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Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas

Processo: 17/23205-8
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de agosto de 2018 - 31 de julho de 2024
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Svetoslav Nanev Slavov
Beneficiário:Svetoslav Nanev Slavov
Instituição Sede: Hemocentro de Ribeirão Preto. Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP (HCMRP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Pesquisadores associados: Ana Cristina Silva Pinto ; Anna Maria Eis-Huebinger ; Belinda Pinto Simoes ; Caro Valerie ; Clarisse Martins Machado ; Dimas Tadeu Covas ; Gil Cunha de Santis ; Jose Mauro Kutner ; Mathias Vandenbogaert ; Nelson Hamerschlak ; Sanny Marcele da Costa Lira ; Sauvage ; Simone Kashima Haddad ; Syria Laperche
Bolsa(s) vinculada(s):23/12155-0 - Aplicação de Algoritmos de Aprendizagem de Máquina para Identificação de Vírus em Dados Provenientes do dark matter (Matéria Escura) de Sequenciamento de Última Geração, BP.MS
22/14958-0 - Triagem molecular e de sequenciamento de última geração para infecções virais emergentes em diversas amostras clínicas, BP.TT
22/10278-5 - Metagenômica viral em pacientes pediátricos oncológicos apresentando neutropenia febril sem diagnóstico etiológico, BP.MS
+ mais bolsas vinculadas 21/09446-8 - Aplicação da tecnologia portátil de sequenciamento minion para a análise do metagenoma viral, BP.MS
22/00910-6 - Desenvolvimento e aplicação de pipelines de bioinformática para análise metagenômica viral em amostras clínicas, BP.IC
21/10595-8 - Avaliação molecular de vírus de interesse clínico em amostras de plasma de pacientes com transplante hematopoiético, BP.IC
20/13194-1 - Avaliação molecular da prevalência e aplicação de métodos de sequenciamento de última geração para identificação de vírus emergentes na área de hemoterapia, BP.TT
19/07861-8 - Desenvolvimento de um pipeline de bioinformática para identificação de doenças infecciosas emergentes em pacientes em regime de transfusão crônica, BP.MS
19/08528-0 - Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia, BP.MS
18/22009-3 - Aditividades de suporte técnico na coleta de amostras e técnicas moleculares em pacientes com anemia falciforme submetidos a múltiplas transfusões, BP.TT
18/15826-5 - Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas, BP.JP - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Serviço de hemoterapia  Transfusão de sangue  Metagenômica  Transplantados  Análise de sequência de DNA  Células-tronco  Arbovirus 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Hemoterapia | Metagenômica viral | Múltiplas transfusões | Pacientes transplantados | Sequenciamento de última geração | Virus Emergentes | Doenças Infecciosas E Parasitárias

Resumo

Nas últimas décadas, a atenção científica esteve amplamente voltada a uma área específica da virologia clínica que engloba os vírus emergentes e re-emergentes. Atribui-se isso ao fato desses agentes infecciosos terem sido reconhecidos como uma ameaça constante à saúde humana. Muitos deles podem ser transmitidos por procedimentos hemoterápicos, principalmente pela aplicação de hemoderivados e transplantes de células-tronco hematopoéticas (TCTH). Na maioria dos casos, as viroses emergentes estão representadas por vírus zoonóticos com ciclos naturais exóticos, que são transmitidos por vetores artrópodes. Sua disseminação entre a população humana pode estar relacionada a surtos de alta morbidade com muitas infecções assintomáticas que, por sua vez, podem impactar o processo hemoterápico. No Brasil, não foram desenvolvidos estudos abrangentes sobre tais infecções e sua ameaça real para os processos hemoterápicos é subestimada e pouco conhecida. Portanto, esta proposta visa investigar o impacto das viroses emergentes na área da hemoterapia utilizando sequenciamento de última geração e