O Programa de Pesquisas em Caracterização, Conservação, Restauração e Uso Sustentável da Biodiversidade - BIOTA tem o objetivo de mapear e analisar a biodiversidade, incluindo a fauna, a flora e os microrganismos, mas, também, avaliar as possibilidades de exploração sustentável de plantas ou animais com potencial econômico e subsidiar a formulação de políticas de conservação dos remanescentes florestais. Os projetos são desenvolvidos sob a responsabilidade de um Pesquisador Principal vinculado a instituições superiores de ensino e pesquisa no Estado de São Paulo. A seleção é feita por meio de análise pelos pares.