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João Eduardo Ferreira

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Graduação Bacharelado em Física - Opção Física-Computacional pela Universidade de São Paulo (1988); mestrado (1991) e doutorado (1996) em Fisica-Computacional pela Universidade de São Paulo; graduação em Pedagogia pela Universidade Federal de São Carlos (1989). Pós-doutorado pela Georgia Tech, Atlanta-USA (2010). Atualmente é professor titular junto ao departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. É editor associado do periódico IEEE Transactions on Services Computing e tem participado de vários comitês de programas incluindo IEEE Web Services, WISE, ICSOC, ICWS, ICDE, IEEE Big Data, ENASE e SBBD. Publicou mais de 100 artigos nas áreas de bancos de dados e e-Science e tem recebido apoio regular das agências de fomento FAPESP, CNPq, CAPES, Ministério da Saúde e NIH-USA para financiamento de suas pesquisas. Os principais temas de interesse são: integração de bancos de dados; modelagem, análise e implementação de sistemas de informação cientes de processos; data warehouse; qualidade de dados; transações assíncronas; e recuperação de informação. Membro da Sociedade Brasileira de Computação (SBC), da IEEE-CS e da ACM. (Fonte: Currículo Lattes)

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Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 04/07/2020
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COVID-19 Data Sharing/BR | Banco de dados compartilhados FAPESP


Publicado em 30 de junho de 2020 - Agência FAPESP. Pesquisadores de universidades e instituições de pesquisa de todo o país passam a ter acesso ao COVID-19 Data Sharing/BR, o primeiro repositório do país com dados demográficos e exames clínicos e laboratoriais anonimizados de pacientes que fizeram testes para COVID-19 em unidades laboratoriais e hospitais do Estado de São Paulo.

Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (35)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações33
Citações43
Cit./Artigo1,3
Dados do Web of Science

ARAÚJO‚ L.V.; MALKOWSKI‚ S.; BRAGHETTO‚ K.R.; PASSOS-BUENO‚ M.R.; ZATZ‚ M.; PU‚ C.; FERREIRA‚ J.E.. A rigorous approach to facilitate and guarantee the correctness of the genetic testing management in human genome information systems. BMC Genomics, v. 12, n. Suppl 4, p. S13, . (06/00375-0)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; BALARDIN, JOANA BISOL; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO. Correlation between graphs with an application to brain network analysis. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 109, p. 76-92, . Citações Web of Science: 0. (13/10498-6, 16/13422-9, 13/00506-1, 15/01587-0)

JACOMINI, RICARDO DE SOUZA; MARTINS, JR., DAVID CORREA; DA SILVA, FELIPE LENO; REALI COSTA, ANNA HELENA. GeNICE: A Novel Framework for Gene Network Inference by Clustering, Exhaustive Search, and Multivariate Analysis. JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. 24, n. 8, p. 809-830, . Citações Web of Science: 0. (16/21047-3, 11/50761-2, 15/16310-4, 15/01587-0)

MEKKAOUI, CHOUKRI; METELLUS, PHILIPPE; KOSTIS, WILLIAM J.; MARTUZZI, ROBERTO; PEREIRA, FABRICIO R.; BEREGI, JEAN-PAUL; REESE, TIMOTHY G.; CONSTABLE, TODD R.; JACKOWSKI, MARCEL P.. Diffusion Tensor Imaging in Patients with Glioblastoma Multiforme Using the Supertoroidal Model. PLoS One, v. 11, n. 1, . Citações Web of Science: 3. (15/01587-0)

SILVA, DENNIS J.; ALVES, WONDER A. L.; HASHIMOTO, RONALDO FUMIO. Incremental bit-quads count in component trees: Theory, algorithms, and optimization. PATTERN RECOGNITION LETTERS, v. 129, p. 33-40, . Citações Web of Science: 0. (18/15652-7, 15/01587-0)

DRIEMEIER, CARLOS E.; LING, LIU Y.; YANCY-CABALLERO, DAISON; MANTELATTO, PAULO E.; DIAS, CARLOS S. B.; ARCHILHA, NATHALY L.. Location of water in fresh sugarcane bagasse observed by synchrotron X-ray microtomography. PLoS One, v. 13, n. 12, . Citações Web of Science: 2. (14/50884-5, 17/01330-5, 15/01587-0)

