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João Meidanis

CV Lattes ResearcherID ORCID


Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação (IC)  (Institutional affiliation for the last research proposal)
Birthplace: Brazil

Joao Meidanis holds a bachelor's degree in Mathematics from the University of São Paulo (1980), a master's degree in Mathematics from the same school (1985), a master's degree in Computer Sciences from the University of Wisconsin-Madison (1989) and a PhD degree in Computer Sciences from the University of Wisconsin-Madison (1992). His research focuses on analysis of algorithms, graph theory, computational biology, bioinformatics, and optimization. (Source: Lattes Curriculum)

Articles published in Pesquisa FAPESP Magazine about the researcher:
El mapa de la caña de azúcar 
Mapping sugarcanes 
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Keywords used by the researcher
Scientific publications resulting from Research Grants and Scholarships under the grantee's responsibility (9)
(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

PEREIRA ZANETTI, JOAO PAULO; BILLER, PRISCILA; MEIDANIS, JOAO. Median Approximations for Genomes Modeled as Matrices. Bulletin of Mathematical Biology, v. 78, n. 4, p. 786-814, . (12/14104-0, 12/13865-7)

SANKOFF, DAVID; ZHENG, CHUNFANG; ZHANG, YUE; MEIDANIS, JOAO; LYONS, ERIC; TANG, HAIBAO. Models for Similarity Distributions of Syntenic Homologs and Applications to Phylogenomics. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 16, n. 3, p. 727-737, . (16/01511-7)

CHINDELEVITCH, LEONID; LA, SEAN; MEIDANIS, JOAO. A cubic algorithm for the generalized rank median of three genomes. Algorithms for Molecular Biology, v. 14, . (16/01511-7)

BILLER, PRISCILA; GUEGUEN, LAURENT; TANNIER, ERIC. Moments of genome evolution by Double Cut-and-Join. BMC Bioinformatics, v. 16, n. 14, . (13/25084-2)

BILLER, PRISCILA; GUEGUEN, LAURENT; KNIBBE, CAROLE; TANNIER, ERIC. Breaking Good: Accounting for Fragility of Genomic Regions in Rearrangement Distance Estimation. GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, v. 8, n. 5, p. 1427-1439, . (13/25084-2)

RAJARAMAN, ASHOK; PEREIRA ZANETTI, JOAO PAULO; MANUCH, JAN; CHAUVE, CEDRIC. Algorithms and Complexity Results for Genome Mapping Problems. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 14, n. 2, p. 418-430, . (13/07868-6)

MEIDANIS, JOAO; CHINDELEVITCH, LEONID. Fast median computation for symmetric, orthogonal matrices under the rank distance. Linear Algebra and its Applications, v. 614, n. SI, p. 394-414, . (18/00031-7)

FEIJAO, PEDRO; MEIDANIS, JOAO. SCJ: A Breakpoint-Like Distance that Simplifies Several Rearrangement Problems. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 8, n. 5, p. 1318-1329, . (09/09307-6)

GIUSTI, GUILHERME NAVARRO NILO; JOTTA, PATRICIA YOSHIOKA; LOPES, CAROLINE DE OLIVEIRA; GANAZZA, MONICA APARECIDA; AZEVEDO, AMILCAR CARDOSO; BRANDALISE, SILVIA REGINA; MEIDANIS, JOAO; YUNES, JOSE ANDRES. Test trial of spike-in immunoglobulin heavy-chain (IGH) controls for next generation sequencing quantification of minimal residual disease in acute lymphoblastic leukaemia. British Journal of Haematology, v. 189, n. 4, . (18/00031-7, 17/03942-8)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

FORTUNA, Vinicius Jose. Distancias de transposição entre genomas. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (03/04578-5

TELLES, Guilherme Pimentel. Propriedade dos uns consecutivos e arvores PQR. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (96/08571-0

BRAGA, Marilia Dias Vieira. Grafos de sequencias de DNA. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (97/11629-2

TELLES, Guilherme Pimentel. Um algoritmo quase-linear para arvores PQR e um esquema para clustering de sequencias expressas de cana-de-açucar. Tese (Doutorado) -  Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (97/12126-4

COGO, Patricia Pilisson. Comparação de genomas completos de especies da familia Vibrionacea empregando rearranjo de genomas. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (05/53279-6

BILLER, Priscila Do Nascimento. Statistical analysis of evolution by genome rearrangements = Análise estatística da evolução por rearranjo de genomas. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.  (12/14104-0

ZANETTI, João Paulo Pereira. Methods for phylogenetic reconstruction = Métodos de reconstrução filogenética. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.  (12/13865-7

MIRA, Cleber Valgas Gomes. Analise algebrica de problemas de rearranjo em genomas : algoritmos e complexidade. Tese (Doutorado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (03/00731-3

ZANETTI, João Paulo Pereira. Complexidade de construção de árvores PQR. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (10/04071-1

PINTO, Marcelo Cezar. Um algoritmo para comparação sintatica de genomas baseado na complexidade condicional de Kolmogorov. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (00/04776-3

BRAGA, Marilia Dias Vieira. Grafos de sequencias de DNA. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (97/11629-2

TELLES, Guilherme Pimentel. Um algoritmo quase-linear para arvores PQR e um esquema para clustering de sequencias expressas de cana-de-açucar. Tese (Doutorado) -  Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (97/12126-4

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