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Impactos da localização genômica no comportamento evolutivo das sequências repetitivas in tandem

Processo: 18/09760-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2018
Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Convênio/Acordo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Mateus Mondin
Beneficiário:Gabriel Fernando da Silva
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):DNA satélite   Milho   Heterocromatina

Resumo

DNA satélites são sequências altamente repetitivas in tandem que estão localizadas em grandes blocos no genoma. As bases nucleotídicas destas sequências possuem alta taxa de mutação, que são controlados por mecanismos evolutivos específicos conhecidos como Molecular Drive (Evolução em Concerto). Ainda não há estudos que tenham abordado o efeito da localização genômica dos DNA satélites sobre sua diversidade e padrão de homogeneização. O milho possui em seu genoma pelo menos quatro grande famílias de satDNAs: CentC, Cent4, TR-1 e 180-bp, sendo que os dois primeiros estão localizados na região centromérica e os demais nas regiões de heterocromatinas denominadas de knobs. A comparação entre os padrões evolutivos entre estas famílias de satDNAs ocupando posições tão distintas do genoma e com clara distinção de funções, é fundamental para se entender como os mecanismos da evolução em concerto atuam. Assim sendo, o objetivo deste trabalho é compreender o comportamento evolutivo em concerto e a diversidade das famílias de DNA satélite do genoma do milho localizado em diferentes regiões da heterocromatina.