MACIEL CARDOSO, FELIPE; MELONI, SANDRO; SANTANCHE, ANDRE; MORENO, YAMIR. Topical Alignment in Online Social Systems. FRONTIERS IN PHYSICS, v. 7, . Citações Web of Science: 0. (15/01587-0)

MARCIO KATSUMI OIKAWA; MARCOS EDUARDO BOLELLI BROINIZI; ALEXANDRE DERMARGOS; HUGO AGUIRRE ARMELIN; JOÃO EDUARDO FERREIRA. GenFlow: generic flow for integration, management and analysis of molecular biology data. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 27, n. 4, p. -, . (00/10062-3)

CARASTAN-SANTOS, DANILO; MARTINS-, JR., DAVID C.; SONG, SIANG W.; ROZANTE, LUIZ C. S.; DE CAMARGO, RAPHAEL Y.. A hybrid CPU-GPU-MIC algorithm for minimal hitting set enumeration. CONCURRENCY AND COMPUTATION-PRACTICE & EXPERIENCE, v. 31, n. 18, SI, . Citações Web of Science: 1. (15/24485-9, 13/26644-1, 14/50937-1, 15/01587-0)

RAMOS, TAIANE COELHO; BALARDIN, JOANA BISOL; SATO, JOAO RICARDO; FUJITA, ANDRE. Abnormal Cortico-Cerebellar Functional Connectivity in Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN SYSTEMS NEUROSCIENCE, v. 12, . Citações Web of Science: 4. (13/07375-0, 16/13422-9, 18/17996-5, 15/01587-0)

VIDAL, MACIEL C.; SATO, JOAO R.; BALARDIN, JOANA B.; TAKAHASHI, DANIEL Y.; FUJITA, ANDRE. ANOCVA in R: A Software to Compare Clusters between Groups and Its Application to the Study of Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 11, . Citações Web of Science: 1. (15/01587-0, 13/03447-6, 13/10498-6, 14/09576-5, 16/13422-9)

FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; TAHIRA, ANA CAROLINA; SIMOES, SERGIO NERY; BRENTANI, HELENA; MARTINS, JR., DAVID CORREA. Assessment of complementarity of WGCNA and NERI results for identification of modules associated to schizophrenia spectrum disorders. PLoS One, v. 14, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (11/04956-6, 11/50761-2, 14/00041-1, 14/10488-3, 15/01587-0)

YANCY-CABALLERO, DAISON; LING, LIU Y.; FUJITA, ANDRE; FERREIRA, JOAO E.; DRIEMEIER, CARLOS. Intraparticle Connectivity in Sugarcane Bagasse Unveiled by Pore Network Modeling. BioEnergy Research, v. 12, n. 3, p. 546-557, . Citações Web of Science: 0. (17/01330-5, 15/01587-0)

SANCHES, GUILHERME M.; GRAZIANO MAGALHAES, PAULO S.; DOS SANTOS LUCIANO, ANA C.; CAMARGO, LIVIA A.; FRANCO, HENRIQUE C. J.. Comprehensive assessment of spatial soil variability related to topographic parameters in sugarcane fields. Geoderma, v. 362, . Citações Web of Science: 0. (13/50942-2, 18/10225-3, 08/09265-9, 14/14965-0, 15/01587-0)

ESTRELA, GUSTAVO; GUBITOSO, MARCO DIMAS; FERREIRA, CARLOS EDUARDO; BARRERA, JUNIOR; REIS, MARCELO S.. An Efficient, Parallelized Algorithm for Optimal Conditional Entropy-Based Feature Selection. Entropy, v. 22, n. 4, . Citações Web of Science: 0. (16/25959-7, 13/07467-1, 15/01587-0)

RODRIGUES, FRANCISCO C. M.; ESPADOTO, MATEUS; HIRATA JR, ROBERTO; TELEA, ALEXANDRU C.. Constructing and Visualizing High-Quality Classifier Decision Boundary Maps dagger. INFORMATION, v. 10, n. 9, . Citações Web of Science: 0. (15/22308-2, 15/24485-9, 15/01587-0)

