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(Referência obtida automaticamente do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

New Dereplication Method Applied to NMR-Based Metabolomics on Different Fusarium Species Isolated from Rhizosphere of Senna spectabilis

Texto completo
Autor(es):
Denise M. Selegato ; Rafael T. Freire ; Alberto Tannús ; Ian Castro-Gamboa
Número total de Autores: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Journal of the Brazilian Chemical Society; v. 27, n. 8, p. -, Ago. 2016.
Resumo

The search for new sources of natural products steadily increased the use of bioinformatic tools that enabled efficient analysis of complex matrices. In this context, dereplication methods emerged as a fast way of identifying known compounds, accelerating the identification of bioactive chemotypes. Although 1H NMR is widely used as an analytical technique, few studies have been reported using it as a dereplication tool, primarily because of the spectral complexity. This work aims to create a new computational method that analyses 1H NMR data from Fusarium solani and F. oxysporum isolated from Senna spectabilis's rhizosphere through principal component analysis (PCA). The algorithm uses loading values to select important peaks that distinguish both species in PCA, allowing compound dereplication, even in highly similar profiles. As a result, the method, associated with other NMR experiments and information from an in-house Fusarium's metabolite library was able to distinguish different mycotoxins produced by both fungi, identifying fusaric acid and beauvericin for F. oxysporum and the depsipeptide HA23 from F. solani. (AU)

Processo FAPESP: 12/22206-7 - Análise metabolômica dos fungos endofíticos associados a Senna spectabilis através de RMN e modelos de desreplicação computacionais
Beneficiário:Rafael Teixeira Freire
Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Processo FAPESP: 11/50816-1 - A rizosfera de Senna spectabilis: estudo das interações planta/microrganismos utilizando ferramentas metabolômicas
Beneficiário:Ian Castro-Gamboa
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Regular
Processo FAPESP: 11/21623-0 - Desenvolvimento de um software de reconhecimento de padrões e de desreplicação aplicado a espectroscopia de ressonância magnética nuclear
Beneficiário:Rafael Teixeira Freire
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 14/05935-0 - Co-cultura de micro-organismos isolados da rizosfera de Senna spectabilis visando a produção de metabólitos bioativos
Beneficiário:Denise Medeiros Selegato
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Processo FAPESP: 13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos
Beneficiário:Glaucius Oliva
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs