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Busca de potenciais produtores de peptídeos não ribossômicos (NRPS) na compostagem da Fundação Parque Zoológico de São Paulo, utilizando iChip e Prism

Processo: 17/08038-8
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de junho de 2017
Vigência (Término): 31 de maio de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
Pesquisador responsável:Luiz Juliano Neto
Beneficiário:Luciana Teresa Dias Cappelini
Supervisor no Exterior: Neil Kelleher
Instituição-sede: Instituto Nacional de Farmacologia (INFAR). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa : Northwestern University, Evanston, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:14/07037-0 - Avaliação química, bioquímica e proteogenômica do processo de compostagem na Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP), BP.PD
Assunto(s):Metabolômica   Produtos naturais   Genômica   Proteômica

Resumo

Novas alternativas para o descarte dos resíduos orgânicos gerados por nossa sociedade são sempre necessárias, a Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP) utiliza os resíduos orgânicos gerados diariamente no parque para produção de compostagem, que posteriormente é utilizada nas dependências do ZOO e também na Unidade de Produção Rural (UPR) onde é obtido grande parte dos alimentos consumidos pelos animais. A compostagem é resultado da digestão da matéria orgânica pela ação da macro e mesofauna e de diferentes comunidades de microrganismos disponibilizando assim para as plantas as formas absorvíveis de nutrientes que as mesmas necessitam. Além da compostagem, temos também a geração de chorume, um líquido orgânico gerado a partir da água do resfriamento das composteiras, ainda pouco explorado nas condições da FPZSP.Com isso objetivo de buscar novas alternativas para explorar as caracteristicas da compostagem, pois o estágio dará oportunidade a aluna aprender as técnicas de identificação de peptídeos não ribossômicos utilizando genômica, proteômica e metabolômica em conjunto com o uso de LC-MS / MS, técnicas essas já fundamentadas no laboratório do professor Kelleher. O treinamento permitirá que moléculas de interesse, como antibióticos, sejam buscadas na compostagem e no chorume da FPZSP. Para isso, os microrganismos dessas matrizes serão isolados usando o iChip, dispositivo que permite o cultivo de organismos ainda não identificados em seu próprio habitat. A iChip já foi aplicada no chorume da FPZSP e mostrou-se promissora no isolamento de microorganismos.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NAVARRO-MUNOZ, JORGE C.; SELEM-MOJICA, NELLY; MULLOWNEY, MICHAEL W.; KAUTSAR, SATRIA A.; TRYON, JAMES H.; PARKINSON, I, ELIZABETH; DE LOS SANTOS, EMMANUEL L. C.; YEONG, MARLEY; CRUZ-MORALES, PABLO; ABUBUCKER, SAHAR; ROETERS, ARNE; LOKHORST, WOUTER; FERNANDEZ-GUERRA, ANTONIO; CAPPELINI, LUCIANA TERESA DIAS; GOERING, ANTHONY W.; THOMSON, REGAN J.; METCALF, WILLIAM W.; KELLEHER, NEIL L.; BARONA-GOMEZ, FRANCISCO; MEDEMA, MARNIX H. A computational framework to explore large-scale biosynthetic diversity. Nature Chemical Biology, v. 16, n. 1, p. 60+, JAN 2020. Citações Web of Science: 3.

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