ARAÚJO‚ L.V.; MALKOWSKI‚ S.; BRAGHETTO‚ K.R.; PASSOS-BUENO‚ M.R.; ZATZ‚ M.; PU‚ C.; FERREIRA‚ J.E.. A rigorous approach to facilitate and guarantee the correctness of the genetic testing management in human genome information systems. BMC Genomics, v. 12, n. Suppl 4, p. S13, . (06/00375-0)

MACUL FERREIRA DE BARROS, PEDRO; DO ROSARIO, MARIA CONCEICAO; SZEJKO, NATALIA; POLGA, NATALIA; REQUENA, GUARACI DE LIMA; RAVAGNANI, BEATRIZ; FATORI, DANIEL; BATISTUZZO, MARCELO CAMARGO; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; ROHDE, LUIS AUGUSTO; et al. Risk factors for obsessive-compulsive symptoms. Follow-up of a community-based youth cohort. EUROPEAN CHILD & ADOLESCENT PSYCHIATRY, . Citações Web of Science: 0. (08/57896-8, 15/01587-0)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; BALARDIN, JOANA BISOL; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO. Correlation between graphs with an application to brain network analysis. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 109, p. 76-92, . Citações Web of Science: 0. (13/10498-6, 16/13422-9, 13/00506-1, 15/01587-0)

RAMOS, TAIANE COELHO; BALARDIN, JOANA BISOL; SATO, JOAO RICARDO; FUJITA, ANDRE. Abnormal Cortico-Cerebellar Functional Connectivity in Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN SYSTEMS NEUROSCIENCE, v. 12, . Citações Web of Science: 4. (13/07375-0, 16/13422-9, 18/17996-5, 15/01587-0)

ATASHPAZ-GARGARI, ESMAEIL; REIS, MARCELO S.; BRAGA-NETO, ULISSES M.; BARRERA, JUNIOR; DOUGHERTY, EDWARD R.. A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection. PATTERN RECOGNITION, v. 73, p. 172-188, . Citações Web of Science: 3. (13/07467-1, 15/01587-0)

GUZMAN, GROVER E. C.; SATO, JOAO R.; VIDAL, MACIEL C.; FUJITA, ANDRE. Identification of alterations associated with age in the clustering structure of functional bra in networks. PLoS One, v. 13, n. 5, . Citações Web of Science: 1. (16/13422-9, 15/01587-0)

GOYA, DENISE H.; NAKAMURA, DIONATHAN; TERADA, ROUTO. Certificateless Key Agreement Protocols under Strong Models. IEICE TRANSACTIONS ON FUNDAMENTALS OF ELECTRONICS COMMUNICATIONS AND COMPUTER SCIENCES, v. E99A, n. 10, p. 1822-1832, . Citações Web of Science: 0. (08/06189-0, 15/01587-0)

MOREIRA, DANIEL A. M.; DELGADO, KARINA VALDIVIA; DE BARROS, LELIANE NUNES. Robust probabilistic planning with ilao. APPLIED INTELLIGENCE, v. 45, n. 3, p. 662-672, . Citações Web of Science: 0. (15/01587-0)

LISBOA, BIANCA C. G.; OLIVEIRA, KATIA C.; TAHIRA, ANA CAROLINA; BARBOSA, ANDRE ROCHA; FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; GOUVEIA, GISELE; LIMA, LUZIA; FEIO DOS SANTOS, ANA CECILIA; MARTINS JR, DAVID CORREA; PUGA, RENATO DAVID; et al. Initial findings of striatum tripartite model in OCD brain samples based on transcriptome analysis. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . Citações Web of Science: 1. (15/01587-0)

KINKER, GABRIELA SARTI; THOMAS, ANDREW MALTEZ; CARVALHO, VINICIUS JARDIM; LIMA, FELIPE PRATA; FUJITA, ANDRE. Deletion and low expression of NFKBIA are associated with poor prognosis in lower-grade glioma patients. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 4. (15/01507-7, 14/27287-0, 13/03447-6, 15/01587-0, 14/09576-5)

