduos. Serão selecionados 50 indivíduos com ACM e (ou) DI/ ADNPM com VUS detectadas previamente por CMA. Será realizado o sequenciamento do exoma e posteriormente duas análises distintas: investigação de mutações gênicas relacionadas ao fenótipo e investigação de DGs nos dados do sequenciamento do exoma. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GABRIELA ROLDÃO CORREIA-COSTA; ILÁRIA CRISTINA SGARDIOLI; ANA PAULA DOS SANTOS; TÂNIA KAWASAKI DE ARAUJO; RODRIGO SECOLIN; ISCIA LOPES-CENDES; VERA LÚCIA GIL-DA-SILVA-LOPES; TÁRSIS PAIVA VIEIRA. Increased runs of homozygosity in the autosomal genome of Brazilian individuals with neurodevelopmental delay/intellectual disability and/or multiple congenital anomalies investigated by chromosomal microarray analysis. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 45, n. 1, . (12/51799-6, 18/08890-9)

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