análise do metagenoma viral. Para tal finalidade, os estudos serão realizados em amostras de plasma obtidas de pacientes submetidos a TCTH, pacientes politransfundidos e unidades de sangue reprovadas. Outro objetivo desse projeto é uma avaliação contínua da prevalência de diferentes infecções arbovirais na população de doadores voluntários de sangue da região Noroeste do Estado de São Paulo. Esta região geográfica é sujeita a frequentes surtos de diversos arbovírus. Assim, este projeto contribuirá positivamente na compreensão do impacto dos vírus emergentes para a hemoterapia e capacitará os pesquisadores brasileiros na área de análise metagenômica e o sequenciamento de última geração. Esta proposta representa uma nova linha de pesquisa em centro de pesquisa já consolidado e conta com colaborações nacionais de importantes centros clínicos como o Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Hospital Israelita "Albert Einstein", São Paulo, e a Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto-USP. Além disso, haverá a participarão de pesquisadores internacionais de importantes centros de virologia clínica e bioinformática da França e Alemanha (Instituto Pasteur; Centro de Transfusão Sanguínea de Paris, França; Instituto de Virologia da Universidade de Bonn, Alemanha). Por fim, esta proposta permitirá estabelecer um grupo multicêntrico e multidisciplinar de pesquisa em vírus emergentes e hemoterapia/transplantes. (AU)

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CAVALCANTE SOUZA, JULIANA VANESSA; SANTOS, HAZERRAL DE OLIVEIRA; LEITE, ANDERSON BRANDAO; GIOVANETTI, MARTA; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE CARVALHO, ENEAS; TODAO BERNARDINO, JARDELINA DE SOUZA; VIALA, VINCENT LOUIS; HADDAD, RODRIGO; CICCOZZI, MASSIMO; et al. Viral Metagenomics for the Identification of Emerging Infections in Clinical Samples with Inconclusive Dengue, Zika, and Chikungunya Viral Amplification. Viruses-Basel, v. 14, n. 9, p. 8-pg., . (17/23205-8, 18/15826-5, 21/09446-8, 21/11944-6, 20/13194-1, 19/08528-0)
BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DIEFENBACH, CRISTIANE FRACAO; PEREIRA, DALNEI VEIGA; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Viral metagenomics performed in patients with acute febrile syndrome during Toxoplasma gondii outbreak in south Brazil. Brazilian Journal of Infectious Diseases, v. 24, n. 3, p. 250-255, . (19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0, 17/23205-8)
I.N. VALENÇA; F.A. RÓS; V.S. ZUCHERATO; A.C. SILVA-PINTO; D.T. COVAS; S. KASHIMA; S.N. SLAVOV. Comparative metavirome analysis in polytransfused patients. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v. 54, n. 12, . (19/07861-8, 20/13194-1, 17/23205-8, 19/22155-2, 18/15826-5)
NUNES VALENCA, I; SILVA-PINTO, A. C.; ARAUJO DA SILVA JUNIOR, W.; COVAS, D. TADEU; KASHIMA, S.; NANEV SLAVOV, S.. Viral metagenomics in Brazilian multiply transfused patients with sickle cell disease as an indicator for blood transfusion safety. TRANSFUSION CLINIQUE ET BIOLOGIQUE, v. 27, n. 4, p. 237-242, . (18/22009-3, 17/23205-8, 19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0)
ALVES FIGUEIREDO, DAVID LIVINGSTONE; BIANCHI XIMENEZ, JOAO PAULO; FERREIRA SEIVA, FABIO RODRIGUES; PANIS, CAROLINA; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; FERRASA, ADRIANO; CECCHINI, ALESSANDRA LOURENCO; DE MEDEIROS, ALEXANDRA IVO; ALMEIDA, ANA MARISA FUSCO; RAMAO, ANELISA; et al. COVID-19: The question of genetic diversity and therapeutic intervention approaches. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 44, n. 1, p. 19-pg., . (17/23205-8, 19/08528-0, 13/08135-2)
VALENCA, IAN NUNES; DOS SANTOS, RAFAEL BEZERRA; PERONNI, KAMILA CHAGAS; SAUVAGE, VIRGINIE; VANDENBOGAERT, MATHIAS; CARO, VALERIE; DA SILVA JUNIOR, WILSON ARAUJO; COVAS, DIMAS TADEU; SILVA-PINTO, ANA CRISTINA; LAPERCHE, SYRIA; et al. Deep sequencing applied to the analysis of viromes in patients with beta-thalassemia. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 63, . (19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0, 17/23205-8)