DRIEMEIER, CARLOS; LING, LIU YI; SANCHES, GUILHERME M.; PONTES, ANGELICA O.; GRAZIANO MAGALHAES, PAULO S.; FERREIRA, JOAO E.. A computational environment to support research in sugarcane agriculture. COMPUTERS AND ELECTRONICS IN AGRICULTURE, v. 130, p. 13-19, . Citações Web of Science: 7. (15/01587-0)

LAMAS, LEONARDO; DREZNER, RENE; OTRANTO, GUILHERME; BARRERA, JUNIOR. Analytic method for evaluating players' decisions in team sports: Applications to the soccer goalkeeper. PLoS One, v. 13, n. 2, . Citações Web of Science: 1. (15/01587-0)

YANCY-CABALLERO, DAISON; LING, LIU Y.; ARCHILHA, NATHALY L.; FERREIRA, JOAO E.; DRIEMEIER, CARLOS. Mineral Particles in Sugar Cane Bagasse: Localization and Morphometry Using Microtomography Analysis. ENERGY & FUELS, v. 31, n. 11, p. 12288-12296, . Citações Web of Science: 4. (17/01330-5, 15/01587-0)

VIDAL, MACIEL C.; SATO, JOAO R.; BALARDIN, JOANA B.; TAKAHASHI, DANIEL Y.; FUJITA, ANDRE. ANOCVA in R: A Software to Compare Clusters between Groups and Its Application to the Study of Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 11, . Citações Web of Science: 1. (15/01587-0, 13/03447-6, 13/10498-6, 14/09576-5, 16/13422-9)

FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; TAHIRA, ANA CAROLINA; SIMOES, SERGIO NERY; BRENTANI, HELENA; MARTINS, JR., DAVID CORREA. Assessment of complementarity of WGCNA and NERI results for identification of modules associated to schizophrenia spectrum disorders. PLoS One, v. 14, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (11/04956-6, 11/50761-2, 14/00041-1, 14/10488-3, 15/01587-0)

YANCY-CABALLERO, DAISON; LING, LIU Y.; FUJITA, ANDRE; FERREIRA, JOAO E.; DRIEMEIER, CARLOS. Intraparticle Connectivity in Sugarcane Bagasse Unveiled by Pore Network Modeling. BioEnergy Research, v. 12, n. 3, p. 546-557, . Citações Web of Science: 0. (17/01330-5, 15/01587-0)

SANCHES, GUILHERME M.; GRAZIANO MAGALHAES, PAULO S.; DOS SANTOS LUCIANO, ANA C.; CAMARGO, LIVIA A.; FRANCO, HENRIQUE C. J.. Comprehensive assessment of spatial soil variability related to topographic parameters in sugarcane fields. Geoderma, v. 362, . Citações Web of Science: 0. (13/50942-2, 18/10225-3, 08/09265-9, 14/14965-0, 15/01587-0)

ESTRELA, GUSTAVO; GUBITOSO, MARCO DIMAS; FERREIRA, CARLOS EDUARDO; BARRERA, JUNIOR; REIS, MARCELO S.. An Efficient, Parallelized Algorithm for Optimal Conditional Entropy-Based Feature Selection. Entropy, v. 22, n. 4, . Citações Web of Science: 0. (16/25959-7, 13/07467-1, 15/01587-0)

RODRIGUES, FRANCISCO C. M.; ESPADOTO, MATEUS; HIRATA JR, ROBERTO; TELEA, ALEXANDRU C.. Constructing and Visualizing High-Quality Classifier Decision Boundary Maps dagger. INFORMATION, v. 10, n. 9, . Citações Web of Science: 0. (15/22308-2, 15/24485-9, 15/01587-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OIKAWA, Marcio Katsumi. Integração para dados e aplicações em Biologia Molecular Computacional.  100 f. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Matemática e Estatística.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (00/10062-3

BRAGHETTO, Kelly Rosa. Técnicas de modelagem para a análise de desempenho de processos de negócio. Tese (Doutorado) -  Instituto de Matemática e Estatística.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (07/51616-0

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