SLAVOV, S. N.; CHRISTOVA, I. S.; FERREIRA, A. R.; RODRIGUES, E. S.; BIANQUINI, M. L.; HESPANHOL, M. R.; COVAS, D. T.; KASHIMA, S.. Serological evidence of Borrelia circulation among blood donors in the Sao Paulo state, Brazil. Transfusion Medicine, v. 29, n. 5, p. 358-363, . (17/23205-8, 14/50947-7)
SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; SILVEIRA, ROBERTA MARANINCHI; RODRIGUES, EVANDRA STRAZZA; DIEFENBACH, CRISTIANE FRACAO; ZIMMERMANN, ANA MARIA; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE. Human pegivirus-1 pegivirus-1 (HPgV-1, GBV-C) RNA prevalence and genotype diversity among volunteer blood donors from an intra-hospital hemotherapy service in Southern Brazil. TRANSFUSION AND APHERESIS SCIENCE, v. 58, n. 2, p. 174-178, . (14/50947-7, 17/23205-8, 09/16623-1)
ARTHUR, RODRIGO ALEX; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; BIANCHI XIMENEZ, JOAO PAULO; MERLIN, BRUNA LAIS; MORRAYE, RAPHAEL DE ANDRADE; NETO, JOAO VALENTINI; NASSER FAVA, NATALIA MELO; ALVES FIGUEIREDO, DAVID LIVINGSTONE; OLIVEIRA DE BIAGI JR, CARLOS ALBERTO; MONTIBELLER, MARIA JARA; et al. Microbiome and oral squamous cell carcinoma: a possible interplay on iron metabolism and its impact on tumor microenvironment. Brazilian Journal of Microbiology, v. 52, n. 3, p. 1287-1302, . (19/08528-0, 17/23205-8, 13/08135-2)
VALENCA, IAN NUNES; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE OLIVEIRA, LUCIANA CORREA OLIVEIRA; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Deep viral metagenomics in patients with haemophilia receiving plasma-derived coagulation factor concentrates. HAEMOPHILIA, v. 27, n. 5, . (20/13194-1, 17/23205-8, 19/08528-0, 19/07861-8)
SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; GUARAGNA MACHADO, RAFAEL RAHAL; FERREIRA, ALEXANDER RODRIGO; SOARES, CAMILA PEREIRA; ARAUJO, DANIELLE BASTOS; LEAL OLIVEIRA, DANIELLE BRUNA; COVAS, DIMAS TADEU; DURIGON, EDISON LUIZ; KASHIMA, SIMONE. Zika virus seroprevalence in blood donors from the Northeastern region of Sao Paulo State, Brazil, between 2015 and 2017. Journal of Infection, v. 80, n. 1, p. 111-115, . (17/23205-8, 16/20045-7, 16/15049-3, 16/08727-5, 14/50947-7)
SLAVOV, SVETOSLAV N.; RODRIGUES, EVANDRA S.; SAUVAGE, VIRGINIE; CARO, VALERIE; DIEFENBACH, CRISTIANE F.; ZIMMERMANN, ANA M.; COVAS, DIMAS T.; LAPERCHE, SYRIA; KASHIMA, SIMONE. Parvovirus B19 seroprevalence, viral load, and genotype characterization in volunteer blood donors from southern Brazil. Journal of Medical Virology, v. 91, n. 7, p. 1224-1231, . (09/16623-1, 17/23205-8, 14/50947-7)
RAFAEL DOS SANTOS BEZERRA; KAMILA CHAGAS PERONNI; BRUNA DURÃES DE FIGUEIREDO BARROS; LEONARDO SCALON DE OLIVEIRA; EVANDRA STRAZZA RODRIGUES; ROCHELE AZEVEDO; EUGÊNIA MARIA AMORIM UBIALI; DIMAS TADEU COVAS; SIMONE KASHIMA; SVETOSLAV NANEV SLAVOV. Viral metagenomics in blood donors with post-donation diseases and negative tests for dengue and Zika viruses RNA detection during a major outbreak of arboviruses in Sao Paulo State in 2016. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 62, p. -, . (19/08528-0, 18/15826-5, 19/07861-8, 17/23205-8)
ZANETTE, DALILA LUCIOLA; COELHO, KAROLINE BRITO CAETANO ANDRADE; DE CARVALHO, ENEAS; AOKI, MATEUS NOBREGA; NARDIN, JEANINE MARIE; LALLI, LARISSA ARAUJO; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; GIOVANETTI, MARTA; ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; DE CAMPOS, GABRIEL MONTENEGRO; et al. Metagenomic insights into the plasma virome of Brazilian patients with prostate cancer. MOLECULAR & CELLULAR ONCOLOGY, v. 10, n. 1, p. 9-pg., . (19/08528-0, 22/00910-6, 17/23205-8, 20/13194-1)
ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; DA COSTA, PERICLES NATAN MENDES; GIOVANETTI, MARTA; KRAUSE, LUCIANA MARIA FONTANARI; ALVES, DAIANI CRISTINA CILIAO; MOREIRA, RENATA MARIA ALENCAR; PIMENTEL, BARBARA MACIEL SIDOU; HADDAD, RODRIGO; BITENCOURT, HELLEN TAYANA; CICCOZZI, MASSIMO; et al. Merkel cell polyomavirus (MCPyV) DNA prevalence in Brazilian blood donors. TRANSFUSION CLINIQUE ET BIOLOGIQUE, v. 30, n. 1, p. 4-pg., . (20/13194-1, 17/23205-8, 18/15826-5)
ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; EVARISTO, MARIANE; SANTOS, ELAINE VIEIRA; MELLO, RALYRIA; CANDIDO, ERIKA DONIZETTI; ARAUJO, DANIELLE BASTOS; GIOVANETTI, MARTA; ALCANTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR; CILIAO-ALVES, DAIANI CRISTINA; HADDAD, RODRIGO; et al. SARS-CoV-2 serological cross-reactivity testing in Brazilian blood donors, October-December, 2019. Journal of Infection, v. 84, n. 2, p. 2-pg., . (20/13194-1, 17/23205-8)
BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE MELO JORGE, DANIEL MACEDO; CASTRO, ITALO ARAUJO; MORETTO, EDSON LARA; DE OLIVEIRA, LEONARDO SCALON; AMORIM UBIALI, EUGENIA MARIA; COVAS, DIMAS TADEU; ARRUDA, EURICO; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Detection of Influenza A(H3N2) Virus RNA in Donated Blood. Emerging Infectious Diseases, v. 26, n. 7, p. 1621-1623, . (17/23205-8, 19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0)
SLAVOV, S. N.; MARANINCHI SILVEIRA, R.; HESPANHOL, M. R.; SAUVAGE, V.; RODRIGUES, E. S.; FONTANARI KRAUSE, L.; BITTENCOURT, H. T.; CARO, V.; LAPERCHE, S.; COVAS, D. T.; et al. Human pegivirus-1 (HPgV-1) RNA prevalence and genotypes in volunteer blood donors from the Brazilian Amazon. TRANSFUSION CLINIQUE ET BIOLOGIQUE, v. 26, n. 4, p. 234-239, . (09/16623-1, 17/23205-8, 14/50947-7)
BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; BUB, CAROLINA BONET; PERONNI, KAMILA CHAGAS; DE FIGIUEIREDO BARROS, BRUNA DURAES; DA COSTA LIRA, SANNY MARCELE; KUTNER, JOSE MAURO; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Virome comparison of deferred blood donations obtained from different geographic regions in the Sao Paulo State, Brazil. TRANSFUSION AND APHERESIS SCIENCE, v. 60, n. 3, . (17/23205-8, 19/08528-0, 19/07861-8, 18/15826-5)
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SLAVOV, SVETOSLAV N.; MACONETTO, JULIANA D. M.; MARTINEZ, EDSON Z.; SILVA-PINTO, ANA CRISTINA; COVAS, DIMAS T.; EIS-HUEBINGER, ANNA MARIA; KASHIMA, SIMONE. Prevalence of hepatitis E virus infection in multiple transfused Brazilian patients with thalassemia and sickle cell disease. Journal of Medical Virology, v. 91, n. 9, p. 1693-1697, . (09/16623-1, 17/23205-8, 14/50947-7)
TOSTA, STEPHANE; MORENO, KELDENN; SCHUAB, GABRIEL; FONSECA, VAGNER; SEGOVIA, FATIMA MARIA CARDOZO; KASHIMA, SIMONE; ELIAS, MARIA CAROLINA; SAMPAIO, SANDRA COCCUZZO; CICCOZZI, MASSIMO; JUNIOR ALCANTARA, LUIZ CARLOS; et al. Global SARS-CoV-2 genomic surveillance: What we have learned (so far). INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 108, p. 8-pg., . (17/23205-8)
BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; XIMENEZ, JOAO PAULO BIANCHI; GIOVANETTI, MARTA; ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; BITENCOURT, HELEN TAYANA; ZIMMERMANN, ANA; ALCANTARA JUNIOR, LUIZ CARLOS JUNIOR; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Metavirome composition of Brazilian blood donors positive for the routinely tested blood-borne infections. VIRUS RESEARCH, v. 311, p. 7-pg., . (20/13194-1, 17/23205-8, 19/08528-0, 18/15826-5)
BEZERRA, RAFAEL S.; BITENCOURT, HELLEN T.; COVAS, DIMAS T.; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV N.. Metagenomic identification of human Gemykibivirus-2 (HuGkV-2) in parenterally infected blood donors from the Brazilian Amazon. INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 98, p. 3-pg., . (19/08528-0, 18/15826-5, 19/07861-8, 17/23205-8)

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